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湘湖实验室(农业浙江省实验室)周正获国家专利权

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龙图腾网获悉湘湖实验室(农业浙江省实验室)申请的专利一种整合小RNA与DNA甲基化组学研究作物连作适应性的分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121438948B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202512019637.6,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种整合小RNA与DNA甲基化组学研究作物连作适应性的分析方法是由周正;钮宇翔;王晓;王涛;邓民;李培武设计研发完成,并于2025-12-30向国家知识产权局提交的专利申请。

一种整合小RNA与DNA甲基化组学研究作物连作适应性的分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种整合小RNA与DNA甲基化组学研究作物连作适应性的分析方法,包括以下步骤:W1和WM条件下采集小麦样品;鉴定W1和WM条件下的21~24nt‑siRNA簇;对24‑ntsiRNA簇进行差异表达分析;对于差异表达的24‑ntsiRNA,筛选出与差异甲基化区域DMRs重叠的簇,仅保留具有一致调控模式的配对,定义为RdDM作用位点,而后对siRNA靶基因进行预测。通过该分析方法,能够系统鉴定作物连作条件下的差异表达siRNA;结合全基因组甲基化数据WGBS,解析siRNA与差异甲基化区域DMRs的关联性;确定关键RdDM靶基因及其功能通路;构建siRNA–DNA甲基化—基因表达的多层级调控网络,为作物连作适应性与分子改良提供了理论依据与应用基础。

本发明授权一种整合小RNA与DNA甲基化组学研究作物连作适应性的分析方法在权利要求书中公布了:1.一种整合小RNA与DNA甲基化组学研究作物连作适应性的分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤S1,W1和WM条件下采集小麦样品,其中,W1为油菜-小麦轮作,WM为连续小麦耕种,具体的, 11于茎伸长期采集小麦旗叶和根系,分别进行RNA和DNA提取, 12对提取的RNA进行小RNA测序:对所提取的RNA中完整性RIN>4.0的样品建立小RNA文库; 13对提取的DNA进行全基因组亚硫酸氢盐测序,建立WGBS文库; 步骤S2,鉴定W1和WM条件下的21~24-ntsiRNA簇; 步骤S3,对24-ntsiRNA簇进行差异表达分析; 步骤S4,对于差异表达的24-ntsiRNA,筛选出与差异甲基化区域DMRs重叠的簇,仅保留具有一致调控模式的配对,定义为RdDM作用位点,而后对siRNA靶基因进行预测, 其中,步骤12还包括在建立小RNA文库后,对小RNA文库中的数据进行质控,去除poly-N序列、5’接头污染、缺失3’接头或插入标签的序列、不确定碱基比例超过10%的reads及碱基质量值5占比超过50%的reads后,生成高质量cleanreads,将高质量cleanreads与小麦参考基因组进行比对,保留完全匹配的序列; 步骤13还包括对建立的WGBS文库中的数据进行质控,切除接头adapter序列;如果整条read的碱基平均质量值低于15则去掉整条read;从序列的开头和末尾截掉碱基质量值小于5的碱基;去除clean后短于80bp长度的序列,最终得到高质量cleanreads,将高质量cleanreads与小麦参考基因组进行比对,允许最多两处错配,去除重复序列,提取CG、CHG和CHH背景下的胞嘧啶甲基化水平。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人湘湖实验室(农业浙江省实验室),其通讯地址为:311200 浙江省杭州市萧山区奔竞大道3300号钱湾生物港一期;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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