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龙图腾网获悉复旦大学申请的专利基于几何体模型的蛋白分子指纹计算方法及其应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115482878B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211177489.0，技术领域涉及：G16B20/20；该发明授权基于几何体模型的蛋白分子指纹计算方法及其应用是由曹志伟;裘天颐;汪源;张璐设计研发完成，并于2022-09-26向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于几何体模型的蛋白分子指纹计算方法及其应用在说明书摘要公布了：本发明提供一套对抗原抗体复合物相互识别界面描述符即蛋白分子指纹的构建方法，通过对抗体抗原三维结构的结合界面进行双侧描述，最大程度的呈现特异识别的结构与理化特征。基于这套方法产生的蛋白分子指纹，基于抗原‑抗体特异性互作识别规律，设计抗体特异的表位预测算法和抗体虚拟筛选模型，对接现有机器学习或深度学习工具，可快速实现基于抗体的抗原表位预测和基于特定表位的高通量抗体虚拟筛选。

本发明授权基于几何体模型的蛋白分子指纹计算方法及其应用在权利要求书中公布了：1.一种基于几何体模型的蛋白识别界面的分子指纹构建方法，其特征在于，包括以下步骤： S01确定蛋白分子及识别界面的几何中心点: 所述蛋白分子的几何中心点是根据蛋白分子所有氨基酸中的识别界面的特定氨基酸的空间坐标取均值，即得到其几何中心点坐标； 所述识别界面的几何中心点是根据识别界面的特定氨基酸的空间坐标取均值，即得到其几何中心点坐标； S02确定蛋白分子几何体模型的描述方法： 所述蛋白分子几何体模型的描述方法是根据蛋白空间构象，选用不同几何体模型进行描述，几何体模型选自：球体、圆柱体、椭球体、立方体或锥体； 当选自球体模型时，所述球体模型描述的结构包括抗原蛋白、抗原表位区域、抗体CDR区域；当选自圆柱体模型，所述圆柱体模型描述的结构包括抗原或抗体蛋白表面片的结构特征； S03蛋白分子几何体模型子区域划分： 所述蛋白分子几何体模型子区域划分是根据所选用的几何体模型，将其划分为若干子区域，子区域的划分原则为确保每个子区域覆盖合适数目的氨基酸，需要结合不同蛋白的大小、氨基酸分子大小以及空间距离划定子区域大小范围； S04蛋白分子氨基酸理化性质指数的选取； S05构建蛋白识别界面的分子指纹： 所述构建蛋白识别界面的分子指纹是基于选定的氨基酸理化性质指数，计算每个子区域的每项氨基酸理化性质特征值，所有子区域的所有氨基酸特征值即构成该蛋白识别界面的分子指纹。

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