重庆邮电大学袁帅获国家专利权
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龙图腾网获悉重庆邮电大学申请的专利一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115954044B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310030291.8,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法是由袁帅;杨国莉;张文英;黄佳铭;卢洪;周俊鹏设计研发完成,并于2023-01-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法,属于超声扰动领域。在分子动力学模拟中,通过对边界施加超声函数实现超声扰动,根据X轴的水密度验证超声成功加载;并建立通过细胞膜厚度、脂质蛋白质相互作用多角度阐释超声对细胞膜的影响,进一步研究细胞膜对蛋白质的影响的分析方法,得到超声对Piezo1结构的影响。本发明首次采用超声波加载粗粒化分子动力学模拟的方法来研究Piezo1机械敏感离子通道的构象变化,对未来超声治疗、声遗传学应用等领域提供重要的研究思路。
本发明授权一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法在权利要求书中公布了:1.一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤一,建立超声波模型,并将其耦合到Gromacs软件中; 所述超声波模型为建立6个大小相同、方向不同的超声波速度,速度产生于立体盒子六个面的边缘,每个面的速度产生有一定的时间间隔; 所述6个超声波速度定义如下: Vi表示分别沿着X、Y、Z正负方向的六个超声波速度,Vmax表示超声脉冲的最大速度,m表示时间步长,N表示分子动力学模拟步长,i作为下标表示六个超声波速度方向中的其中一个,X0表示X坐标,Y0表示Y坐标,Z0分别表示Z坐标; 步骤二,对蛋白质缺失氨基酸进行补全,并且将其粗粒化后插入到细胞膜中,使用步骤一所述超声波模型进行分子动力学模拟分析; 所述分子动力学模拟分析包括: 观察分析细胞膜的形态变化,包括膜厚度和膜面积的变化; 分析膜成分和蛋白质的相互作用时间; 分析蛋白质构象的变化,在超声扰动下细胞变化引起了膜成分和蛋白质的相互作用进一步引起了导致构象的变化。
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