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龙图腾网获悉合肥综合性国家科学中心人工智能研究院(安徽省人工智能实验室)申请的专利一种用于多轮次空间转录组成像的探针设计方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120220832B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-26发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510695492.9，技术领域涉及：G16B50/30；该发明授权一种用于多轮次空间转录组成像的探针设计方法及系统是由方明昊;戴大海;项泉智;沈业欣设计研发完成，并于2025-05-28向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种用于多轮次空间转录组成像的探针设计方法及系统在说明书摘要公布了：本发明公开了一种用于多轮次空间转录组成像的探针设计方法及系统，涉及生物信息学技术领域，包括：构建检索数据库；从已知RNA序列中遍历获取同一基因所有的isoform的靶向区段并预处理，将所得到的候选探针序列分成两段进行额外的非特异性检测，得到所有isoform的靶向探针序列，再根据检索数据库中所有表达矩阵筛选得到靶向区域探针；通过随机ATCG生成多条随机序列并预处理，据以设计非靶向区域探针；从检索数据库获取单细胞表达矩阵，基于模拟退火算法优化给定基因集在不同成像轮次间的细胞类型层面表达量方差最小，得到基因编码本；该探针设计方法及系统，对于探针整体的捕获效率有一定的提升同时兼容多种编码策略。

本发明授权一种用于多轮次空间转录组成像的探针设计方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种用于多轮次空间转录组成像的探针设计方法，其特征在于，包括： 从GEO数据库中下载原始fastq数据并预处理得到isoform和基因的表达矩阵，兼顾单细胞表达矩阵，据以构建bulkRNA和scRNA的检索数据库； 设计靶向区域探针：从已知RNA序列中遍历获取同一基因所有isoform的靶向区段并预处理，将所得到的候选探针序列分成两段进行额外的非特异性检测，得到所有isoform的靶向探针序列，再根据检索数据库中所有的表达矩阵筛选得到靶向区域探针； 设计非靶向区域探针：通过随机ATCG生成多条随机序列并预处理，据以设计非靶向区域探针； 基因编码本优化：从检索数据库中获得给定基因集在设定物种组织中的bulkRNA的千碱基每百万测序数表达量和scRNA细胞类型层面平均原始计数的表达量；表达水平超过表达上限阈值和表达水平低于表达下限阈值的基因均不允许加入编码轮次，筛选得到基因集用于进行编码本设计并后续进行编码成像实验；设置编码轮次数目以及编码成像基因个数，对筛选后基因集在轮次通道间的分布进行迭代优化；在每一迭代中，从四种交换策略中随机选择一种对筛选后基因集分布处理；若基因集分布在采用交换策略后的方差小于交换前的方差则进入下一轮次，其中方差为该基因集分布下对每个轮次高亮的不同基因组合根据scRNA细胞类型层面的表达量矩阵计算总数，再计算每个轮次间的该总数的平均方差；若采用交换策略后的方差大于交换前的方差，则通过随机生成数值判断是否小于，其中，为交换策略前后方差差值，为退火的温度，随着迭代次数进行衰减；若小于则进入下一轮次，反之则重新选择交换策略直至满足迭代要求； 基因空间展示：利用靶向区域探针、非靶向区域探针和基因编码本进行多轮次空间转录组成像，得到根据基因编码本解码后的基因空间展示。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人合肥综合性国家科学中心人工智能研究院(安徽省人工智能实验室)，其通讯地址为：230000 安徽省合肥市高新区望江西路5089号,中国科学技术大学先进技术研究院未来中心B1205-B1208；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。