南通诺瞳奕目医疗科技有限公司;诺瞳奕目光学科技(丹阳)有限公司请求不公布姓名获国家专利权
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龙图腾网获悉南通诺瞳奕目医疗科技有限公司;诺瞳奕目光学科技(丹阳)有限公司申请的专利对接与RMSD优化的快速验证系统及方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121583390B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202610115068.7,技术领域涉及:G16C20/50;该发明授权对接与RMSD优化的快速验证系统及方法是由请求不公布姓名;请求不公布姓名设计研发完成,并于2026-01-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本对接与RMSD优化的快速验证系统及方法在说明书摘要公布了:本发明公开了应用于生物医药计算模拟领域的对接与RMSD优化的快速验证系统及方法,通过构建分子构象的多阶段筛选与误差补偿机制,在初始采样阶段采用离散化网格控制计算复杂度,在粗筛阶段利用快速能量函数压缩候选空间,在精修阶段引入梯度驱动的局部优化提升结构精度,在最终阶段部署基于神经网络的残差修正模块对系统性坐标偏差进行非线性校正,形成闭环优化流程,该流程在不依赖高计算成本的量子力学计算或长时间分子动力学模拟的前提下,将对接构象的均方根偏差稳定控制在零点五埃以内,同时保持单分子处理时间在五十毫秒量级,较传统高精度对接方法提速二十倍以上。
本发明授权对接与RMSD优化的快速验证系统及方法在权利要求书中公布了:1.对接与RMSD优化的快速验证方法,其特征在于:包括以下操作: 步骤S1、通过分子构象采样引擎模块对配体分子执行初始空间姿态遍历:所述遍历基于旋转键自由度划分的离散化扭转角网格,每个网格节点对应一个独立构象实例,所述构象实例的数量由预设的采样密度参数决定; 步骤S2、将所述构象实例输入粗粒度评分函数模块,所述粗粒度评分函数模块采用基于范德华势与静电势叠加的快速能量估算模型,对每个构象实例执行受体结合口袋内的空间适配度评估,保留评分值位于前百分之五的候选构象集; 步骤S3、对候选构象集执行局部几何精修操作,所述局部几何精修操作包含三轮迭代优化,每轮迭代中对配体分子的非键合原子施加基于梯度下降的空间位移修正,位移步长由当前轮次的收敛因子动态调节; 步骤S4、在完成局部几何精修后,启动残差结构偏差检测模块,提取配体分子中所有可旋转键连接的原子对,计算其在精修前后三维坐标的变化向量,构建局部几何不变量特征向量; 步骤S5、将所述局部几何不变量特征向量输入残差修正神经网络进行训练; 步骤S6、将所述残差修正神经网络输出的坐标修正量叠加至精修后构象的原子坐标上,生成最终优化构象; 步骤S7、在最终优化构象生成后,执行结构一致性验证流程,计算最终优化构象与原始晶体构象之间的均方根偏差,若均方根偏差大于零点五埃,则触发回溯机制,从候选构象集中选取评分次优的构象实例重新执行局部几何精修与残差修正流程,直至均方根偏差满足阈值要求或候选构象集耗尽; 所述执行结构一致性验证流程的具体操作包括如下:计算最终优化构象与原始晶体构象之间的均方根偏差,针对配体分子中的重原子;计算前执行刚性叠合操作,叠合目标为最小化重原子坐标集合的均方根偏差;若发现任何键长偏离标准值超过百分之十五或键角偏离标准值超过二十度,则自动触发局部结构重优化子程序,使用共轭梯度法在固定其余原子坐标条件下优化异常键或角的几何参数。
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