济南迪杰信息技术有限公司王德才获国家专利权
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龙图腾网获悉济南迪杰信息技术有限公司申请的专利一种生物试剂功能预测方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119832988B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411904362.3,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种生物试剂功能预测方法及系统是由王德才;周艳;邹志燕;李小安;罗惠文设计研发完成,并于2024-12-23向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种生物试剂功能预测方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及生物功能预测技术领域,尤其涉及一种生物试剂功能预测方法及系统。所述方法包括以下步骤:对生物试剂公开数据库进行生物分子信息采集,以得到生物试剂生物分子信息集;对生物试剂生物分子信息集进行生物特征分析,得到生物试剂蛋白质序列比对特征、生物试剂分子结构域特征以及生物试剂特定分子功能域特征;构建生物试剂功能预测网络框架并进行功能预测模型训练构建,以生成生物试剂功能预测模型;获取待预测生物试剂分子特征并进行目标功能预测,以得到目标生物试剂功能预测结果;根据目标生物试剂功能预测结果进行功能验证优化,以生成目标生物试剂功能优化结果。本发明能够实现对生物试剂功能的有效预判与筛选。
本发明授权一种生物试剂功能预测方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种生物试剂功能预测方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤S1:对生物试剂公开数据库进行生物分子信息采集,以得到生物试剂生物分子信息集,其中生物试剂生物分子信息集包括生物试剂蛋白质序列数据、生物试剂分子结构域数据以及生物试剂分子功能域数据;其中,步骤S1包括以下步骤: 步骤S11:对生物试剂公开数据库进行生物试剂原始数据初步筛选,得到生物试剂原始生物信息集合; 步骤S12:对生物试剂原始生物信息集合进行蛋白质序列提取处理,得到生物试剂蛋白质序列数据,其中包括每个生物试剂对应的氨基酸分子序列以及基因分子序列; 步骤S13:对生物试剂蛋白质序列数据内对应的氨基酸分子序列以及基因分子序列进行分子结构域识别与标定提取处理,得到生物试剂分子结构域数据,其中包括每个生物试剂对应的二级结构域序列片段以及三级结构域序列片段;其中,步骤S13包括以下步骤: 步骤S131:对生物试剂蛋白质序列数据内对应的氨基酸分子序列以及基因分子序列进行分子结构域识别预判,以得到生物试剂氨基酸分子结构域区域序列以及生物试剂基因分子结构域区域序列; 步骤S132:通过生物试剂氨基酸分子结构域区域序列获取对应的氨基酸分子结构位点以及氨基酸分子交互作用力,并基于氨基酸分子结构位点以及氨基酸分子交互作用力对相对应的生物试剂氨基酸分子结构域区域序列进行序列结构疏水性评估分析,得到生物试剂氨基酸分子结构疏水性评分; 步骤S133:对生物试剂氨基酸分子结构域区域序列进行分子结构功能电荷分析,得到生物试剂氨基酸分子结构功能电荷特性,其中包括氨基酸分子结构电荷分布量、氨基酸分子结构功能电荷耦合度以及氨基酸分子结构电荷密度; 步骤S134:基于生物试剂氨基酸分子结构疏水性评分以及生物试剂氨基酸分子结构功能电荷特性利用蛋白质二级结构度量计算公式对相对应的生物试剂氨基酸分子结构域区域序列进行结构域度量计算,以得到氨基酸分子区域序列二级结构度;基于氨基酸分子区域序列二级结构度对相对应的生物试剂氨基酸分子结构域区域序列进行二级结构标定处理,得到生物试剂对应的二级结构域序列片段; 步骤S135:对生物试剂基因分子结构域区域序列进行分子三级结构推演分析,得到生物试剂对应的三级结构域序列片段;其中,步骤S135包括以下步骤: 对生物试剂基因分子结构域区域序列进行基因分子动力学模拟分析,生成生物试剂基因分子动力学模拟过程; 对生物试剂基因分子动力学模拟过程进行基因分子折叠路径推演,以生成生物试剂基因分子折叠推演路径图; 基于生物试剂基因分子折叠推演路径图对相对应的生物试剂基因分子结构域区域序列进行结构域折叠能量分布分析,得到生物试剂基因分子结构域折叠能量分布图; 通过生物试剂基因分子结构域折叠能量分布图获取对应的基因分子折叠能量稳定性评分以及基因分子折叠能量分布梯度,并基于基因分子折叠能量稳定性评分以及基因分子折叠能量分布梯度利用蛋白质三级结构匹配计算公式对相对应的生物试剂基因分子结构域区域序列进行匹配计算,以得到基因分子区域序列三级结构匹配度; 其中,蛋白质三级结构匹配计算公式具体为: ; 式中,为基因分子区域序列三级结构匹配度,为基因分子折叠空间范围,为基因分子折叠空间坐标,为在基因分子折叠空间坐标处的折叠能量哈密顿量,为基因分子折叠能量调整系数,为梯度符号,为在基因分子折叠空间坐标处的基因分子折叠能量稳定性评分,为基因分子折叠能量稳定影响参数,为基因分子折叠能量分布梯度,为折叠能量分布梯度影响系数,为基因分子区域序列三级结构匹配度的修正系数; 基于基因分子区域序列三级结构匹配度对相对应的生物试剂基因分子结构域区域序列进行三级结构标定处理,得到生物试剂对应的三级结构域序列片段; 步骤S14:对生物试剂分子结构域数据进行分子功能域注释解析处理,得到生物试剂分子功能域数据,其中包括每个生物试剂对应的酶催化活性、结合亲和力以及物质转运降解功能域片段; 步骤S15:将生物试剂蛋白质序列数据、生物试剂分子结构域数据以及生物试剂分子功能域数据进行数据整合,以得到生物试剂生物分子信息集; 步骤S2:对生物试剂蛋白质序列数据进行序列比对分析,以得到生物试剂蛋白质序列比对特征;对生物试剂分子结构域数据进行蛋白质结构特征预测分析,以生成生物试剂分子结构域特征;根据生物试剂分子功能域数据进行特定分子功能特征提取,得到生物试剂特定分子功能域特征; 步骤S3:构建生物试剂功能预测网络框架,并将生物试剂蛋白质序列比对特征、生物试剂分子结构域特征以及生物试剂特定分子功能域特征输入至生物试剂功能预测网络框架进行功能预测模型训练构建,以生成生物试剂功能预测模型;获取待预测生物试剂分子特征,并将待预测生物试剂分子特征输入至生物试剂功能预测模型进行目标功能预测,以得到目标生物试剂功能预测结果; 步骤S4:根据目标生物试剂功能预测结果对相对应的待预测生物试剂进行功能验证优化,以生成目标生物试剂功能优化结果。
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