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北京望石智慧科技有限公司赵黎明获国家专利权

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龙图腾网获悉北京望石智慧科技有限公司申请的专利结合活性排序方法、装置、设备、介质及用途获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114694747B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210352868.2,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权结合活性排序方法、装置、设备、介质及用途是由赵黎明设计研发完成,并于2022-03-31向国家知识产权局提交的专利申请。

结合活性排序方法、装置、设备、介质及用途在说明书摘要公布了:本发明涉及计算生物学技术领域,具体涉及一种结合活性排序方法、装置、设备、介质及用途。本发明提供的结合活性排序方法,通过基于各候选分子之间的各差异基团的极性状态、与各差异基团对应的目标蛋白表面区域的极性状态以及各候选分子与溶剂分子的接触面积,对各候选分子与受体蛋白的静电互补打分适用性进行筛选,筛选出适用于静电互补打分法的目标候选分子,再基于静电互补打分法确定各目标候选分子与受体蛋白之间的静电互补打分值,并基于静电互补打分值对各目标候选分子与受体蛋白的结合活性进行排序,这有效解决了现有静电互补打分法因对部分小分子与蛋白的适用性较差而导致的评估结果可信度较低的问题。

本发明授权结合活性排序方法、装置、设备、介质及用途在权利要求书中公布了:1.一种结合活性排序方法,其特征在于,包括如下操作: 响应于获取到多个候选分子中各候选分子之间的至少一个差异基团,基于各候选分子与受体蛋白的复合结构,确定与各候选分子中差异基团对应的目标蛋白表面区域; 基于候选分子中差异基团的极性状态、与候选分子中差异基团对应的目标蛋白表面区域的极性状态以及候选分子与溶剂分子的接触面积,确定每个候选分子与受体蛋白的静电互补打分适用性; 基于每个候选分子与受体蛋白的静电互补打分适用性,筛选出适用于静电互补打分的至少一个目标候选分子,并利用静电互补打分法确定每个目标候选分子与所述受体蛋白之间的静电互补打分值; 基于每个目标候选分子与所述受体蛋白之间的静电互补打分值,对各目标候选分子与所述受体蛋白的结合活性进行排序; 所述目标蛋白表面区域为与差异基团的任意原子的距离在预设范围内的受体蛋白表面区域,所述基于各候选分子与受体蛋白的复合结构,确定与各候选分子中差异基团对应的目标蛋白表面区域,包括: 获取受体蛋白的表面格点; 基于候选分子与受体蛋白的复合结构,确定受体蛋白的每个表面格点与候选分子中差异基团的任意原子的距离; 将与候选分子中差异基团的任意原子的距离在预设范围内的表面格点组成的区域作为与候选分子中差异基团对应的目标蛋白表面区域; 其中,所述预设范围为小于等于3.5埃; 所述基于候选分子中差异基团的极性状态、与候选分子中差异基团对应的目标蛋白表面区域的极性状态以及候选分子与溶剂分子的接触面积,确定每个候选分子与受体蛋白的静电互补打分适用性,包括: 基于候选分子中差异基团的极性状态,确定差异基团是否为极性基团; 基于与候选分子中差异基团对应的目标蛋白表面区域的极性状态,确定与差异基团对应的目标蛋白表面区域是否为极性区域; 基于候选分子与溶剂分子的接触面积,确定候选分子与溶剂分子间的相互作用是否弱于预设状态; 在差异基团为极性基团、与差异基团对应的目标蛋白表面区域为极性区域以及候选分子与溶剂分子间的相互作用弱于预设状态的情况下,确定候选分子与受体蛋白适用于静电互补打分; 所述候选分子与溶剂分子的接触面积包括候选分子在复合状态下与溶剂分子的第一接触面积以及候选分子在非复合状态下与溶剂分子的第二接触面积,所述基于候选分子与溶剂分子的接触面积,确定候选分子与溶剂分子间的相互作用是否弱于预设状态,包括: 基于候选分子的分子结构,确定候选分子在复合状态下与溶剂分子的第一接触面积,以及候选分子在非复合状态下与溶剂分子的第二接触面积; 基于所述第一接触面积和所述第二接触面积,确定候选分子的复合非复合溶剂接触面积比是否小于预设比值; 在确定所述复合非复合溶剂接触面积比小于预设比值的情况下,确定候选分子与溶剂分子间的相互作用弱于预设状态;和或 在确定所述复合非复合溶剂接触面积比不小于预设比值的情况下,确定候选分子与溶剂分子间的相互作用不弱于预设状态。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京望石智慧科技有限公司,其通讯地址为:100080 北京市海淀区丹棱街6号丹棱soho 930;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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