江南大学;山东金城生物药业有限公司刘龙获国家专利权
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龙图腾网获悉江南大学;山东金城生物药业有限公司申请的专利提高UDP糖基转移酶催化活性的改造方法及改造所得突变体获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120005846B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-31发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411970882.4,技术领域涉及:C12N9/10;该发明授权提高UDP糖基转移酶催化活性的改造方法及改造所得突变体是由刘龙;陈坚;王辉;马钦元;吕雪芹;堵国成;李江华;刘延峰;林家豪设计研发完成,并于2024-12-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本提高UDP糖基转移酶催化活性的改造方法及改造所得突变体在说明书摘要公布了:本发明涉及一种提高UDP糖基转移酶催化活性的改造方法及改造所得突变体,属于酶工程技术领域。本发明通过建立UDP糖基转移酶同源空间结构模型,对出发酶的限速区域进行切割,并对切割后的区域进行随机嵌合,得到嵌合酶序列空间,通过贪心算法在序列空间中确定信息量最大的初始序列,通过多轮迭代结合体外验证,得到具有最高酶活性的迭代序列作为最优酶核苷酸序列,该方法改造得到最优UDP糖基转移酶突变体催化活性为出发酶的2.26倍,能够应用于以莱鲍迪苷A为底物生产莱鲍迪苷D,在促进了莱鲍迪苷D工业化生产的同时,为酶的改造和高通量筛选提供了全新的方法和思路,在相关化合物生产领域展现出重要价值和广阔的应用前景。
本发明授权提高UDP糖基转移酶催化活性的改造方法及改造所得突变体在权利要求书中公布了:1.一种提高UDP糖基转移酶催化活性的改造方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤S1、将待改造UDP糖基转移酶作为出发序列,通过序列比较从数据库中获得所述待改造UDP糖基转移酶的同源结构,对所述出发序列和同源结构进行建模,获得UDP糖基转移酶同源空间结构模型; 步骤S2、根据UDP糖基转移酶同源空间结构模型确定切割位点,定义两个残基中的任何两个原子之间距离小于为一个接触,统计UDP糖基转移酶同源空间结构模型中接触超过50次或在超过50%模型中存在接触的残基对,计算所述残基对的相对丰度,评估残基对对于嵌合蛋白结构的破坏程度,选择破坏程度小的残基对作为切割位点,将所述出发序列分为多个区域,从出发序列或同源结构对应位置获取对应残基或肽段进行随机嵌合,得到嵌合酶的序列空间; 步骤S3、确定序列空间中信息量最大的20条序列作为初始序列,获得初始序列的酶催化活性; 步骤S4、基于初始序列的酶催化活性结果,训练高斯过程回归模型和高斯朴素贝叶斯分类器,利用训练好的模型预测序列的酶催化活性,并计算每个序列的上置信界,获得上置信界最高的10条迭代序列及所述迭代序列的酶催化活性; 步骤S5、重复步骤S4,直至达到预设迭代次数或迭代序列的酶催化活性不再提高,将具有最高酶催化活性的迭代序列作为最优酶核苷酸序列输出。
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