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龙图腾网获悉北京大学申请的专利一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法及脱卤微生物的分析方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120340631B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-26发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510829729.8，技术领域涉及：G16B50/00；该发明授权一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法及脱卤微生物的分析方法是由危婕;温东辉设计研发完成，并于2025-06-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法及脱卤微生物的分析方法在说明书摘要公布了：本发明涉及生物信息学技术领域，尤其涉及一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法及脱卤微生物的分析方法。构建方法包括：获取脱卤反应相关基因；基于Uniprot蛋白数据库，获取脱卤反应相关基因所属家族的种子序列及同源序列得到核心数据库；将核心数据库与同源蛋白数据库进行比对，将比对得到的脱卤功能基因家族的序列与核心数据库合并得到初步数据库；将初步数据库比对至NCBI中微生物的Refseq数据库，经过分类、合并同源序列和去冗余得到完整数据库。本发明基于多个数据库的分析和搜索结果构建得到了精确的脱卤功能基因数据库，其可以用于便捷、准确地分析环境中的脱卤微生物功能群落，具有重要的应用价值。

本发明授权一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法及脱卤微生物的分析方法在权利要求书中公布了：1.一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法，其特征在于，包括： 1参照KEGG数据库中的微生物脱卤反应流程，通过文献调研得到脱卤反应相关基因；所述脱卤反应包括：还原脱卤、氧化脱卤、水解脱卤、硫解脱卤、脱氢卤化、甲基转移脱卤或分子内取代反应脱卤中的一种或多种 2基于Uniprot蛋白数据库中的Swiss-Prot数据库获取所述脱卤反应相关基因所属家族的种子序列；将所述种子序列比对TrEMBL数据库，将比对得到的同源序列与所述种子序列合并得到核心数据库；步骤2中，在所述Swiss-Prot数据库中通过基因名称进行所述种子序列的搜索，所述种子序列至少包括150个氨基酸，在搜索过程中使用ClustalW进行序列的对齐并生成发育树文件； 在TrEMBL数据库中，通过Usearch进行同源序列的搜索得到同源序列的id，同源截止率30%；基于所述同源序列的id，通过Seqkit进行序列的提取；使用Diamond的blastp模块进行同源蛋白数据库的比对得到脱卤功能基因家族的序列id，比对参数包括：E-value10-5，percentageofidenticalmatches80，bitscore40；基于所述序列id，通过Seqkit进行序列的提取； 3将所述核心数据库与同源蛋白数据库arCOG、KOG、COG、eggNOG和KEGG进行比对，将比对得到的脱卤功能基因家族的序列与所述核心数据库合并得到初步数据库； 4将所述初步数据库比对至NCBI中微生物的Refseq数据库，经过分类、合并同源序列和去冗余得到完整数据库；步骤4中，所述NCBI中微生物的Refseq数据库包括古菌、细菌和真菌的Refseq数据库；所述初步数据库的比对参数包括：E-value10-5，percentageofidenticalmatches80；通过TaxonKit进行分类确定各序列的完整分类级别信息；使用CD-hit软件设置参数id=1.0进行去冗余。

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