苏州系统医学研究所吴爱平获国家专利权
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龙图腾网获悉苏州系统医学研究所申请的专利基于变异体适应性的季节性流感病毒疫苗株推荐方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120954491B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511460195.2,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权基于变异体适应性的季节性流感病毒疫苗株推荐方法及系统是由吴爱平;秦璐瑶;丁啸;刘骁源;刘竞择;马运设计研发完成,并于2025-10-14向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于变异体适应性的季节性流感病毒疫苗株推荐方法及系统在说明书摘要公布了:本申请提供基于变异体适应性的季节性流感病毒疫苗株推荐方法及系统包括:获取从当前流感季起近三个流感季的流感病毒血凝素蛋白HA序列数据和流感阳性率数据;识别HA蛋白序列的每个位点上的氨基酸突变,筛选下一流感季的风险突变;在当前流感季的HA蛋白序列中查找包含风险突变的序列,将所携带的风险突变完全一致的序列归为同一风险变异体;计算风险变异体的独立成分支能力、免疫逃逸能力和传播能力的条件概率的乘积,作为风险变异体适应性;将适应性分值最高的风险变异体作为下一流感季的优势变异体;确定优势变异体对应的HA蛋白序列,确定共识序列,选取与共识序列相似度最高的HA蛋白序列对应的毒株作为下一流感季的候选疫苗株。
本发明授权基于变异体适应性的季节性流感病毒疫苗株推荐方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于变异体适应性预测的季节性流感病毒疫苗株推荐方法,其特征在于,所述方法包括: 获取从当前流感季起近三个流感季的流感病毒血凝素蛋白序列数据和流感阳性率数据; 识别流感病毒血凝素蛋白序列的每个位点上的氨基酸突变,筛选下一流感季的风险突变; 在当前流感季的流感病毒血凝素蛋白序列中查找包含下一流感季的风险突变的序列,将所述包含下一流感季的风险突变的序列中的所携带的风险突变完全一致的序列归为同一风险变异体; 计算所述风险变异体的独立成分支能力的条件概率、免疫逃逸能力的条件概率和传播能力的条件概率的乘积,作为风险变异体适应性; 将所述风险变异体适应性的分值最高的风险变异体作为下一流感季可能广泛传播的优势变异体;以及 确定所述优势变异体对应的血凝素蛋白序列,通过序列对比确定共识序列,选取与所述共识序列相似度最高的血凝素蛋白序列对应的流感病毒毒株作为下一流感季的候选疫苗株; 其中,按照公式11-14计算所述风险变异体的独立成分支能力,按照公式15计算所述风险变异体的独立成分支能力的条件概率: :风险变异体中包含的风险突变数量; :风险突变在当前流感季序列中独立出现次数; 为风险突变在当前流感季序列中总的出现次数; :突变模式,用于表示风险突变的组合状态; :突变模式中第j个风险突变的状态值; :某个特定风险突变组合模式在当前流感季序列中出现的次数; :实际观测到的突变模式概率; :假设各风险突变独立出现时的理论概率; :当前流感季的序列数量; :第个样本序列在第j个风险突变的状态; :第j个风险突变的边缘概率; 按照公式16计算所述风险变异体的免疫逃逸能力,按照公式17计算所述风险变异体的免疫逃逸能力的条件概率: :风险变异体中第个风险突变的免疫逃逸分数; 按照公式18计算所述风险变异体的传播能力,按照公式19计算所述风险变异体的传播能力的条件概率: :风险变异体中包含的风险突变数量; :风险变异体中第j个风险突变在下一流感季的预测流行度; 其中,所述识别流感病毒血凝素蛋白序列的每个位点上的氨基酸突变,筛选下一流感季的风险突变包括: 计算所述流感病毒血凝素蛋白序列任一位点的氨基酸类型在下一流感季的预测流行度,若满足所述预测流行度≥风险阈值且从当前流感季起近三个流感季中存在流行度<的条件,则将所述位点的氨基酸视为风险突变;其中风险阈值根据位点流行度和流感阳性率的线性拟合所得; 按照公式1-3计算所述任一位点处的氨基酸在下一个流感季的预测流行度: :位点i处氨基酸a在流感季s的流行度; :流感季s中位点i处为氨基酸a的序列数量; :流感季s的序列总数; :位点i处氨基酸a的流行度变化率; :位点i处氨基酸a在当前流感季的流行度; :位点i处氨基酸a在前一个流感季的流行度; :位点i处氨基酸a在下一流感季的预测流行度。
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