北京化工大学谭天伟获国家专利权
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龙图腾网获悉北京化工大学申请的专利一种生物代谢路径调控方法及装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116312740B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211627851.X,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权一种生物代谢路径调控方法及装置是由谭天伟;蔡秉岐设计研发完成,并于2022-12-16向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种生物代谢路径调控方法及装置在说明书摘要公布了:本申请提供了一种生物代谢路径调控方法及装置。该方法包括:求解代谢网络模型的野生型通量范围和过表达型通量范围;根据过表达型通量范围确定反应发生的方向;根据野生型通量范围和过表达型通量范围确定需要执行的操作及对应的通量;针对需要执行的操作,使用原子映射工具重构反应方程式,得到该操作对应的反应中主要的底物和产物,并根据反应发生的方向构建代谢网络连通图;对所述代谢网络连通图添加所述对应的通量作为权值;添加虚拟起始节点作为所有入度为0的节点的起点,添加虚拟终止节点作为所有出度为0的节点的终点,并求解关键位点;针对关键位点选取优先调控的反应。
本发明授权一种生物代谢路径调控方法及装置在权利要求书中公布了:1.一种生物代谢路径调控方法,其特征在于,该方法包括: 求解代谢网络模型的野生型通量范围和过表达型通量范围; 根据过表达型通量范围确定反应发生的方向; 根据野生型通量范围和过表达型通量范围确定需要执行的操作及对应的通量; 针对需要执行的操作,使用原子映射工具重构反应方程式,得到该操作对应的反应中主要的底物和产物,并根据反应发生的方向构建代谢网络连通图; 对所述代谢网络连通图添加所述对应的通量作为权值; 添加虚拟起始节点作为所有入度为0的节点的起点,添加虚拟终止节点作为所有出度为0的节点的终点,并求解关键位点; 针对关键位点选取优先调控的反应; 对代谢网络模型使用通量差异性分析算法求解以最大生长为目标函数的条件下各个野生型反应通量范围; 对代谢网络模型使用通量差异性分析算法求解以生产产物为目标函数的条件下各个反应的过表达型通量范围; 野生型通量绝对值最小值大于过表达型通量绝对值最大值,需要执行的操作为下调,对应的通量为野生型通量绝对值最小值与过表达型通量绝对值最大值之差;野生型通量绝对值最大值小于过表达型通量绝对值最小值,需要执行的操作为上调,对应的通量为过表达型通量绝对值最小值与野生型通量绝对值最大值之差;过表达型通量为0,需要执行的操作为敲除,对应的通量为野生型通量最大值的绝对值和最小值的绝对值中较小者; 代谢网络连通图去除了反应方程式中的辅因子以及去除小分子物质; 求解关键位点包括利用最大流最小割算法求解代谢网络连通图中的关键位点。
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