国科大杭州高等研究院刘小平获国家专利权
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龙图腾网获悉国科大杭州高等研究院申请的专利组织基因的转录因子识别方法及装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120727110B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511145227.X,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权组织基因的转录因子识别方法及装置是由刘小平;李宛谕;王泽栋设计研发完成,并于2025-08-15向国家知识产权局提交的专利申请。
本组织基因的转录因子识别方法及装置在说明书摘要公布了:本申请公开了一种组织基因的转录因子识别方法及装置,涉及一种生物信息技术领域,主要目的在于解决现有组织基因的转录因子识别准确性差的问题。包括:获取组织基因的初始基因表达矩阵,并基于所述初始基因表达矩阵构建全连接有向图;在将所述全连接有向图转换为无向角色图后,基于已完成模型训练的图神经网络模型对所述无向角色图以及特征矩阵进行重构,得到重构后的目标基因表达矩阵,所述图神经网络模型的损失值为动态移除边后计算得到的;基于所述目标基因表达矩阵生成有向基因调控网络,并基于所述有向基因调控网络识别所述组织基因的转录因子。
本发明授权组织基因的转录因子识别方法及装置在权利要求书中公布了:1.一种组织基因的转录因子识别方法,其特征在于,包括: 获取组织基因的初始基因表达矩阵,并基于所述初始基因表达矩阵构建全连接有向图; 在将所述全连接有向图转换为无向角色图后,基于已完成模型训练的图神经网络模型对所述无向角色图以及特征矩阵进行重构,得到重构后的目标基因表达矩阵,所述图神经网络模型的损失值为动态移除边后计算得到的; 基于所述目标基因表达矩阵生成有向基因调控网络,并基于所述有向基因调控网络识别所述组织基因的转录因子; 所述在将所述全连接有向图转换为无向角色图后,基于已完成模型训练的图神经网络模型对所述无向角色图进行重构,得到重构后的目标基因表达矩阵之前,所述方法还包括: 获取样本数据集,所述样本数据集包括无向角色图样本以及特征矩阵样本; 构建两层图神经网络,所述两层图神经网络的第一层网络用于聚合邻居节点特征,所述两层图神经网络的第二层网络用于生成高阶特征表示; 在基于所述样本数据集对所述两层图神经网络进行模型训练过程中,遍历全部网络边,并在删除目标网络边确定损失值为最小时,完成对所述两层图神经网络的模型训练,得到完成模型训练的图神经网络模型; 所述基于所述初始基因表达矩阵构建全连接有向图之后,所述方法还包括: 对所述全连接有向图中的节点进行拆分,得到输入节点以及输出节点; 基于双向编码器对所述输入节点以及所述输出节点进行编码,得到所述无向角色图以及所述特征矩阵。
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