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三亚华大生命科学研究院;三亚智数生物科技有限公司陈燕获国家专利权

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龙图腾网获悉三亚华大生命科学研究院;三亚智数生物科技有限公司申请的专利筛选靶标插入位点的方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120608083B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511096861.9,技术领域涉及:C12N15/70;该发明授权筛选靶标插入位点的方法及其应用是由陈燕;姚晓明;云莉芬;于宛彤;岳震;方晓东设计研发完成,并于2025-08-06向国家知识产权局提交的专利申请。

筛选靶标插入位点的方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明涉及基因工程领域,公开了筛选靶标插入位点的方法及其应用,所述方法包括:构建表达目标基因的质粒,提取携带所述质粒的工程菌的总RNA,得到RNA样本;对所述RNA样本进行转录组测序,得到转录组测序数据;将所述转录组测序数据与所述工程菌的参考基因组进行比对处理,确定所述工程菌中每个基因的FPKM值;以及确定所述工程菌中每个基因与下游基因的距离;当基因的FPKM值大于600,且与下游基因的距离大于53bp时,所述基因为靶标插入位点。本发明方法能准确确定靶标插入位点,提高了gRNA设计的准确性和针对性,用于优化设计MUCICAT基因编辑用gRNA,针对性强、预测性好,基因编辑效率高、灵活性好,目标基因拷贝数稳定、菌株传代稳定性好,目标代谢物产量高。

本发明授权筛选靶标插入位点的方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种筛选靶标插入位点的方法,其特征在于,所述靶标插入位点用于在工程菌基因组中插入目标基因,所述方法包括: 构建携带目标基因的质粒,提取携带所述质粒的工程菌的总RNA,得到RNA样本; 对所述RNA样本进行转录组测序,得到转录组测序数据; 将所述转录组测序数据与所述工程菌的参考基因组进行比对处理,确定所述工程菌中每个基因的FPKM值;以及确定所述工程菌中每个基因与下游基因的距离; 当基因的FPKM值大于600,且与下游基因的距离大于53bp时,所述基因为靶标插入位点; 所述工程菌选自BL21Star™DE3ΔlacZΔwcaJΔnudDΔnudK、BL21Star™DE3ΔlacZΔwcaJΔnudDΔnudK-FutC-SUMO或BL21Star™DE3ΔlacZΔwcaJΔnudDΔnudK-FucT-SUMO; 所述靶标插入位点包括:ychH、fur、sodB、ftnA、lpp、ytfK、glpD和rraB中的至少之一。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人三亚华大生命科学研究院;三亚智数生物科技有限公司,其通讯地址为:572025 海南省三亚市崖州区崖州湾科技城雅布伦产业园二号楼四楼431室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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