北京安百胜诊断科技有限公司;天津市同因生物科技有限公司刘强获国家专利权
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龙图腾网获悉北京安百胜诊断科技有限公司;天津市同因生物科技有限公司申请的专利基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120913656B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511429423.X,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法是由刘强;王贻杰;李旋;罗绍柳;窦东梅;刘亚宁;陈亦果设计研发完成,并于2025-10-09向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法在说明书摘要公布了:本公开的实施例公开了基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法。该方法的一具体实施方式包括:基于初始化势能矩阵,确定训练样本集中各个训练样本的天然复合物平均能量值;对上述训练样本集中各个训练样本中的抗原抗体复合物晶体结构进行结构调整,以生成非结合构象集;对上述非结合构象集中各个非结合构象进行能量计算,以生成背景平均能量值;将上述天然复合物平均能量值与上述背景平均能量值之间的能量差确定为势能差;对上述非结合构象集中的各个非结合构象进行残基对接触频率统计,以生成残基频率矩阵;对上述初始化势能矩阵进行优化,得到优化势能矩阵。该实施方式可以提高对抗原抗体对接姿态预测的准确度。
本发明授权基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法在权利要求书中公布了:1.一种基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法,其特征在于,包括: 基于初始化势能矩阵,确定训练样本集中各个训练样本的天然复合物平均能量值,其中,所述初始化势能矩阵由预设的氨基酸序列中各个氨基酸之间的初始势能差构成,训练样本包括抗原抗体复合物晶体结构; 对所述训练样本集中各个训练样本中的抗原抗体复合物晶体结构进行结构调整,以生成非结合构象集; 基于所述初始化势能矩阵,对所述非结合构象集中各个非结合构象进行能量计算,以生成背景平均能量值; 将所述天然复合物平均能量值与所述背景平均能量值之间的能量差确定为势能差; 对所述非结合构象集中的各个非结合构象进行残基对接触频率统计,以生成残基频率矩阵; 根据所述势能差、所述残基频率矩阵和亲疏水性参数约束,对所述初始化势能矩阵进行优化,得到优化势能矩阵,其中,所述亲疏水性参数约束用于限制初始化势能矩阵中能量值的优化界限; 响应于确定所述势能差和当前训练轮次不满足预设收敛条件,将所述优化势能矩阵作为初始势能矩阵,再次进行初始化势能矩阵优化; 响应于确定所述势能差和或当前训练轮次满足预设收敛条件基于所述优化势能矩阵,对目标抗原抗体结合物文件进行构象预测,以生成最优结合构象。
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