清华珠三角研究院;赛业(广州)生物科技有限公司陈沛逸获国家专利权
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龙图腾网获悉清华珠三角研究院;赛业(广州)生物科技有限公司申请的专利一种AAV衣壳蛋白的设计方法、系统、装置及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117153255B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-29发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311087025.5,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权一种AAV衣壳蛋白的设计方法、系统、装置及存储介质是由陈沛逸;刘华清;周淑仙设计研发完成,并于2023-08-25向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种AAV衣壳蛋白的设计方法、系统、装置及存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种AAV衣壳蛋白的设计方法、系统、装置及存储介质,包括:根据预设温度设定初始温度,初始温度表征初始AAV序列各个位置的突变可能性;根据当前AAV衣壳蛋白序列的靶向性分数和产量分数的提升率之和、多样性分数及预设最大降温速率确定降温速率;根据初始温度和降温速率确定当前温度,根据目标函数选取当前温度下第一预设数量的AAV衣壳蛋白序列继续进行降温优化,直至达到预设指标要求,停止降温搜索;从所有满足预设指标要求的AAV衣壳蛋白序列中选取第二预设数量的AAV衣壳蛋白序列进行聚类,以确定最终设计的AAV衣壳蛋白序列。本发明实施例能够减少陷于局部最优解,提高AAV衣壳蛋白的靶向性和产量,可广泛应用于生物信息技术领域。
本发明授权一种AAV衣壳蛋白的设计方法、系统、装置及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种AAV衣壳蛋白的设计方法,其特征在于,包括: 随机初始化待优化的AAV衣壳蛋白序列,根据预设温度设定初始温度,初始温度表征初始AAV序列各个位置的突变可能性; 根据当前AAV衣壳蛋白序列的靶向性分数和产量分数相比野生型AAV衣壳蛋白序列的提升率之和、当前AAV衣壳蛋白序列的多样性分数及预设最大降温速率确定降温速率; 根据上一时刻温度和降温速率确定当前温度,根据目标函数选取当前温度下第一预设数量的AAV衣壳蛋白序列,继续进行降温优化,直至当前温度下的AAV衣壳蛋白序列达到预设指标要求,停止降温搜索;所述目标函数包括靶向性分数、产量分数和多样性分数; 从所有满足预设指标要求的AAV衣壳蛋白序列中选取第二预设数量的待定AAV衣壳蛋白序列,将待定AAV衣壳蛋白序列进行序列聚类,从每类序列中选取第三预设数量的AAV衣壳蛋白序列作为最终设计的AAV衣壳蛋白序列; AAV衣壳蛋白序列的多样性分数通过以下步骤获取: 获取批量的AAV衣壳蛋白序列,根据AAV衣壳蛋白序列之间的相似度和覆盖率对AAV衣壳蛋白序列进行聚类; 根据每类AAV衣壳蛋白序列中类总数量确定该类AAV衣壳蛋白序列的多样性分数; AAV衣壳蛋白序列的多样性分数通过以下公式计算得到: 根据当前AAV衣壳蛋白序列的靶向性分数和产量分数相比野生型AAV衣壳蛋白序列的提升率之和、当前AAV衣壳蛋白序列的多样性分数及预设最大降温速率确定降温速率,具体包括: 根据当前AAV衣壳蛋白序列的靶向性分数与野生型AAV衣壳蛋白序列的靶向性分数确定第一提升率; 根据当前AAV衣壳蛋白序列的产量分数与野生型AAV衣壳蛋白序列的产量分数确定第二提升率; 根据第一提升率和第二提升率确定平均值,计算1与平均值的差值与当前AAV衣壳蛋白序列的多样性分数的比值; 取比值与预设最大降温速率概率中的较小值作为降温速率。
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