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复旦大学附属眼耳鼻喉科医院杨婧艺获国家专利权

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龙图腾网获悉复旦大学附属眼耳鼻喉科医院申请的专利一种用于嗅神经母细胞瘤亚型分类的标志物及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119120699B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410941863.2,技术领域涉及:C12Q1/6886;该发明授权一种用于嗅神经母细胞瘤亚型分类的标志物及其应用是由杨婧艺;余洪猛;孙希才;宋小乐;史俊峰;周承乐设计研发完成,并于2024-07-15向国家知识产权局提交的专利申请。

一种用于嗅神经母细胞瘤亚型分类的标志物及其应用在说明书摘要公布了:本申请涉及疾病诊断领域,具体公开了一种用于嗅神经母细胞瘤亚型分类的标志物,所述标志物包括基底型标志物、神经型标志物和间充质型标志物。本申请所使用的分型基因表达谱来源于高精度的单细胞测序,具有较高的准确性及区分度,且可以投射到测序步骤相对简单、成本较低的普通转录组测序中得出分型结论,因此有利于在一定范围内验证并推广,有助于临床工作中对ONB患者进行分型,并根据各亚型分子特征,辅助相应的药物治疗选择。

本发明授权一种用于嗅神经母细胞瘤亚型分类的标志物及其应用在权利要求书中公布了:1.嗅神经母细胞瘤亚型分类标志物的检测试剂在制备嗅神经母细胞瘤亚型分类用产品中的应用,所述标志物包括基底型标志物、神经型标志物和间充质型标志物;所述基底型标志物包括以下基因:UBE2C、HMGB2、CENPF、NNAT、HIST1H4C、HIST1H1A、TUBA1B、PTTG1、TOP2A、NUSAP1、HIST1H1B、CCNB1、UBE2S、BIRC5、CKS1B、CKS2、TPX2、H2AFZ、PCP4、CDK1、MFAP4、MKI67、PBK、MAD2L1、HMGB1、CKAP2、CCNB2、SMC4、CENPW、HIST1H1D、UBE2T、CDKN3、ASPM、TUBA1C、TYMS、DLGAP5、PCLAF、PRC1、NUF2、ARL6IP1、TMPO、CDC20、KPNA2、HMGN2、DTYMK、HIST1H1E、HIST1H1C、MDK、HIST1H3B、H2AFX;所述神经型标志物包括以下基因:CRABP1、SCG5、PEG10、MAP1B、GNG8、CIB2、STMN2、PCSK1N、CHGB、RTN1、MIR7-3HG、SNRPN、EEF1A2、MEG3、GRP、SEC11C、NHLH1、KIF19、KCNK9、APMAP、TLCD3B、UNCX、CALB2、BEX1、IRX2、PEBP1、RGS10、CIRBP、VAMP2、FXYD3、KLHL35、MAP1LC3A、BEX2、NCAM1、GADD45B、NEUROD1、FXYD6、ATP6V0E2、C11orf96、CAMK2N1、C5orf38、CPE、RPS3、TMPRSS6、DUSP26、PDLIM1、STX1A、FABP6、KCTD17、SPOCK2;所述间充质型标志物包括以下基因:SLPI、S100A6、WFDC2、MT1X、MGP、CRYAB、S100A11、SAT1、CCN2、IGFBP7、VMO1、APOE、IER3、IGFBP5、S100A4、ANXA2、S100A10、VIM、MT2A、CD9、IFI27、LGALS1、LYPD2、TIMP1、IFITM3、ITGB1、LGALS3、CALD1、KRT18、SPARC、COL11A1、COL18A1、CEBPD、CSTB、CD59、APLP2、ID3、PTN、COL3A1、CCN1、KRT8、DST、TPM4、CYBA、ALDH1A1、CLU、IFITM2、CD63、TPM2、ZFP36L1;所述嗅神经母细胞瘤亚型包括基底型嗅神经母细胞瘤、神经型嗅神经母细胞瘤和间充质型嗅神经母细胞瘤,所述基底型嗅神经母细胞瘤亚群相对于神经型嗅神经母细胞瘤亚群和间充质型嗅神经母细胞瘤亚群高表达细胞增殖与细胞周期通路,所述神经型嗅神经母细胞瘤亚群具有神经发生和嗅觉传导的功能,所述间充质型嗅神经母细胞瘤亚群存在包括血管生成、上皮间充质转化、细胞外基质重塑、炎症反应和趋化因子分泌的细胞功能;所述检测试剂检测嗅神经母细胞瘤亚型包括以下步骤:提供待测样本目标标志物的测序信息,所述目标标志物为嗅神经母细胞瘤亚型分类标志物;基于待测样本目标标志物的测序信息,得到嗅神经母细胞瘤患者的基底型、神经型、间充质型肿瘤特征评分;基于所述特征评分,按照如下步骤进行嗅神经母细胞瘤亚型的判定:当标准化后基底型肿瘤特征评分≥0.3分时,判定嗅神经母细胞瘤为基底型;当标准化后基底型肿瘤特征评分0.3分,且标准化后神经型肿瘤特征评分≥0.15分时,判定嗅神经母细胞瘤为神经型;当标准化后基底型肿瘤特征评分0.3分,且神经型肿瘤特征评分0.15分,间充质型肿瘤特征评分0分时,判定嗅神经母细胞瘤为间充质型;所述测序信息包括单细胞RNA测序信息和或普通转录组RNA测序信息;所述待测样本为嗅神经母细胞瘤患者的肿瘤组织;所述基于待测样本目标标志物的测序信息,计算目标标志物的基因表达量,得到基因表达量的TranscriptsPerMillion、FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedfragments或ReadsPerKilobaseperMillionmappedreads归一化表达矩阵;进一步地,对TranscriptsPerMillion、FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedfragments或ReadsPerKilobaseperMillionmappedreads归一化表达矩阵中的每个嗅神经母细胞瘤病例个体统一质量,得到单个嗅神经母细胞瘤病例的基底型、神经型、间充质型肿瘤特征评分;使用R语言包“Seurat”的“CreateSeuratObject”函数,将TranscriptsPerMillion、FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedfragments或ReadsPerKilobaseperMillionmappedreads归一化表达矩阵转换为Seurat包运算的数据对象;和或,使用Seurat包的“AddModuleScore”函数,对普通转录组RNA测序信息TranscriptsPerMillion、FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedfragments或ReadsPerKilobaseperMillionmappedreads归一化表达矩阵中的每个嗅神经母细胞瘤病例个体统一赋分;和或,使用公式“NormalizedScore=x-minxmaxx-minx”对基底型、神经型、间充质型肿瘤特征评分分别进行标准化,使得离散分布的赋分值集中于0~1区间内。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人复旦大学附属眼耳鼻喉科医院,其通讯地址为:200031 上海市徐汇区汾阳路83号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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