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龙图腾网获悉温州大学申请的专利一种分子动力学的快速建模方法与程序库获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116092589B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-02发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310295356.1，技术领域涉及：G16C10/00；该发明授权一种分子动力学的快速建模方法与程序库是由牟轩慷;李士本设计研发完成，并于2023-03-24向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种分子动力学的快速建模方法与程序库在说明书摘要公布了：本发明专利公开了一种分子动力学的快速建模方法，包括分子模型和系统模型建模，所述系统模型由分子模型组成，且系统模型是一组分子模型的集合或是多个子系统合并成的最终体系模型。上述技术方案，使用者仅需掌握几条基础命令，实现快速建模，学习成本低。在大型复杂系统建模时，可以通过多个子系统组合的方式进行超大规模的系统构建。通过对生成的模型文件进行快速的增删改查，实现模型的再利用与快速建模，极大的增强了模型的迁移能力。通过对于模型粒子数、边界位置、原子成键角个数的快速统计，实现了建模后的简易检查。在程序脚本建模的基础上，实现了在建模过程中与可视化软件的快速联动，在建模过程中可以通过可视化观察模型的建立是否符合预期。

本发明授权一种分子动力学的快速建模方法与程序库在权利要求书中公布了：1.一种分子动力学的快速建模方法，其特征在于：包括分子模型和系统模型，所述系统模型由分子模型组成，且系统模型是一组分子模型的集合或是多个子系统合并成的最终体系模型； 在分子模型构建中，定义molecule数据类型，将建模文件所需的原子类型与坐标信息Atoms、原子间成键信息Bonds和原子间成角信息Angles三个作为molecule数据类型基本数据结构；其中Atoms数据包括原子序号id、原子类型type和原子坐标xyz；Bonds数据包括原子序号id、原子类型type和原子坐标xyz；Bonds数据包括成键序号、成键类型type和两个成键粒子的id；Angles数据包括成角序号、成角类型type和三个成键粒子的id； 在构建时，先使用定义原子的xyz坐标信息，通过调用函数类型moleculexyz获得分子模型，根据每个粒子的坐标先后顺序，对粒子由1开始依次排序，自动生成粒子序号，随后通过molecule.set_atoms指令批量设置原子id所对应的原子类型，通过molecule.set_bonds指令批量设置原子间成键与成键类型，通过molecule.set_angles指令批量设置原子间成角与成角类型，并且通过中括号与括号两种方式分别表示单独成键角以及连续成键角，通过重载+方法，实现分子模型间的合并，或者使用molecule.append指令追加已有的分子模型，并且可以通过molecule.space_change指令实现分子坐标修改或者是进行整体偏移，通过molecule.space指令返回原有的各原子坐标，定义molecule.to_material指令实现molecule数据类型到material数据类型的切换。

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