武汉贝纳科技有限公司冀金龙获国家专利权
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龙图腾网获悉武汉贝纳科技有限公司申请的专利一种基于ONT测序的单细胞转录组的测序分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119091964B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411262686.1,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种基于ONT测序的单细胞转录组的测序分析方法是由冀金龙;田朝阳;宋驰;陈虎;杨路路;易欣欣设计研发完成,并于2024-09-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于ONT测序的单细胞转录组的测序分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于ONT测序的单细胞转录组的测序分析方法,涉及基因测序分析技术领域。本方法包括以下步骤:制备、构建待测样品的cDNA文库,测序,获得三代原始数据;对三代原始数据进行质控,得到三代有效数据;对参考基因组进行功能注释;使用软件ONT‑SC‑pipeline进行数据拆分、比对和定量,得到定量数据;对定量数据依次进行基础分析、Marker基因富集分析和高级分析;基础分析包括top基因分布分析、高变基因分析、聚类分群分析、各细胞类群的相关性分析、降维分析和Marker基因识别;高级分析包括细胞注释分析、细胞通讯分析、细胞轨迹分析可变剪切分析和融合基因分析。
本发明授权一种基于ONT测序的单细胞转录组的测序分析方法在权利要求书中公布了:1.一种基于ONT测序的单细胞转录组的测序分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 制备、构建待测样品的cDNA文库,测序,获得所述待测样品的三代原始数据;对所述三代原始数据进行质控,得到所述待测样品的三代有效数据; 对参考基因组的基因和转录本进行功能注释; 结合所述三代有效数据和所述参考基因组的基因数据,使用软件ONT-SC-pipeline进行数据拆分、比对和定量,得到定量数据; 对所述定量数据进行双细胞识别和去除,并对数据进一步的过滤; 对过滤后的数据依次进行基础分析、Marker基因富集分析和高级分析;所述基础分析包括top基因分布分析、高变基因分析、聚类分群分析、各细胞类群的相关性分析、降维分析和Marker基因识别;所述高级分析包括细胞注释分析、细胞通讯分析、细胞轨迹分析、可变剪切分析和融合基因分析; 所述软件ONT-SC-pipeline中,使用vsearch功能提取adaptor并获取原始数据,过滤低质量reads,完成数据拆分,得到cleandata;结合参考基因组,使用minimap2对cleandata进行数据比对,sringtie识别新转录本,比对转录本,提取readsID、转录本和基因关系;使用vsearch识别cleandata的Barcode和UMI,聚类Barcode和UMI,重新分配Barcode和UMI,提取readsID、Barcode、UMI关系; 将readsID、基因和转录本、Barcode、UMI的关系合并计算,得到定量数据,即基因和转录本表达量。
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