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龙图腾网获悉华中科技大学申请的专利一种预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115171791B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-03发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202210700281.6，技术领域涉及：G16B40/20；该发明授权一种预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质的方法是由薛宇;韩诚;彭迪;宁万山设计研发完成，并于2022-06-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质的方法在说明书摘要公布了：本发明属于生物信息技术领域，公开了一种预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质的方法，包括步骤：S1：对饥饿诱导处理前后的正常样本、敲除基因样本及质粒回补样本，进行时序转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析；S2：筛选存在相互作用的基因，记为集合A；S3：提取集合A中的每个基因的转录表达变化、蛋白质表达变化、磷酸化蛋白质表达变化、以及基因所对应的蛋白质序列组成，作为特征；S4：建立并训练预测模型；S5：优化模型，并对基因进行打分，预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质。利用本发明中的方法，能够在传统实验方法验证之前，预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质，有效缩小筛选范围，减少实验验证的工作量。

本发明授权一种预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质的方法在权利要求书中公布了：1.一种预测调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质的方法，其特征在于，包括以下步骤： S1：根据预先选定的自噬关键调控基因，对饥饿诱导处理前后的正常酵母样本，敲除该自噬关键调控基因的变异酵母样本，以及利用质粒回补该自噬关键调控基因的变异酵母样本分别进行时序转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析，获取饥饿诱导处理前后的酵母样本的基因表达数据、蛋白质表达数据和磷酸化蛋白质表达数据； S2：根据预先选定的蛋白质相互作用数据库，从中筛选出与所述自噬关键调控基因存在相互作用的基因，记为集合A；根据预先选定的自噬基因数据库，标记所述集合A中已知自噬功能的已知自噬基因，记为集合B，所述集合B为所述集合A的子集；同时，根据预先收集的自噬基因与磷酸化底物的对应关系，标记所述集合A中已知磷酸化底物的自噬基因，记为集合C，所述集合C同样为所述集合A的子集； S3：提取所述集合A中的每个基因在所述自噬关键调控基因敲除前后，以及利用质粒回补自噬关键调控基因的转录表达变化、蛋白质表达变化、磷酸化蛋白质表达变化，以及基因所对应的蛋白质序列组成，作为所述集合A中的每个基因的四类特征； S4：建立预测模型，基于所述步骤S3中确定的四类特征，利用深度学习算法，以所述集合B中的基因对应训练用阳性数据集，以所述集合A且排除所述集合B中的基因对应训练用阴性数据集，对所述预测模型进行训练； S5：通过迁移学习的方法，对所述步骤S4得到的训练后的预测模型，以所述集合C中的基因对应训练用阳性数据集，以所述集合A且排除所述集合C中的基因对应训练用阴性数据集进行优化，通过元学习的方法对阳性数据集进行数据增强，以得到最终预测模型；接着，利用所述最终预测模型对所述集合A中的基因进行打分，得分满足预先设定要求的基因，其对应编码得到的蛋白质，即被预测为调控酵母自噬的激酶特异性底物蛋白质。

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