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南京工业大学刘冠楠获国家专利权

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龙图腾网获悉南京工业大学申请的专利一种基于交互注意力的HLA和抗原肽结合预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120280001B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510760195.8,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种基于交互注意力的HLA和抗原肽结合预测方法是由刘冠楠;陈子豪;吴明远;张恒;周宸熙;呼泽同;陈可;刘佳烨;潘慧菁设计研发完成,并于2025-06-09向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于交互注意力的HLA和抗原肽结合预测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于交互注意力的HLA和抗原肽结合预测方法,属于计算生物学技术领域。所示方法包括步骤1,采集HLA等位基因和独特肽段数据,构建HLA和抗原肽结合数据集;步骤2,构建HLA和抗原肽结合预测模型,使用所述HLA和抗原肽结合数据集对预测模型进行训练,获得训练后的预测模型;步骤3,将HLA序列和抗原肽序列输入预测模型,获得HLA和抗原肽结合的预测结果。该方法将基于序列和结构预测任务整合到统一模型中,分析预测pHLA关于序列和结构的潜力。这种双维度评估比现有方法提供了更全面的抗原免疫原性视角,为触发免疫反应的新抗原质量提供了新见解。

本发明授权一种基于交互注意力的HLA和抗原肽结合预测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于交互注意力的HLA和抗原肽结合预测方法,其特征在于,包括: 步骤1,采集HLA等位基因和独特肽段数据,构建HLA和抗原肽结合数据集; 步骤2,构建HLA和抗原肽结合预测模型,使用所述HLA和抗原肽结合数据集对预测模型进行训练,获得训练后的预测模型; 步骤3,将HLA序列和抗原肽序列输入预测模型,获得HLA和抗原肽结合的预测结果; 步骤2中的HLA和抗原肽结合预测模型包括序列嵌入模块、编码器、序列特征融合模块、结构预测模型、结构特征提取模块、结构序列特征融合模块和归一化层,所述序列嵌入模块,用于分别对HLA序列和抗原肽序列进行氨基酸嵌入与位置编码,获得HLA序列嵌入矩阵和抗原肽序列嵌入矩阵; 所述编码器,用于分别从HLA序列嵌入矩阵和抗原肽序列嵌入矩阵中提取HLA序列特征和抗原肽序列特征; 所述序列特征融合模块,用于对HLA序列特征和抗原肽序列特征进行序列特征融合,获得序列融合特征; 所述结构预测模型,用于根据HLA序列和抗原肽序列预测HLA结构、抗原肽结构和pHLA复合物的空间结构; 所述结构特征提取模块,用于从HLA结构、抗原肽结构和pHLA复合物的空间结构中提取包括界面面积、氢键数量、盐桥数量、质心间距离和相互作用能在内的结构特征; 所述结构序列特征融合模块,用于对序列融合特征和结构特征进行特征融合,获得结构序列融合特征; 所述归一化层,用于根据所述结构序列融合特征获得HLA和抗原肽结合预测概率; 所述序列嵌入模块分别对HLA序列和抗原肽序列进行氨基酸嵌入与位置编码,获得HLA序列嵌入矩阵和抗原肽序列嵌入矩阵包括: 记HLA序列包括M1个氨基酸,将HLA序列中的每个氨基酸通过字符嵌入层映射为M维向量,;对每个氨基酸位置施加正弦余弦位置编码;氨基酸嵌入与位置编码相加获得HLA序列嵌入矩阵,最终每个HLA序列表示为矩阵; 记抗原肽序列最多包括M2个氨基酸,;将抗原肽序列经填充至最大长度M2以统一变长输入,每个氨基酸同样映射为M维嵌入并添加位置编码,经此处理后,每个抗原肽序列表示为嵌入矩阵。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人南京工业大学,其通讯地址为:210009 江苏省南京市鼓楼区新模范马路5号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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