上海交通大学医学院附属仁济医院杨朝勇获国家专利权
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龙图腾网获悉上海交通大学医学院附属仁济医院申请的专利基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114854839B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210367674.X,技术领域涉及:C12Q1/6874;该发明授权基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法是由杨朝勇;陈新;吴玲玲;曹姣设计研发完成,并于2022-04-08向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法在说明书摘要公布了:本发明公开了基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法,该方法包括通过多轮DNA连接反应对组织细胞中的DNA、RNA、蛋白质、染色质以及糖类等分析物进行XYZ三维空间编码,再通过测序技术解析相应的空间位置和生物学信息,进而实现组织的三维空间组学分析。本发明基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法具有操作方便、技术门槛低、成本低廉等优点,能够获取完整组织异质细胞的三维空间分布及相应的生物学信息表达,广泛应用于神经科学、病理学、组织发育等方向的研究。
本发明授权基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法在权利要求书中公布了:1.基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法,其特征在于:该方法通过多轮DNA连接反应间接或直接对组织中细胞的分析物进行三维空间编码,再通过测序得到对应组织中细胞的空间位置和生物学信息,实现组织的三维空间组学分析; 所述多轮DNA连接反应包括以下步骤: a提供L块基片,对基片的表面进行物理或化学修饰; b提供L种Z-DNA,其5’端修饰特定基团,与基片表面修饰基团连接;将L种Z-DNA分别连接到L块基片上; c将M种X-DNA与夹板寡核苷酸1退火杂交,沿X轴方向连接到Z-DNA的3’端,形成M行X-DNA条形码;将N种Y-DNA与夹板核苷酸2退火杂交,沿Y轴方向连接到X-DNA的3’端,形成N列Y-DNA条形码,由此产生L种M*N个的三维空间编码阵列;X-DNA和Y-DNA的5’端均带有磷酸基团; 其中,借助微流控芯片将X-DNA和Y-DNA添加到对应的位置;以及 Z-DNA包含空间条形码Z和两段恒定序列,所述两段恒定序列包括第一恒定序列和第二恒定序列,不同基片上Z-DNA的空间条形码Z不同,且第一恒定序列为PCR扩增接头,第二恒定序列与夹板寡核苷酸1的部分序列互补; X-DNA包含空间条形码X,每一行X-DNA的空间条形码X相同; X-DNA还包含两段恒定序列,第三恒定序列和第四恒定序列,第三恒定序列与夹板寡核苷酸1的部分序列互补,第四恒定序列与夹板寡核苷酸2的部分序列互补; Y-DNA包含空间条形码Y,每一列Y-DNA的空间条形码Y相同; 所述N种Y-DNA还包含独特的分子识别符、一段恒定序列以及捕获域,所述恒定序列与夹板寡核苷酸2的部分序列互补。
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