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一种基于蛋白质大语言模型的分子生成及优化方法
本发明涉及人工智能辅助药物发现领域,具体涉及一种基于蛋白质大语言模型的分子生成及优化方法,其方法包括:获取靶标蛋白质口袋的氨基酸序列信息和三维结构信息;利用基于蛋白质大语言模型构建的蛋白质编码器,对所述蛋白质口袋的氨基酸序列进行编码,得到蛋...
一种中药-疾病关联预测方法及装置
本发明提供一种中药‑疾病关联预测方法及装置,该方法包括:获取待预测的中药和疾病对;根据中药和疾病对以及预设的关联矩阵和特征库,得到中药包含的化学成分子集特征和疾病相关的蛋白质子集特征;对化学成分子集特征和蛋白质子集特征进行特征交互,并对交互...
一种基于分层动态异构图的药物-靶标智能推荐方法
本发明属于药物设计技术领域,具体涉及一种基于分层动态异构图的药物‑靶标智能推荐方法,包括:获取药物‑靶标数据输入训练好的药物‑靶标预测模型,得到相互作用分数;药物‑靶标预测模型的训练过程包括:获取药物‑靶标训练集和在旧药物上训练好的药物‑靶...
基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统
本发明公开了一种基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统,包括以下步骤:获取待预测的药物分子图结构、待预测的蛋白质分子图结构;对药物分子图结构进行编码,得到药物结构特征向量;对蛋白质分子图结构进行编码,得到蛋白质结构特征向量;对药物...
生成针对靶标生物的siRNA前体双链RNA序列的方法及装置与应用
本发明公开了生物信息学领域中生成针对靶标生物的siRNA前体双链RNA序列的方法及装置与应用。本发明所要解决的技术问题是如何设计针对于靶标物种的特异性siRNA的前体双链RNA。本发明分别基于转录组和蛋白质数据分析靶标物种的候选保守基因集进...
一种酶优化方法、系统、设备及介质
本发明公开了一种酶优化方法、系统、设备及介质,该方法首先提取目标酶的骨架,并对所提取的骨架进行填充,生成第一候选酶集合;其次,通过目标分子对接,筛除第一候选酶集合中在目标对接位点处对接性能较差的变体酶,得到第二候选酶集合;然后,通过盲对接,...
一种用于原发性醛固酮增多症亚型分类的生物标志物组、筛选方法及其应用
本发明涉及生物检测技术领域,尤其涉及一种用于原发性醛固酮增多症亚型分类的生物标志物组、筛选方法及其应用,该生物标志物包括蛋白组,蛋白组能够与醛固酮和/或肾素结合,蛋白组包括APOC3、CD56、CHGA、KRT5和AZGP1五种蛋白中的至少...
基于宏基因组的抗性基因分析方法
本发明涉及生物信息学技术领域,本发明涉及基于宏基因组的抗性基因分析方法,该方法创新性地将自适应数据预处理、动态知识图谱构建和图神经网络相结合,实现了对抗性基因传播机制的深度解析,通过三维关联网络模型与动态知识图谱的结合应用,分析效率提升:处...
纳米材料与蛋白质相互作用数据集构建方法、装置及介质
本发明涉及一种纳米材料与蛋白质相互作用数据集构建方法、装置及介质,其中方法包括:处理文献语料,提取得到一个或多个第一信息组;进行语义对齐获得未填充结构化特征数据;对所有第一信息组中的结构化特征数据填充缺失特征得到填充后的结构化特征数据;分别...
一种基于优化随机森林模型的基因组育种值预测方法
本发明提供一种基于优化随机森林模型的基因组育种值预测方法,涉及生物遗传学技术领域,该方法为对采集的基因组数据进行贡献度计算,得到加权特征矩阵;利用适应度评估方法,对加权特征矩阵的特征子集进行迭代更新,得到优化特征子集;利用优化特征子集,对随...
蛋白质补全方法、装置、计算机设备以及存储介质
本申请涉及一种蛋白质补全方法、装置、计算机设备以及存储介质。该方法包括:获取训练蛋白质集;训练蛋白质集包括多个训练蛋白质数据;每个训练蛋白质数据包括:缺失功能域的蛋白质结构、完整蛋白质结构、缺失功能域的蛋白质序列以及完整蛋白质序列;基于预设...
一种基于药物基因组检测的个体化用药全方位评估系统
本发明提供一种基于药物基因组检测的个体化用药全方位评估系统,涉及医疗技术领域。该基于药物基因组检测的个体化用药全方位评估系统中,本发明在个体化建模上,能根据患者基因型动态校准药物代谢参数,还可动态覆盖未知基因变异,构建真实代谢通路数学映射,...
一种基于二代测序数据检测嵌合率的方法和系统
本发明提供了一种基于二代测序数据检测嵌合率的方法和系统,属于嵌合体检测技术领域,该方法包括以下:基于嵌合态样本的测序数据获得所有marker的候选基因型和对应的读段计数,对于每个marker逐步进行分析以得到该marker下所有可能的嵌合率...
一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统
本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统。本发明根据蛋白质的序列和结构,提取蛋白质残基特征;利用蛋白质结构构建邻接矩阵,通过集成拉普拉斯特征向量和随机游走,充分表征残基图结构;将残基特征与残基图结构特征拼接作...
一种超高密度遗传图谱的构建方法及相关应用
本发明属于分子遗传学与生物信息学领域,尤其涉及一种超高密度遗传图谱的构建方法及相关应用。本发明提供一种高效、准确、适用于杂合F1群体的超高密度遗传图谱构建方法,以提升图谱精度和基因组覆盖率,并可用于后续的QTL分析与辅助育种。
一种耐药预测模型及预测方法
本发明公开了一种耐药预测模型及预测方法,属于生物信息学技术领域。该耐药预测模型通过动态地根据每个需要预测的样品能覆盖到的特征去训练专属于该样品的模型,然后进行该样品的耐药预测,克服了传统机器学习单一模型需要统一的特征检出的局限性;其在增加了...
一种基于S0CS5-CP关键结合氨基酸位点筛选硫酸苯乙肼的方法及应用
本发明属于分子生物学及药物筛选技术领域,提供了一种基于SOCS5‑CP关键结合氨基酸位点筛选硫酸苯乙肼的方法及应用,包括以下步骤:通过丙氨酸虚拟点突变筛选出SOCS5‑CP结合的关键氨基酸位点,确定结合口袋;通过配体分子,将结合口袋作为对接...
基于基因相对表达顺序的BRAF突变型结直肠癌分类系统
基于基因相对表达顺序的BRAF突变型结直肠癌分类系统,本发明涉及BRAF突变型结直肠癌分类系统。本发明的目的是为了解决现有BRAF突变型结直肠癌分类准确率低的问题。本发明利用BRAF分型的差异基因,通过分析其基因对的相对表达顺序,能够精准识...
一种基于自由能变进行突变位点筛选的处理方法和装置
本发明实施例涉及一种基于自由能变进行突变位点筛选的处理方法和装置,所述方法包括:构建码本检索模型、预训练框架、第一预测模型、第二预测模型;准备第一、第二数据集;基于预训练框架根据第一数据集训练码本检索模型;训练结束后,先基于码本检索模型的模...
基于多模型动态集成的DNA位点识别方法及装置
本申请适用于DNA位点识别技术领域,尤其涉及基于多模型动态集成的DNA位点识别方法及装置。方法包括:获取DNA序列;以所述DNA序列为输入,运行第一基模型,得到类概率向量Pj;所述第一基模型是基于深度森林算法的机器学习模型,j为所述第一基模...
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