华中农业大学张青叶获国家专利权
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龙图腾网获悉华中农业大学申请的专利一种小分子药物设计方法、装置、电子设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117059196B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-07发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310941750.8,技术领域涉及:G16C20/50;该发明授权一种小分子药物设计方法、装置、电子设备及存储介质是由张青叶;刘衍光;于海龙设计研发完成,并于2023-07-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种小分子药物设计方法、装置、电子设备及存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种小分子药物设计方法、装置、电子设备及存储介质,方法包括:获取与研究疾病相关的化合物以及所述化合物处理细胞前后的基因表达数据,并计算所述化合物处理细胞前后的基因表达数据的差值后,以所述化合物和所述基因表达数据构建数据集;将所述数据集输入至预先构建的TransGEM模型中,以完成所述TransGEM模型的训练,其中,所述TransGEM模型的输入向量为化合物以及对应的差值,所述TransGEM模型的输出向量为重构的化合物;获取特定疾病细胞及对应正常组织细胞的基因表达数据,并计算出基因表达差值;将所述基因表达差值输入所述训练完备的TransGEM模型中,以生成所述特定疾病对应的小分子药物。本发明易于使用、效率高,可用于靶标未知疾病的小分子药物设计。
本发明授权一种小分子药物设计方法、装置、电子设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种小分子药物设计方法,其特征在于,包括如下步骤: 获取与研究疾病相关的化合物以及所述化合物处理细胞前后的基因表达数据,并计算所述化合物处理细胞前后的基因表达数据的差值后,以所述化合物和所述基因表达数据构建数据集; 将所述数据集输入至预先构建的TransGEM模型中,以完成所述TransGEM模型的训练,其中,所述TransGEM模型的输入向量为所述化合物以及对应的差值,所述TransGEM模型的输出向量为重构的化合物; 获取特定疾病细胞及对应正常组织细胞的基因表达数据,并计算出基因表达差值; 将所述基因表达差值输入训练完备的TransGEM模型中,以生成所述特定疾病对应的小分子药物; 所述TransGEM模型至少包括依次相连的基因表达编码器、分子嵌入层、解码器以及生成器; 所述解码器由堆叠的解码器层组成,所述解码器层由掩码的多头自注意层、多头注意力层和前馈神经网络层组成,所述多头注意力层用于提取基因与分子之间的注意力矩阵,所述注意力矩阵用于计算每个基因相对于分子的注意力得分,以识别出潜在的疾病靶点; 所述基因表达编码器用于将输入的差值编码为x∈Rn×d,其中,d=d_g+d_c,n表示每个基因表达中基因的数量,x表示编码后的数据,R表示实数,d_g表示差值嵌入的维度,d_c表示疾病对应细胞系嵌入的维度。
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