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龙图腾网获悉北京元码医学检验实验室有限公司申请的专利基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法和应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115198035B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-17发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202210932147.9，技术领域涉及：C12Q1/70；该发明授权基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法和应用是由倪守峰;王伟伟;刘星宇;张利利;田埂设计研发完成，并于2022-08-04向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法和应用在说明书摘要公布了：本发明公开一种基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法及应用。包括：获得生物样品的总RNA；使总RNA经过分离纯化得到mRNA；将mRNA与逆转录接头连接；使逆转录接头与纳米孔测序接头连接；通过链特异性测序，使带有病毒整合的mRNA的文库单链通过位于芯片的纳米孔，而不测序互补cDNA链，同时检测出病毒整合转录本和RNA上的修饰信息。本发明的方法具有长片段测序的优势，同时能够获取碱基修饰信息，实现了简单、准确的单分子水平检测。此外，本发明的方法能够避免反转录和PCR中的偏好性，以及逆转录和扩增过程中对RNA修饰信息的丢失，保留RNA天然属性，获得多种碱基变异，结构变异与修饰信息，从而能够区分高度相似的异构体、识别新转录本。

本发明授权基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法和应用在权利要求书中公布了：1.一种基于纳米孔测序同时获取HPV病毒整合转录本和RNA修饰的检测系统，其特征在于，包括： 纳米孔测序仪； 数据获取单元，其设置为能够通过调取所述纳米孔测序仪的测序结果获取来自生物样本的RNA中的至少碱基修饰数据，所述测序结果来自以下步骤：1 获得来源于生物样品的总RNA；2 使所述总RNA经过分离纯化得到mRNA；3 将所述mRNA与逆转录接头连接，在连接逆转录接头后进行逆转录和逆转录产物纯化，其中，使用逆转录试剂合成第一链cDNA，所述逆转录接头序列包括Oligo A：5’‑5PHOSGGCTTCTCTTTGCTTAGGTAGTAGGTTC和Oligo A’： 5’‑GAGGCGAGCGGTCAATTCCTAAGAGCAAGAAGCCTTTTTTTTTT；4 使步骤3中的逆转录接头与纳米孔测序接头连接，所述纳米孔测序接头序列包括：Oligo B：5’‑TGATGATGAGGGATAGACGATGGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTTTTTTTTTTATGATGCAAGATACGCAC‑3’和Oligo B’：5’‑GAGGCGAGCGGTCAATTTGCAATATCAGCACCAACAGAAACAACCATCGTCTATCCCTCATCATCAGAACCTACTA‑3’；5 使所述mRNA或其部分通过位于芯片的纳米孔，其中，所述芯片设置于电极附近，且所述电极能够检测通过所述纳米孔的电流，利用纳米孔长片段测序的序列片段大于1kb； 数据处理单元，其设置为能够分析所述碱基修饰数据以预测病毒基因插入候选位点，并基于预测结果判断病毒感染或其状态，所述病毒为人类乳头瘤病毒，所述数据处理单元能够进一步调取所述碱基修饰附近的序列信息，并将其与参考基因组比较，并基于比较结果来判断或确认病毒基因插入位点，其中，当序列中存在碱基修饰时，将含所述碱基修饰的1‑100bp范围内的指定序列与参考基因组比较，如果指定序列与参考基因组对应序列基本一致，则判定所述生物样本中没有病毒感染或没有病毒整合，如果与参考基因组对应序列相比，指定序列中存在多余序列或多余的多个连续碱基，则判定所述生物样本中的病毒为整合状态；和数据输出单元，其设置为输出病毒感染状态的结果。

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