吉林大学赵文晋获国家专利权
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龙图腾网获悉吉林大学申请的专利一种5-羟色胺再摄取抑制剂优控清单智能构建方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116705143B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310783697.3,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权一种5-羟色胺再摄取抑制剂优控清单智能构建方法是由赵文晋;孙佩萱;刘怀湜;郝宁;姚天赋;崔晰然设计研发完成,并于2023-06-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种5-羟色胺再摄取抑制剂优控清单智能构建方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种5‑羟色胺再摄取抑制剂优控清单智能构建方法,通过同源建模方法构建5‑羟色胺再摄取抑制剂功能性受体蛋白,基于有害结局通路方法筛选其人体健康干扰性关键蛋白,并计算其与受体蛋白之间结合能,采用信息量权重法进一步计算综合效应值作为因变量,基于方差过滤耦合皮尔逊相关性系数方法筛选目标的主要特征作为自变量,实现数据集的建立,通过1D‑CNN神经网络耦合GRU神经网络,实现了5‑羟色胺再摄取抑制剂优控清单的智能构建。本发明目的在于,可以克服当前传统方法无法对5‑羟色胺再摄取抑制剂功能性与人体健康干扰综合选择效应进行综合评估,通过建立深度学习模型,实现了高优先级5‑羟色胺再摄取抑制剂优控清单的智能化构建。
本发明授权一种5-羟色胺再摄取抑制剂优控清单智能构建方法在权利要求书中公布了:1.一种5-羟色胺再摄取抑制剂优控清单智能构建方法,其特征在于,包括如下步骤: 1)、确定5-羟色胺再摄取抑制剂药物种类与分子结构,采用同源建模方法分别构建药效性受体蛋白SERT及其双突变耐药性受体蛋白结构I425V-T276D-SERT的氨基酸序列,即功能性蛋白结构; 2)、基于Reactome数据库,采用有害结局通路方法构建5-羟色胺再摄取抑制剂人体健康干扰性通路,筛选嗅觉毒性、神经毒性传导以及肠道微生物的肠脑轴正反馈调节的关键受体蛋白,并采用分子动力学方法计算5-羟色胺再摄取抑制剂分子与关键受体蛋白之间的结合自由能,对其进行归一化处理,在此基础上采用信息权重法计算综合效应值; 3)、采用Gaussian09与Chembiodraw12.0软件计算5-羟色胺再摄取抑制剂的分子特征,并基于方差过滤耦合的皮尔逊相关性方法计算分子特征间的线性相关性,并选取相关性合理的10种主要的分子特征; 4)、将5-羟色胺再摄取抑制剂分子10种主要的分子特征作为自变量,其功能性与人体健康干扰性综合效应值作为因变量,构建神经网络学习的数据集; 5)、采用K折交叉的方式将数据集划分为训练集和测试集,并对迭代次数,折数,损失函数等超参数进行定义; 6)、通过四层1D-CNN神经网络,并配合上GELU激活函数及归一化层,实现对数据的扩张与收缩,从而对影响较大的特征进行放大,最后经过GRU神经网络,并通过损失函数进行反向传播; 7)、通过测试集对训练结果进行验证预测,若满足要求,则输出训练好的神经网络,实现对5-羟色胺再摄取抑制剂优控清单的智能预测及构建; 其中步骤2)中,结合自由能的计算公式为: (1) 式中,是范德华力,是静电力,是极性溶剂化能,是SASA能; 在归一化处理过程中,以耐药性、嗅觉毒性与神经毒性关键蛋白结合能为正向指标,而药效性与肠道微生物干扰性关键蛋白结合能为逆向指标,归一化公式为: 正向指标:(2) 逆向指标:(3) 式中,i表示5-羟色胺再摄取抑制剂分子,i=1,2,...,17,j表示关键受体蛋白,j=1,2,...,9,Zij +表示5-羟色胺再摄取抑制剂的耐药性、嗅觉毒性或神经毒性归一化后的正向指标,Zij -表示5-羟色胺再摄取抑制剂的药效性或肠道微生物干扰性归一化后的逆向指标,Xij表示第i个分子与第j个蛋白的结合能数值; 其中步骤3)中,皮尔逊相关性系数可衡量两个随机变量之间的线性相关性,计算公式为: (4) 式中,cov(a,b)表示5-羟色胺再摄取抑制剂的分子特征a与b数值的协方差,σa与σb分别表示5-羟色胺再摄取抑制剂分子特征a与b数值的标准差,E表示数学期望; 步骤5)中,损失函数定义为: (5) 式中,ym表示当前分子的效应值,pm表示当前分子的预测值,m代表需要预测的分子个数,通过求取绝对值后进行累加,可以有效保证每一个分子预测的准确性; 步骤6)中,首先通过一层1D-CNN神经网络以及GELU和归一化层,实现数据的扩张,再通过一层1D-CNN神经网络实现对数据的收缩,往复经历这个过程,最后通过GRU神经网络实现效应值的预测; 通过计算损失函数,实现反向传播,达到对5-羟色胺再摄取抑制剂分子效应值进行准确智能预测的目的。
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