南京大学李辰美获国家专利权
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龙图腾网获悉南京大学申请的专利基于进化生物学与计算生物的RNA进化前体筛选方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119517174B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411508319.5,技术领域涉及:G16B35/20;该发明授权基于进化生物学与计算生物的RNA进化前体筛选方法是由李辰美;王毅庆;克里斯托夫布奇设计研发完成,并于2024-10-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于进化生物学与计算生物的RNA进化前体筛选方法在说明书摘要公布了:本发明涉及生物技术领域,公开了基于进化生物学与计算生物的RNA进化前体筛选方法,包括构建系统发育树,筛选氨基酸序列,预测细菌转录酶形成二聚体的三维结构;构建核苷酸类似物小分子数据库;将预测的转录酶二聚体与核苷类似物进行对接,筛选结合模式优异的小分子;筛选出与原始核苷酸‑蛋白质相互作用类似的分子作为潜在候选分子;对筛选出的候选分子进行双链结构预测,得到RNA小分子进化前体。本发明结合进化生物学和计算生物学法系统筛选出核苷类似物作为前RNA世界中RNA的前体候选小分子,与传统实验研究RNA前体法相比,这种方法更加系统化,而与单纯基于进化生物学的生命起源探索相比,提供了计算生物学的理论结果支撑。
本发明授权基于进化生物学与计算生物的RNA进化前体筛选方法在权利要求书中公布了:1.基于进化生物学与计算生物的RNA进化前体筛选方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、根据细菌转录酶的氨基酸序列构建系统发育树,筛选具有广谱特性的细菌转录酶的氨基酸序列,并预测细菌转录酶形成二聚体的三维结构; S2、选取核糖异构体及现代核苷酸类似物,通过碱基磷酸根替换和空间异构变化法,构建完整的核苷酸类似物小分子数据库; S3、利用分子对接软件将预测的转录酶二聚体与核苷类似物进行对接,预测其结合模式,并筛选结合模式优异的小分子; S4、通过分子相互作用关系指纹分析技术,筛选出与原始核苷酸-蛋白质相互作用类似的分子,并作为潜在候选分子; S5、利用双链预测模型对筛选出的候选分子进行双链结构预测,并基于预测结果分析得到RNA小分子进化前体。
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