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深圳市海普洛斯生物科技有限公司陈实富获国家专利权

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龙图腾网获悉深圳市海普洛斯生物科技有限公司申请的专利一种过滤低复杂度高通量测序数据的装置、方法及计算机可读存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116312769B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310071957.4,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种过滤低复杂度高通量测序数据的装置、方法及计算机可读存储介质是由陈实富;许明炎;汪周阳设计研发完成,并于2023-01-12向国家知识产权局提交的专利申请。

一种过滤低复杂度高通量测序数据的装置、方法及计算机可读存储介质在说明书摘要公布了:本发明涉及基因检测及生物信息技术领域,尤其涉及一种过滤低复杂度高通量测序数据的装置、方法及计算机可读存储介质,本发明的方法:将高通量测序数据中每条READ的复杂度与复杂度阈值比较,删除复杂度低于复杂度阈值的READ,即实现低复杂度高通量测序数据的过滤;所示复杂度阈值为参考基因组序列中所有的参考序列复杂度的频率分布中95%分位数对应的复杂度。本发明的方法基于现有的NGS检测数据和参考基因组的信息,将PCR过程中产生的低复杂度的重复碱基序列同参考基因组中的重复碱基序列进行准确的区分识别,去除测序等实验过程产生的低复杂度序列,最大限度的保留真实的测序READ信息,提高测序的准确性。

本发明授权一种过滤低复杂度高通量测序数据的装置、方法及计算机可读存储介质在权利要求书中公布了:1.一种过滤低复杂度高通量测序数据的装置,其特征在于,所述装置包括: a.高通量测序数据中READ复杂度计算模块 该模块利用复杂度的计算方法计算高通量测序数据中每一条READ的复杂度,所述复杂度的计算方法为:按照READ从5’端到3’端的顺序,统计相邻两个碱基为相同碱基的次数之和,将次数之和除以该条READ的碱基长度,再用1减去该数值后,乘以100%; b.参考基因组序列的复杂度分布确定模块 该模块用于确定参考基因组序列的复杂度,统计复杂度的频率分布; 在探针设计范围或检测区间范围内,获取参考基因组中所有的参考序列;按照高通量测序数据中READ复杂度计算模块中所述复杂度的计算方法计算所有参考序列的复杂度,并统计复杂度的频率分布; c.低复杂度序列的过滤模块 该模块将确定的低复杂度序列从测序数据中删除,实现低复杂度高通量测序数据的过滤; 所述低复杂度序列为高通量测序数据中READ复杂度计算模块中计算的READ复杂度低于复杂度阈值的序列,删除低复杂度序列数据,即实现低复杂度高通量测序数据的过滤; 所述复杂度阈值为参考基因组序列的复杂度分布确定模块确定的频率分布中95%分位数对应的复杂度; d.输出模块 该模块用于输出过滤低复杂度序列后的测序数据。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人深圳市海普洛斯生物科技有限公司,其通讯地址为:518000 广东省深圳市前海深港合作区前湾一路1号A栋201室(入驻深圳市前海商务秘书有限公司)经营地址 : 深圳市南山区西丽街道松坪山路3号奥特迅电力大厦8楼;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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