渊慧科技有限公司S·科尔获国家专利权
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龙图腾网获悉渊慧科技有限公司申请的专利使用辅助折叠网络预测蛋白质结构获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116325002B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202180069629.X,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权使用辅助折叠网络预测蛋白质结构是由S·科尔;O·罗内伯格;M·非古尔诺夫;A·普里泽尔设计研发完成,并于2021-11-23向国家知识产权局提交的专利申请。
本使用辅助折叠网络预测蛋白质结构在说明书摘要公布了:用于训练结构预测神经网络的方法、系统和装置,包括在计算机存储介质上编码的计算机程序,结构预测神经网络包括嵌入神经网络和主折叠神经网络。根据一个方面,一种方法包括:获得表征训练蛋白质的训练网络输入;使用嵌入神经网络和主折叠神经网络处理训练网络输入以生成主结构预测;对于一个或多个辅助折叠神经网络的集合中的每个辅助折叠神经网络,至少处理嵌入神经网络的对应中间输出以生成辅助结构预测;确定目标函数的梯度,目标函数包括关于辅助折叠神经网络中的每一个的相应辅助结构损失项;以及基于梯度更新嵌入网络参数和主折叠参数的当前值。
本发明授权使用辅助折叠网络预测蛋白质结构在权利要求书中公布了:1.一种训练结构预测神经网络的方法,其中,结构预测神经网络包括:i嵌入神经网络,嵌入神经网络具有多个嵌入参数并且被配置为接收表征蛋白质的网络输入并根据嵌入参数处理网络输入以生成关于网络输入的嵌入输出;以及ii主折叠神经网络,主折叠神经网络具有多个主折叠参数并且被配置为接收所述嵌入输出并根据主折叠参数处理主折叠输入以生成定义蛋白质的预测结构的主结构预测,所述方法包括: 获得表征训练蛋白质的训练网络输入和指定训练蛋白质的目标蛋白质结构的数据; 使用嵌入神经网络并根据嵌入参数的当前值来处理训练网络输入,以生成关于训练网络输入的训练嵌入输出; 使用主折叠神经网络并根据主折叠参数的当前值来处理训练嵌入输出,以生成定义训练蛋白质的主预测结构的主结构预测; 对于每个具有相应多个辅助折叠参数的一个或多个辅助折叠神经网络的集合中的每个辅助折叠神经网络,使用辅助折叠神经网络并根据辅助折叠神经网络的相应辅助折叠参数的当前值来至少处理嵌入神经网络的对应中间输出,以生成定义训练蛋白质的辅助预测结构的辅助结构预测; 确定目标函数的梯度,所述目标函数包括: 主结构损失项,表征以下之间的相似性:i由主结构预测定义的主预测结构和ii训练蛋白质的目标蛋白质结构;和 每个辅助折叠神经网络的相应辅助结构损失项,其表征以下之间的相似性:i由辅助结构预测神经网络生成的辅助结构预测定义的辅助预测结构和ii训练蛋白质的目标蛋白质结构;以及 基于梯度更新嵌入网络参数、主折叠参数和一个或多个辅助折叠神经网络的相应辅助折叠参数的当前值。
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