深圳大学张娟获国家专利权
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龙图腾网获悉深圳大学申请的专利蛋白质-蛋白质对接方法、装置、智能设备和存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119400235B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411244529.8,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权蛋白质-蛋白质对接方法、装置、智能设备和存储介质是由张娟;吉君恺;李坚强;朱泽轩;林秋镇设计研发完成,并于2024-09-05向国家知识产权局提交的专利申请。
本蛋白质-蛋白质对接方法、装置、智能设备和存储介质在说明书摘要公布了:本申请适用于生物信息技术领域,提供了一种蛋白质‑蛋白质对接方法、装置、智能设备和存储介质,所述方法包括:对受体蛋白质的表面空间进行全局搜索,确定所述受体蛋白质与配体蛋白质的若干候选对接姿态;根据预设优化算法对所述若干候选对接姿态进行优化,确定目标对接姿态;对所述目标对接姿态进行聚类;基于所述聚类的结果,确定所述受体蛋白质与所述配体蛋白质的最佳对接姿态。本申请可高效搜索结合构象,提高蛋白质‑蛋白质对接的效率与成功率。
本发明授权蛋白质-蛋白质对接方法、装置、智能设备和存储介质在权利要求书中公布了:1.一种蛋白质-蛋白质对接方法,其特征在于,所述方法包括: 对受体蛋白质的表面空间进行全局搜索,确定所述受体蛋白质与配体蛋白质的若干候选对接姿态,包括:利用FFT算法对受体蛋白质的表面空间进行全局搜索,生成多个结合构象;根据预设筛选条件对所述结合构象进行筛选,确定若干候选对接姿态; 根据预设优化算法对所述若干候选对接姿态进行优化,确定目标对接姿态,包括:基于所述配体蛋白质构象的位置,对所述若干候选对接姿态进行聚类,获得若干类的候选对接姿态;根据所述候选对接姿态的类数,对所述受体蛋白质的表面空间进行区域划分,其中,每一区域包含一类所述候选对接姿态; 通过差分进化算法,对每一区域中的候选对接姿态进行迭代优化,包括:利用预设评估函数对区域中的候选对接姿态进行适应度评估,确定区域中候选对接姿态的适应度值;基于所述适应度值与预设迭代策略对所述候选对接姿态进行迭代优化,直至满足预设终止条件时,迭代优化结束,所述预设迭代策略包括交叉、变异及选择;基于所述迭代优化的结果,确定每一区域中的目标对接姿态; 对所述目标对接姿态进行聚类; 基于所述聚类的结果,确定所述受体蛋白质与所述配体蛋白质的最佳对接姿态。
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