苏州元脑智能科技有限公司贾蒙磊获国家专利权
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龙图腾网获悉苏州元脑智能科技有限公司申请的专利一种生物大分子序列结构预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120853678B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511368692.X,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种生物大分子序列结构预测方法是由贾蒙磊设计研发完成,并于2025-09-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种生物大分子序列结构预测方法在说明书摘要公布了:本申请公开了一种生物大分子序列结构预测方法,涉及计算机技术领域,本申请通过在扩散过程中引入几何位置编码门控机制,利用多尺度注意力广播机制对所处理的目标信息的不同注意力类型相对应的注意力权重采取不同的广播范围方式广播,广播范围内不同时间步中的注意力权重复用,实现在广播范围的步骤内采用同样的注意力权重,减少了计算量,提升了模型效率性能,还能够有效提升模型对蛋白质序列中氨基酸位置信息的感知能力,使得模型在计算注意力权重时能够充分考虑氨基酸之间的位置关系,能够帮助模型更好地识别长链氨基酸相互作用,减少因位置信息缺失而导致的结构预测错误,提升了预测精度。
本发明授权一种生物大分子序列结构预测方法在权利要求书中公布了:1.一种生物大分子序列结构预测方法,其特征在于,包括: 对生物大分子序列中氨基酸的几何位置信息进行编码,确定多个残基对之间相对空间关系的动态几何位置编码,通过门控信号调节所述动态几何位置编码的权重生成经门控调节的几何位置编码; 将所述几何位置编码与注意力机制相结合确定调整氨基酸之间位置关系的注意力权重,并根据所处理的目标信息的注意力类型调节所述注意力权重的广播范围; 基于所述几何位置编码、所述注意力权重和所述注意力权重的广播范围修正残基位置,根据修正后的残基位置更新所述几何位置编码; 根据更新后的几何位置编码确定预测的生物大分子序列结构; 其中,所述对生物大分子序列中氨基酸的几何位置信息进行编码,确定多个残基对之间相对空间关系的动态几何位置编码,通过门控信号调节所述动态几何位置编码的权重生成经门控调节的几何位置编码,包括: 接收输入的生物大分子序列、配体及共价键信息,生成所述生物大分子序列的初始残基特征表示; 生成所述生物大分子序列的起始三维坐标点,作为所述动态几何位置编码的起点; 基于所述起始三维坐标点,将残基的三维坐标通过线性变换映射为高维特征,结合扩散模型的噪声扰动过程生成表征残基对之间的相对空间关系的编码向量作为多个残基对之间的动态几何位置编码; 生成一个或多个门控信号,所述门控信号用于调节所述动态几何位置编码的权重; 应用所述门控信号至所述动态几何位置编码,生成经门控调节的几何位置编码; 其中,所述将所述几何位置编码与注意力机制相结合确定调整氨基酸之间位置关系的注意力权重包括: 将所述几何位置编码作为对数偏置项注入至注意力机制的注意力分数计算中,将调整氨基酸残基对之间的注意力分数作为调整氨基酸之间位置关系的注意力权重。
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