复旦大学附属中山医院张世龙获国家专利权
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龙图腾网获悉复旦大学附属中山医院申请的专利基于多组学特征的结直肠癌中免疫相关微生物的识别方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115472214B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211313242.7,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权基于多组学特征的结直肠癌中免疫相关微生物的识别方法是由张世龙;张争艳;程莉莎;刘天舒设计研发完成,并于2022-10-25向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于多组学特征的结直肠癌中免疫相关微生物的识别方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于多组学特征的结直肠癌中免疫相关微生物的识别方法,属于生物医药技术领域。方法包括结直肠癌患者与健康组的肠道菌群多样性和组成的分析;通过LASSO算法,识别与患者显著相关的肠道微生物;通过采用SVM‑RFE方法选择结直肠癌的特征肠道微生物;获得两种算法之间的重叠基因,将重叠基因纳入ROC和DCA分析验证;方法包括免疫调控关键微生物的筛选、免疫相关肠道微生物功能预测分析、免疫相关微生物与免疫微环境分析和免疫相关肠道微生物作用机制预测;通过本发明方法可筛选出结直肠癌中具有免疫调控作用的关键微生物,为研究肠道菌群的作用机制、制定个体化的精准用药方案奠定基础。
本发明授权基于多组学特征的结直肠癌中免疫相关微生物的识别方法在权利要求书中公布了:1.一种基于多组学特征识别结直肠癌中免疫相关肠道微生物的方法,其特征在于,包括结直肠癌患者与健康对照组的肠道菌群多样性和组成的分析;通过LASSO回归算法,识别与结直肠癌患者显著相关的肠道微生物;通过采用SVM-RFE方法选择结直肠癌的特征肠道微生物;获得两种算法之间的重叠肠道微生物,将重叠肠道微生物纳入ROC和DCA分析验证;采用差异丰度肠道微生物的筛选方法、WGCNA方法和或肠道微生物互作网络分析法筛选免疫调控相关关键肠道微生物;预测分析免疫相关肠道微生物的生物学功能、分析免疫相关肠道微生物与免疫微环境和预测免疫相关肠道微生物作用机制; 所述WGCNA方法包括对结直肠癌患者样本进行聚类分析,剔除样本中的离群样本;采用肠道微生物的丰度数据,计算肠道微生物与肠道微生物之间的相关系数,构建肠道微生物共表达的相关性矩阵;通过选择软阈值参数β,使相关性矩阵转换为邻接矩阵,再将邻接矩阵转换为拓扑重叠矩阵,对肠道微生物进行模块划分,具有相同功能的肠道微生物被划分到一个模块中;将样本表型数据和肠道微生物模块特征值进行关联,构建肠道微生物模块-性状相关性热图,获得与样本表型性状高度相关的显著肠道微生物模块和hubs肠道微生物。
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