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龙图腾网获悉广东工业大学申请的专利一种基于迭代计算图神经网络的蛋白质序列设计方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119049551B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-31发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202410979540.2，技术领域涉及：G16B25/30；该发明授权一种基于迭代计算图神经网络的蛋白质序列设计方法是由曾安;黎锦荣;潘丹;杨宝瑶;赵靖亮设计研发完成，并于2024-07-22向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于迭代计算图神经网络的蛋白质序列设计方法在说明书摘要公布了：本发明涉及生物信息技术领域，公开了一种基于迭代计算图神经网络的蛋白质序列设计方法，包括：获取蛋白质序列数据集，提取蛋白质序列的主链原子坐标，并在主链原子坐标末尾增加噪声；根据主链原子坐标设计虚拟原子并获取虚拟原子坐标；建立主链原子坐标和虚拟原子之间的距离特征，根据距离特征获得距离表征；构造主链原子之间的角度特征；根据角度特征获得节点特征的嵌入表达，根据距离表征获得边特征的嵌入表达；对标准氨基酸类型以及未知氨基酸进行编码处理；构建并训练迭代计算图神经网络；将节点特征的嵌入表达、边特征的嵌入表达和编码后的氨基酸序列输入训练好的迭代计算图神经网络，获得蛋白质序列。本发明能够提高生成蛋白序列的准确率。

本发明授权一种基于迭代计算图神经网络的蛋白质序列设计方法在权利要求书中公布了：1.一种基于迭代计算图神经网络的蛋白质序列设计方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤： 获取蛋白质序列数据集，将所述蛋白质序列数据集划分为训练集、验证集和测试集； 提取蛋白质序列的主链原子坐标，并在所述主链原子坐标末尾增加噪声； 根据所述主链原子坐标设计虚拟原子并获取虚拟原子坐标，所述虚拟原子坐标的数量与所述主链原子坐标的数量相同，且获取虚拟原子坐标具体方式如下： 其中，、、均为自定义的绝对值小于1的常数，、、为主链原子； 建立所述主链原子坐标和所述虚拟原子之间的距离特征，将所述距离特征输入到高斯径向函数中，获得距离表征； 构造主链原子之间的角度特征； 根据所述角度特征获得节点特征的嵌入表达，根据所述距离表征获得边特征的嵌入表达； 对构成蛋白质序列的标准氨基酸类型以及未知氨基酸进行编码处理，获得编码后的氨基酸序列； 使用所述训练集迭代训练构建的迭代计算图神经网络，每训练一次，使用所述验证集评估训练后的迭代计算图神经网络的生成准确率，准确率最高的迭代计算图神经网络为训练好的迭代计算图神经网络，使用所述测试集测试所述训练好的迭代计算图神经网络； 将所述节点特征的嵌入表达、所述边特征的嵌入表达和所述编码后的氨基酸序列输入到所述训练好的迭代计算图神经网络，采用顺序解码技术，图更新采用迭代计算边特征和节点特征之间的注意力的方式，获得蛋白质序列。

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