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  • 本申请提供一种基因模块分析方法、装置、设备及存储介质,涉及空间转录组学技术领域。该方法包括:获取时空组芯片表达数据并进行线性化处理,进行滑窗切割得到按空间顺序排列的多个窗口单元;计算基因功能活跃度并构建矩阵;进行聚类分群得到窗口分组;对窗口...
  • 本申请提出了一种多目标抗菌肽序列优化方法及系统,方法包括:基于初始肽段序列构建序列搜索树;对节点进行评分,选择当前节点;对当前节点进行点突变操作;基于改进需求将各候选肽段复制到对应的子种群中,进行局部优化得到新候选肽段,对各个新候选肽段进行...
  • 本发明提出了一种基于纳米孔测序的糖基化RNA修饰鉴定模型构建方法和系统,属于新一代信息技术中RNA修饰鉴定技术领域。从多种公共数据库来源融合二代/三代测序数据建立包含碱基特征序列、电流信号特征序列、各碱基修饰类型的高置信度训练集;利用训练集...
  • 本发明公开了一种基于微生物结构信息的重非水相污染场地刻画与分析方法,包括:基于历史地质勘察报告和历史泄漏事件并定义污染分析区域,采用高密度电阻率结合稳定同位素示踪法构建场地污染概念模型;对目标区域进行样本采集和检测,得到区域样本检测信息;根...
  • 本发明公开一种基于双重自编码器的单细胞数据深度聚类方法、设备及介质,涉及单细胞RNA测序技术领域。所述方法包括:获取单细胞的原始基因数据;构建scDAEC模型;所述scDAEC模型包括动态组合多头注意力机制、去噪自编码器和图自编码器;所述去...
  • 本发明涉及甲基化检测位点检测技术领域,尤其提供了一种早期胃癌淋巴结转移风险预测方法、系统、应用及介质,方法包含:获取包含DNA甲基化芯片数据集及RNA测序数据集的胃癌公共数据集,经过样本筛选、质控和分组处理,得到8个质控分组样本;将质控分组...
  • 本发明涉及一种基于蛋白质预训练模型的酶热属性改造方法、装置、电子设备及存储介质,属于生物信息学技术领域。本发明设计基于蛋白质预训练模型的酶热属性改造方法,通过引入蛋白质语言模型,仅基于序列信息即可提取高质量特征向量,无需依赖蛋白质结构信息,...
  • 本发明实施例涉及一种同源异构抗体批量生成与筛选任务的处理方法和装置,所述方法包括:基于RAAD模型框架构建第一生成模型;并构建一个用于对抗原‑抗体复合物的自由能和亲和力表征常数进行预测的第一预测模型;构建第一数据集和第二数据集对第一生成模型...
  • 本发明涉及一种基于基因组的动物杂交效应分析与预测方法及其应用,包括杂交效应分析,所述杂交效应分析具体包括区分基因型组合、确定表型最优值、为每个性状,分别用表型距离量化每个基因型组合的表型表现与表型最优值的偏差、为每个性状,计算每个基因型的杂...
  • 本发明提供了一种用于精准育种的动态多模态生物序列分阶段预训练系统,包含多模态数据组织单元,用于采集单模态序列、生成二模态配对序列并构建三模态互穿序列,模拟生物信息传递;统一序列表示单元,用于对各模态序列统一分词并添加模态标记;渐进式预训练策...
  • 本发明提出了一种基于特征解耦的单细胞空间转录组细胞定位与类型反卷积算法,利用深度学习技术进行单细胞伪空间重建和空间转录组细胞类型解卷积。该算法结合了特征解耦和跨域迁移学习方法,具体包括:编码器解耦特征、特征迁移、单细胞伪空间预测和空间转录组...
  • 本发明公开了基于Stereo‑seq的儿童AML白血病细胞空间分布及互作关系检测方法,涉及生物医学技术领域,其技术要点为:本发明利用Stereo‑seq技术构建检测方法,通过分析白血病细胞与免疫细胞之间的复杂互作机制,为阐明儿童AML白血病...
  • 本发明公开了基于固定长度聚合物计数法确定真菌细胞核数量的方法,涉及生物技术领域,通过对目标真菌生物进行高通量测序、固定长度聚合物计数统计、绘制序列覆盖度‑GC富集度的热密度图,分析目标真菌生物是否为双核。本方法可以在基因组结构研究阶段,通过...
  • 本发明提供了一种基因序列匹配方法、系统、计算机设备及存储介质,属于计算机领域,包括:获取待处理的DNA序列;定义主串S和子串T,确定主串S和子串T存储下标从1开始进行匹配,得到基因序列匹配结果;其中,主串S为完整的DNA序列,子串T为特定的...
  • 本发明涉及生物信息学技术领域,本发明涉及一种病原体宏基因组测序数据的分析方法,通过双阶段宿主过滤(尤其是ML精过滤)极大降低宿主背景,结合低丰度增强模块(UMI/去噪),使低丰度病原体的检出能力大幅提高,降低假阴性率;动态数据库整合确保覆盖...
  • 本申请提供一种卵母细胞表达数据的抽取方法及电子设备。该方法包括:基于卵巢样本切片的表达矩阵文件生成标准格式文件,其中包括每个测序位点的每个基因的表达量及测序位置;解卷积标准格式文件,得到每个测序位点的主导细胞类型,其中包括卵母细胞类;统计主...
  • 本发明公开了一种甲型流感病毒基因序列分支的划分方法、系统与设备,涉及生物信息学技术领域,包括步骤:读取用户输入的进化树结构文件和Fasta文件;根据设定的第一自定义参数和各子叶节点的基因序列数据,将进化树划分多个分支;根据设定的第二自定义参...
  • 本发明公开了一种ASO药物的筛选方法及装置,包括:获取靶点基因,确定靶点基因的pre‑mRNA序列;基于pre‑mRNA序列,通过逐碱基位移生成靶向序列库;基于靶向序列库,通过反向互补原则生成覆盖所有ASO序列设计空间的ASO序列库;基于确...
  • 本申请提供一种基于酶活性检测的单宁酶催化效率评估方法,包括:根据构象匹配度参数, 分析侧链长度分布对氢键形成数量和氢键断裂频率的影响, 提取构象能量差和动态自由能变, 确定氢键动态特征参数;若氢键动态特征参数中氢键断裂频率超过预设的阈值, ...
  • 本发明公开了一种尿液外泌体AD标志物的AI筛选方法及装置,该方法包括:获取尿液外泌体并提取蛋白质组、miRNA组及代谢物组数据,及获取检测目标历史采样的时序数据并提取AD标志物的动态变化特征;对蛋白质组、miRNA组及代谢物组数据进行处理,...
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