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崖州湾国家实验室杨军波获国家专利权

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龙图腾网获悉崖州湾国家实验室申请的专利一种基于基因组扫描的小麦差异转座元件的检测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121188513B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511726413.2,技术领域涉及:G06F18/231;该发明授权一种基于基因组扫描的小麦差异转座元件的检测方法是由杨军波;李立会;刘玲;凌宏清;牛建青设计研发完成,并于2025-11-24向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于基因组扫描的小麦差异转座元件的检测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于基因组扫描的小麦差异转座元件的检测方法,属于生物技术领域。本发明的核心聚焦于作物基因组TE差异检测的核心技术体系及其应用场景,包括检测方法和验证方法。保护基于ABD亚基因组SNP标签的同源序列区分方法,包括侧翼区SNP匹配率计算、滑动窗口校正算法及TE多态性提取程序等。本发明设定的上述检测方法有效解决了全基因组结构变异分析低效性、多倍体同源序列干扰导致的低检测特异性以及单一PCR引物对验证体系高假阳性的问题。

本发明授权一种基于基因组扫描的小麦差异转座元件的检测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于基因组扫描的小麦差异转座元件的检测方法,其特征在于,包括如下步骤: 1构建非冗余TE数据库并优化注释:整合RepBase、REPETDB公共数据库及denovo预测工具的注释结果,采用CD-HIT进行层次聚类去冗余,构建非冗余TE数据库;基于EDTA工具和所述非冗余TE数据库对待测样品进行TE注释,依据TE长度向两侧延伸侧翼序列获得侧翼-侧翼和侧翼-TE-侧翼序列;将获得的所述侧翼-侧翼和侧翼-TE-侧翼序列使用Minimap2对比待测样品进行差异TE鉴定; 2消除多倍体同源序列干扰:依据ABD亚基因组单核苷酸多态性数据库,筛选亚基因组特异SNP标签,构建亚基因组定位索引;在步骤1中所述Minimap2对比结果中评估侧翼区SNP标签匹配率,判定最优比对的亚基因组,实现TE来源判别;针对串联重复导致的序列偏移,采用滑动窗口法计算侧翼保守区一致性,定位TE插入端点; 3三重引物验证系统降低PCR假阳性率:通过构建左翼-TE、TE-右翼和左翼-右翼引物序列进行验证;若左翼-TE、TE-右翼与左翼-右翼引物同时扩增成功则判定为真实插入事件;若左翼-TE、TE-右翼扩增失败,左翼-右翼引物扩增成功则判定为真实缺失事件。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人崖州湾国家实验室,其通讯地址为:572025 海南省三亚市崖州区还金路8号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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