上海交通大学;上海迪赢生物科技有限公司师咏勇获国家专利权
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龙图腾网获悉上海交通大学;上海迪赢生物科技有限公司申请的专利基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115386965B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-08-29发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211046021.8,技术领域涉及:C40B50/06;该发明授权基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用是由师咏勇;张满仓;陈建;陈兴华设计研发完成,并于2022-08-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用在说明书摘要公布了:本发明公开了基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用。本发明基于3D喷墨原位DNA合成技术利用空间交错编码策略制作高分辨率的大尺度空间多组学芯片,进而使用空间原位捕获策略对组织切片进行高通量的原位转录组分析、原位表观组分析、原位非编码RNA分析和原位蛋白组分析;实现了单细胞分辨率、大尺度空间覆盖,同时兼顾高的基因数目检出率;可用于器官或组织的三维全覆盖精确转录图谱或时空图谱构建。
本发明授权基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用在权利要求书中公布了:1.一种基于空间交错编码多组学芯片的原位制备方法,包括如下步骤: 1)将基底用水虎鱼溶液进行表面处理然后等离子清洗,得到预处理的基底; 2)将所述预处理的基底用亲水性硅烷和疏水性硅烷的混合液浸泡,然后进行蒸镀或CVD表面处理;再依次加入Spacer试剂、Unylinker分子处理,得到表面处理的功能图案化芯片; 3)在所述表面处理的功能图案化芯片上通过高通量原位喷墨打印合成平台合成用于空间多组学分析的序列,得到空间转录组芯片; 所述表面处理的功能图案化芯片上包含三类Spot区域,分别为1区Spot、2区Spot和3区Spot; 所述2区定义为两个相邻圆形像素点交集部分,所述3区定义为三个相邻圆形交集的区域,所述1区定义为剩余未交集部分; 所述1区的空间坐标条形码的长度为n,则所述2区的空间坐标条形码长度为2n,所述3区的空间坐标条形码长度为3n,n为碱基数; 步骤3)中包括打开控制电脑将所述高通量原位喷墨打印合成平台中将如下合成序列输入高通量DNA合成控制软件: 每个所述Spot区域的序列从3端到5端依次为通用序列、空间编码序列、分子标签序列和搭桥序列; 在整个所述表面处理的功能图案化芯片上,所有Spot序列中通用序列、分子标签序列和搭桥序列均相同,采用FlowCell部件进行通用合成; 每个所述Spot区域的序列包含一个唯一的空间编码序列,所述空间编码序列部分的合成由压电喷墨打印嵌套合成策略进行合成; 4)将所述空间转录组芯片经过氨解脱去保护碱基处理后,得到蜂窝状全覆盖空间转录组芯片; 5)将所述蜂窝状全覆盖空间转录组芯片进行CaptureOligo杂交反应; 6)将和步骤5)中经探针转换的芯片利用无5’-3’外切酶活性、无3’-5’外切酶活性和无链置换活性的聚合酶和连接酶进行探针延伸和连接; 7)将经步骤6)处理的芯片清洗,即得到基于空间交错编码空间多组学芯片。
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