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安徽大学郑春厚获国家专利权

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龙图腾网获悉安徽大学申请的专利基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117854598B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-02发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410127634.7,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法是由郑春厚;郭子强;魏丕静;高震;曹瑞芬设计研发完成,并于2024-01-30向国家知识产权局提交的专利申请。

基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法,包括:1、获取上皮细胞基因的表达值,并对特征值进行预处理;2、获取上皮细胞基因序列数据并将基因序列数据输入循环神经网络模型双向门控循环单元中得到该类基因的序列特征;3、对上皮细胞基因序列,通过生物学定义公式,计算生物特征;4前面步骤得到的特征拼接后输入有向图卷积神经网络中训练得到上皮细胞基因调控网络及其输出的预测分数矩阵,从而根据预测分数矩阵和阈值之间的关系,判断基因间是否存在调控关系。本发明能准确预测人体上皮细胞基因间的控制关系,有助于研究人员更高效地研究生物体本质。

本发明授权基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法,其特征在于,包含如下步骤: 步骤1:获取上皮细胞的基因集合并进行预处理,形成维的基因表达特征矩阵,为基因数量,为基因表达值维度;将上皮细胞中的各个基因作为基因节点,各个基因之间的控制关系作为基因节点之间的边,从而构建上皮细胞的基因控制图; 步骤2:构建条件变分自动编码器,并用于对上皮细胞的基因控制图中的基因节点的特征及其邻居基因节点的特征进行处理,得到维邻域特征矩阵,表示每一个基因节点的邻域特征维度; 步骤3:获取上皮细胞的维基因序列矩阵,并输入到双向门控循环单元中进行处理,得到维序列特征矩阵表示每一个基因节点序列特征的维度; 通过生物学公式对维基因序列矩阵进行计算,得到维生物特征矩阵 步骤4:将进行拼接,得到一个维的基因特征矩阵; 步骤5:构建有向图卷积神经网络并用于对进行处理,得到基因控制图中所有基因节点之间存在调控关系的预测分数矩阵; 步骤6:利用随机梯度下降法对所述有向图卷积神经网络进行训练,并计算交叉熵损失函数以更新网络参数,直到交叉熵损失函数收敛为止,从而得到训练好的上皮细胞基因调控模型; 步骤7:将上皮细胞的基因与序列特征信息输入上皮细胞基因调控模型中进行预测,并输出基因之间存在调控关系的预测分数,并通过设定的阈值最终判定是否存在调控关系。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人安徽大学,其通讯地址为:230601 安徽省合肥市经济技术开发区九龙路111号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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