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中国科学院计算技术研究所陈镇霖获国家专利权

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龙图腾网获悉中国科学院计算技术研究所申请的专利一种可断裂交联肽段鉴定方法、鉴定结果评估筛选方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114049915B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111437089.4,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种可断裂交联肽段鉴定方法、鉴定结果评估筛选方法是由陈镇霖;毛鹏志;谭永卿;迟浩;贺思敏设计研发完成,并于2021-11-30向国家知识产权局提交的专利申请。

一种可断裂交联肽段鉴定方法、鉴定结果评估筛选方法在说明书摘要公布了:本发明提供一种可断裂交联肽段鉴定方法,针对可断裂交联肽段的每一张二级谱图,所述方法包括如下步骤:S1、提取谱图中质量差为交联剂对应固定质量差的特征双峰,以特征双峰对应的质量为α肽段质量,基于可断裂交联肽段对应的母离子质量获取与α肽段质量互补的β肽段质量得到α肽段质量和β肽段质量组成的候选质量对;其中,所述母离子质量通过可断裂交联肽段的一级谱图校准获得;S2、根据步骤S1得到的候选质量对,分别以候选质量对中的α肽段质量和β肽段质量为依据,从蛋白质数据库中筛选出多条分别与α肽段质量和β肽段质量相等的候选肽段,并将α肽段质量的所有候选肽段与β肽段质量的所有候选肽段分别组成成对的候选交联肽段形成候选交联肽段集合,根据预设的碎片离子对候选交联肽段集合中的交联肽段进行匹配打分,选取其中打分最高的交联肽段。

本发明授权一种可断裂交联肽段鉴定方法、鉴定结果评估筛选方法在权利要求书中公布了:1.一种可断裂交联肽段鉴定方法,其特征在于,针对可断裂交联肽段的每一张二级谱图,所述方法包括如下步骤: S1、提取谱图中质量差为交联剂对应固定质量差的特征双峰,以特征双峰对应的质量为α肽段质量,基于可断裂交联肽段对应的母离子质量获取与α肽段质量互补的β肽段质量得到α肽段质量和β肽段质量组成的候选质量对;其中,所述母离子质量通过可断裂交联肽段的一级谱图校准获得;其中,所述步骤S1包括: S11、提取谱图中的所有质量差为交联剂对应固定质量差的非冗余特征双峰,以每组非冗余特征双峰对应的质量为一个α肽段质量;其中,所述步骤S11中包括: S111、枚举谱图中每根峰的电荷并依据谱图中的质荷比获得每种电荷下每根峰对应的质量,并筛选出质量差为交联剂对应固定质量差的所有特征双峰; S112、将质量相等的特征双峰合并获得非冗余特征双峰; S12、针对每组非冗余特征双峰,以待鉴定的交联肽段对应的母离子质量与当前α肽段质量差获得当前α肽段的互补β肽段质量,并根据互补β肽段的质量查询其在谱图中是否有对应特征双峰,以存在对应特征双峰的互补β肽段质量与当前α肽段质量组成初始质量对; S13、以预先训练好的过滤模型对所有初始质量对进行过滤以剔除概率打分低于预设概率阈值的不可信质量对后获得候选质量对;其中,所述过滤模型是通过对逻辑回归模型采用如下方式训练获得的: 获取谱图数据集,并标注集中每一张谱图的正确质量对; 采用步骤S11、S12提取谱图数据集中每一张谱图的质量对并筛选出其中的错误质量对; 以包含有正确质量对和错误质量对的谱图组成训练数据集; 采用训练数据集将逻辑回归模型训练至收敛; S2、根据步骤S1得到的候选质量对,分别以候选质量对中的α肽段质量和β肽段质量为依据,从蛋白质数据库中筛选出多条分别与α肽段质量和β肽段质量相等的候选肽段,并将α肽段质量的所有候选肽段与β肽段质量的所有候选肽段分别组成成对的候选交联肽段形成候选交联肽段集合,根据预设的碎片离子对候选交联肽段集合中的交联肽段进行匹配打分,选取其中打分最高的交联肽段。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国科学院计算技术研究所,其通讯地址为:100190 北京市海淀区中关村科学院南路6号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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