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龙图腾网获悉深圳大学申请的专利一种基于多区域划分的蛋白质-蛋白质对接方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115938469B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-28发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211377734.2，技术领域涉及：G16B15/20；该发明授权一种基于多区域划分的蛋白质-蛋白质对接方法及系统是由吉君恺;李坚强;周进;杨张帆;贺颖设计研发完成，并于2022-11-04向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于多区域划分的蛋白质-蛋白质对接方法及系统在说明书摘要公布了：本申请提供一种基于多区域划分的蛋白质‑蛋白质对接方法及系统，涉及生物技术领域。该方法包括：通过将对接的两个蛋白质中原子数量相对较大的一个作为受体蛋白质保持其姿态不变，并将该受体蛋白质的表面原子空间划分为若干个子空间，在该若干个子空间内独立并行地进行配体蛋白质的姿态搜索，确定每个子空间产生的候选配体蛋白质构象，大大缩短蛋白质‑蛋白质对接姿态的搜索时长，提高了受体蛋白质与配体蛋白质的对接效率，并通过对各个子空间产生的候选配体蛋白质构象进行合并，再从合并的候选配体蛋白质构象中确定与受体蛋白质对接最佳的配体蛋白质的姿态，提高了受体蛋白质与配体蛋白质的准确率。

本发明授权一种基于多区域划分的蛋白质-蛋白质对接方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种基于多区域划分的蛋白质-蛋白质对接方法，其特征在于，所述方法包括： 根据对接的目标蛋白质的原子数量，将所述目标蛋白质中的一个记为受体蛋白质，另一个记为配体蛋白质，其中，所述受体蛋白质的原子数量大于所述配体蛋白质的原子数量，所述受体蛋白质的姿态保持不变； 对所述受体蛋白质的表面原子进行空间划分，得到M个子空间，其中，M为大于1的整数； 在M个所述子空间内并行进行配体蛋白质的姿态搜索，确定每个所述子空间产生的候选配体蛋白质构象； 将M个所述子空间产生的候选配体蛋白质构象进行合并，从合并得到的候选配体蛋白构象集合中，确定与所述受体蛋白质对接最佳的配体蛋白质的姿态； 其中，所述对所述受体蛋白质的表面原子进行空间划分，得到M个子空间中，包括： 从第一原子集合中随机选择M个原子作为初始聚类中心，所述第一原子集合为从所述受体蛋白质表面提取到的所有原子的集合； 根据每个原子与每个所述初始聚类中心之间的距离，将所述第一原子集合中的每个原子划分到与其距离最小的所述初始聚类中心对应的类别中，并计算重新划分后的每个类别的聚类中心，得到M个第二聚类中心； 按照第一预设距离，以M个所述第二聚类中心为中心点生成对应的球状点集，得到M个球状点集，所述第一预设距离为所述配体蛋白质中距离间隔最大的两个原子之间的距离的五分之一到三分之一范围内的任意一个距离； 删除每个球状点集中的冗余点，并将删除冗余点后的球状点集合并，得到第二原子集合； 从所述第二原子集合中随机选择M个原子作为第三聚类中心； 根据每个原子与每个所述第三聚类中心之间的距离，将所述第二原子集合中的每个原子划分与其距离最小的所述第三聚类中心对应的类别中，并计算重新划分后的每个类别的聚类中心，得到M个第四聚类中心，所述第四聚类中心为子空间中心点。

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