北京大学袁骁获国家专利权
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龙图腾网获悉北京大学申请的专利一种基于相干伊辛机的蛋白质结构对齐方法及装置获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120388602B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-26发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510458909.X，技术领域涉及：G16B15/00；该发明授权一种基于相干伊辛机的蛋白质结构对齐方法及装置是由袁骁;朱垣晔设计研发完成，并于2025-04-14向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于相干伊辛机的蛋白质结构对齐方法及装置在说明书摘要公布了：本发明提供一种蛋白质结构对齐方法及装置，所述方法包括：首先，获取需要对齐的两个蛋白质文件；接着，针对每个蛋白质文件，确定对应的接触对集合；之后根据两个接触对集合，生成二维网格图，在其中能形成有效对齐的网格顶点之间建立连接边；然后利用相干伊辛机系统，对所述二维网格图表示的解空间进行搜索，求解哈密顿量H的基态；最后根据所述哈密顿量H的基态生成蛋白质结构对齐图。本发明提供的蛋白质结构对齐方法，能系统性地搜索所有可能的对齐方案，确保找到的解是全局最优的。此外，本发明基于相干伊辛机系统，其计算过程具有内在的并行性，可以更快速地探索解空间，特别适用于处理蛋白质对齐问题中的大规模并行配对问题。
本发明授权一种基于相干伊辛机的蛋白质结构对齐方法及装置在权利要求书中公布了：1.一种蛋白质结构对齐方法，其特征在于，包括以下步骤： 获取需要对齐的两个蛋白质文件，每个蛋白质文件中包括蛋白质中多个原子的空间坐标，所述多个原子形成多个氨基酸残基，氨基酸残基以原始序列的顺序排列； 针对每个蛋白质文件，确定对应的多个接触对，其中每个接触对包括两个氨基酸残基； 根据两个蛋白质文件各自对应的多个接触对，生成二维网格图，其中，行代表一个蛋白质文件对应的接触对，列代表另一个蛋白质文件对应的接触对； 在所述二维网格图中能形成有效对齐的网格顶点之间建立连接边，所述有效对齐需满足：完成对齐后，氨基酸残基以原始序列的顺序排列； 利用相干伊辛机系统，对所述二维网格图表示的解空间进行搜索，求解哈密顿量H的基态，所述哈密顿量H为： 其中,代表第行第列的网格顶点是否被选取，为的权重，代表第行第列的网格顶点和第行第列的网格顶点之间是否有连接边，K1是的系数； 根据所述哈密顿量H的基态生成蛋白质结构对齐图。
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