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基于perl语言的基因组组装方法、系统、设备及存储介质
本申请公开了基于perl语言的基因组组装方法、系统、设备及存储介质, 获得高精度长Reads互作强度二维矩阵NormalForceMatrix;将二维矩阵NormalForceMatrix拆分, 获得高精度长Reads的聚类结果;根据高精度...
一种溶解曲线Tm值预测方法
本发明提供一种溶解曲线Tm值预测方法, 涉及生物检测技术领域, 包括以下步骤:构建Tm值标记模型和Tm值预测模型;获取待测样本的数据信息, 将数据信息输入Tm值标记模型;由Tm值标记模型对数据信息进行预处理并标记待测样本有无Tm值, 有Tm...
基于邻近CpG位点共甲基化状态的全基因组甲基化区域拆分方法
本发明属于生信分析技术领域, 具体涉及一种基于邻近CpG位点共甲基化状态的全基因组甲基化区域拆分方法。基于全基因组甲基化测序数据, 依据邻近CpG位点的共甲基化状态在全基因组范围内拆分甲基化区域, 为癌症等疾病诊断提供更多的甲基化区域信息,...
一种基于多引物设计的整合位点分析方法
本发明属于生物信息技术领域, 公开了一种基于多引物设计的整合位点分析方法, 包括以下步骤:在AAV载体序列的多个位置插入引物, 形成多引物载体;将所述多引物载体整合至宿主基因组中, 通过引物扩增捕获整合位点所在序列;针对整合位点所在序列进行...
基于多模态深度学习的蛋白质-RNA相互作用预测方法
本发明涉及多模态RNA特征融合与高置信数据集构建技术领域, 具体公开了一种基于多模态深度学习的蛋白质‑RNA相互作用预测方法, 建模并预测RBP结合模式, 应用计算技术对细胞系特异性RBP‑RNA相互作用进行分类, 并确定了不同细胞系之间结...
一种基于多模态自适应图对比学习的2′-O-甲基化位点预测方法
本发明涉及一种基于多模态自适应图对比学习的2′‑O‑甲基化位点预测方法, 包括:获取RNA分子, 基于RNA分子, 构建多模态图;对多模态图进行局部图结构增强和节点特征编码, 获取节点嵌入特征, 将节点嵌入特征输入自适应注意力融合模型, 获...
基于深度自编码压缩的全基因组测序数据基因组预测方法
本发明提供一种基于深度自编码压缩的全基因组测序数据基因组预测方法, 该方法:获取各个生物个体的全基因组测序数据, 全基因组测序数据包括多个基因型数据;对各个基因型数据分别进行预设格式转换, 根据转换后的数据构建对应于各个生物个体的基因型向量...
一种基于多任务学习的作物基因型到表型通用预测方法
一种基于多任务学习的作物基因型到表型通用预测方法, 该方法包括如下步骤:收集五种作物的基因型和表型数据集, 对基因型数据进行质控与编码, 对表型数据进行标准化处理;采用分层抽样方法, 按比例将数据集划分为训练集和测试集;以基因型数据为输入,...
一种基于元域对抗网络的多肽蛋白质相互作用预测方法
本发明涉及一种基于元域对抗网络的多肽蛋白质相互作用预测方法, 包括如下步骤:S1.构建样本的元域;S2.特征提取;S3.特征交互, 生成样本特征;S4.元域对抗训练:将样本特征送入元域分类器, 计算元域分类损失, 所述梯度反转层将来自元域分...
一种靶向TLR4的小分子化合物虚拟筛选方法
本发明公开了一种靶向TLR4的小分子化合物虚拟筛选方法。本发明通过三维分子对接, 筛选能结合TLR4的潜在化合物, 并通过实验验证, 初步证实Z1410232649、F27210326和HY‑N0029三个化合物有较好的TLR4抑制作用。其...
人工智能和生物传感的活血消异方关键质量属性辨识方法
本发明实施例公开一种人工智能和生物传感的活血消异方的关键质量属性辨识方法, 包括采集多组临床血清样本并进行测序;采用机器学习算法对多组测序结果进行数据处理并进行差异化表达分析, 筛选出关键RNA;获取活血消异方的多组分化学成分数据集并获得活...
一种基于多机制融合的药物靶标亲和力预测方法
本发明涉及一种基于多机制融合的药物靶标亲和力预测方法, 包括如下步骤:数据预处理与伪领域构建、基于深度学习的特征表示学习、特征交互、引入泛化机制、模型训练、模型评估以及推理应用阶段。预测模型采用的药物‑靶标相互作用泛化预测方法中融合伪领域的...
一种药物分子与靶标蛋白的结合亲和力预测方法
本申请涉及辅助药物设计技术领域, 公开了一种药物分子与靶标蛋白的结合亲和力预测方法, 包括如下步骤:(a)获取靶标蛋白的初始蛋白质特征表示与药物分子的初始分子特征表示;(b)将所述初始蛋白质特征表示与初始分子特征表示输入至一图交互网络中, ...
基于有向PPI网络和多种网络中心性算法探讨济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心成分、靶点及作用机制
基于有向PPI网络和多种网络中心性算法探讨济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心成分、靶点及作用机制本发明公开基于有向PPI网络和多种网络中心性算法探讨济生肾气丸治疗糖尿病肾病的核心成分、靶点及作用机制, 其通过筛选济生肾气丸活性成分并收集活性成分...
基于有向PPI网络和多种网络中心性算法探讨知柏地黄丸/汤治疗早期糖尿病肾病的核心成分、靶点及作用机制
本发明公开基于有向PPI网络和多种网络中心性算法探讨知柏地黄丸/汤治疗早期糖尿病肾病的核心成分、靶点及作用机制, 其通过筛选知柏地黄丸/汤活性成分并收集活性成分对应靶点信息、收集疾病相关靶点、获取药物‑疾病交集基因、构建有向蛋白质相互作用网...
使用自注意力神经网络的由氨基酸序列的蛋白质结构预测
本公开涉及用于确定由氨基酸序列指定的蛋白质的预测的三维结构的方法、系统和计算机存储介质。一种由一个或多个计算机进行的用于确定由氨基酸序列指定的蛋白质的预测的三维结构的方法, 所述方法包括:处理定义蛋白质的氨基酸序列的数据, 以对于所述蛋白质...
一种基于深度学习的鲜味肽预测方法及系统
本发明公开了一种基于深度学习的鲜味肽预测方法及系统, 该方法包括如下步骤:S1、构建数据集;S2、特征选择与处理;S3、构建Umami‑Transformer模型:构建包含特征处理与生成模块、序列信息处理模块、特征信息处理模块和结果输出模块...
一种基于自蒸馏深度学习的微生物菌株筛选方法
本发明涉及一种基于自蒸馏深度学习的微生物菌株筛选方法, 属于合成生物学和人工智能交叉领域。该方法通过对微生物菌株的DNA序列进行轻量化自蒸馏网络建模, 高效筛选蛋白表达量高的微生物菌株, 为成本与质量平衡的基因型‑表型设计提供了筛选工具。本...
一种基于糖脂代谢相关基因的子宫内膜癌预后预测模型及其构建方法
本发明提供了一种基于糖脂代谢相关基因的子宫内膜癌预后预测模型构建方法, 包括以下步骤:步骤1:获取包含基因表达和临床信息的数据, 并对数据进行预处理;步骤2:差异表达和预后基因筛选;步骤3:构建预后模型;步骤4:分析模型基因富集;步骤5:两...
磁盘测试方法、磁盘综合测试系统及电子设备
本申请提供一种磁盘测试方法、磁盘综合测试系统及电子设备, 涉及自动化测试技术领域。应用于磁盘综合测试系统, 该磁盘综合测试系统集成有性能测试模块、可靠性验证模块以及独立磁盘冗余阵列管理模块, 用户可以根据当前测试需求, 灵活选择目标测试类型...
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