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基于多图对比学习的图卷积网络在空间转录组中的空间域识别方法及系统
本发明涉及一种基于多图对比学习的图卷积网络在空间转录组中的空间域识别方法及系统。所述方法包括:对基因表达数据进行预处理,并从组织图像数据中提取出高层语义特征;构建原始邻接图、增强邻接图、基因表达矩阵、增强基因表达矩阵,得到多视图图结构;构建...
一种基于优化引物设计策略检测HLA相关基因染色体易位的方法
本发明一种基于优化引物设计策略检测HLA相关基因染色体易位的方法:对个体HLA相关基因进行测序后与HLA‑A、HLA‑B和HLA‑C基因参考序列进行比对,以实现初步分类;经SNP分析,从个体HLA相关基因进一步划分出HLA‑A1和HLA‑A...
一种基于自编码器的植物表型缺失数据插补方法
本发明提供一种基于自编码器的植物表型缺失数据插补方法,包括将具有缺失值的植物样本表型数据,输入训练后的最优自编码器模型,输出缺失表型预测值。最优自编码器模型的获取方法包括将植物样本数据各性状按预设占比进行隐藏得到测试集,并记录隐藏位置;在与...
组织结构划分方法、装置、设备、存储介质和程序产品
本申请涉及一种组织结构划分方法、装置、计算机设备、计算机可读存储介质和计算机程序产品。所述方法包括:根据空间转录组数据的密度图像数据进行组织结构划分,得到第一分层信息;基于空间转录组数据的细胞分群结果进行组织结构划分,得到第二分层信息;对第...
一种基于可变形注意力和双尺度学习的基因突变预测方法
本发明具体公开了一种基于可变形注意力和双尺度学习的基因突变预测方法,涉及病理图像处理技术领域。该方法步骤如下:S1、采集基因突变下的全切片病理图像,构建双尺度数据集;S2、提取双尺度数据集中每个病理图像的特征,构建特征图像集;S3、构建基因...
一种辣椒抗疫病基因定位与鉴定方法
本发明提供一种辣椒抗疫病基因定位与鉴定方法,涉及辣椒抗疫病领域。本发明包括使用SLAF‑seq技术测序、使用GATK软件对SNP检测和采用SNPNUM方法对△SNP‑i ndex拟合;所述使用SLAF‑seq技术测序是通过SLAF‑seq技...
基于图反应扩散模型的细胞间通讯动态分析方法及系统
本发明提供了基于图反应扩散模型的细胞间通讯动态分析方法及系统,涉及生物信息分析领域,包括:获取待分析的空间转录组数据, 同时引入配体‑受体反应数据库;基于配体‑受体反应数据库,利用菲克定律和质量作用定律,构建反应‑扩散偏微分方程组;引入图信...
一种抗结核药物靶点筛选方法及应用
本发明提供了一种抗结核药物靶点筛选方法及应用,具体涉及生物医药与生物信息学交叉技术领域。该筛选方法通过筛选分枝杆菌噬菌体无法注释功能的小分量杀菌蛋白,利用人工智能预测其与宿主必须蛋白的相互作用,并基于界面接触残基的进化保守性筛选出关键抑菌口...
一种基于全基因组选择技术利用下胚轴长度预测甘蓝型油菜密植产量的方法、装置及存储介质
本发明涉及生物信息学及作物育种技术领域,具体公开了一种基于全基因组选择技术利用下胚轴长度预测甘蓝型油菜密植产量的方法、装置及设备。核心在于:通过获取甘蓝型油菜种质的全基因组测序数据;将所述全基因组测序数据输入至目标模型;通过所述目标模型输出...
蛋白质和适配体的匹配方法、装置及计算机程序产品
本发明公开了一种蛋白质和适配体的匹配方法、装置及计算机程序产品。涉及生物信息技术领域,该方法包括:获取目标蛋白质序列和目标适配体序列;对目标蛋白质序列和目标适配体序列分别进行编码处理,得到第一蛋白质编码结果和第一适配体编码结果;采用第一蛋白...
一种生物信号异常值识别及区块链追溯方法及系统
本发明涉及生物信号技术领域,揭露了一种生物信号异常值识别及区块链追溯方法及系统,所述方法包括:分割原始多组学生物信号序列中的组学基元片段进行张量合成,得到高维组学特征向量;以高维组学特征向量中的因果关联强度为连接边,以组学特征维度为节点,构...
基于SNP分组选择与集成学习的猪生长性状预测方法
本发明公开了基于SNP分组选择与集成学习的猪生长性状预测方法,属于猪基因组预测技术领域。该方法包括:获取猪种群的基因型数据和生长性状表型数据,并对SNP位点进行标准化编码处理;基于欧氏距离与余弦距离的加权组合距离对SNPs进行K‑means...
一种基于大数据的薏苡种质资源遗传多样性评价方法
本发明公开了一种基于大数据的薏苡种质资源遗传多样性评价方法,包括:获取薏苡种质的基因组测序数据、高通量表型数据和地理环境信息,并预处理获得三元耦合矩阵,根据三元耦合矩阵通过张量分解筛选核心SNP,基于核心SNP的连锁不平衡关系构建遗传关联网...
基于稀疏深度神经网络的基因筛选与生存预测方法及系统
本发明公开了基于稀疏深度神经网络的基因筛选与生存预测方法及系统,涉及生物信息学与深度学习交叉技术领域,方法包括:获取经预处理的真实数据集与按规则生成的模拟数据集;将所述数据输入至采用多层正则化的稀疏深度神经网络模型中进行训练与测试。所述稀疏...
一种鸟兽角化组织线粒体DNA组装方法
本发明公开了一种鸟兽角化组织线粒体DNA组装方法:获取二代测序数据并裁剪低质序列生成clean文件;比对至线粒体参考基因组筛选同源序列得unclassified.sam;分析末端碱基损伤统计显著损伤确定参数N;转换SAM为mapped.fq...
一种蛋白质功能预测模型生成方法及系统
本发明公开了一种蛋白质功能预测模型生成方法及系统,属于生物信息学技术领域,具体包括:首先提取目标蛋白质的天然无序区域及其实验条件参数;基于区域特征检索构象数据库,获得附带多条件构象与功能注释的参考蛋白质集合;接着,构建融合目标与参考构象的条...
一种细胞间通讯网络解码方法、装置、设备及介质
本发明公开了一种细胞间通讯网络解码方法、装置、设备及介质,涉及细胞间通讯技术领域,包括:获取单个细胞组织样本的空间转录组数据,利用基因表达相关性筛选出候选基因对;结合基因表达分布空间距离特征和置换检验,将候选基因对的细胞间通信划分为多种通信...
基于多图神经网络与交叉注意力机制的抗真菌肽识别方法及系统
本发明涉及一种基于多图神经网络与交叉注意力机制的抗真菌肽识别方法及系统。所述方法包括:采用蛋白语言模型对处理后的数据集提取序列特征,并提取结构特征;将每个氨基酸残基作为图节点,建立无向边,构建肽特征图输入至多图神经网络中,通过各个图神经网络...
基于血清蛋白质组学预测抗NMDAR脑炎疾病严重程度和预后的预测模型、系统及其构建方法
本发明涉及生物医学检测技术领域,公开基于血清蛋白质组学预测抗NMDAR脑炎疾病严重程度和预后的预测模型、系统及其构建方法,克服现有技术的缺陷和不足,构建的预测模型能够用于动态预测抗NMDAR脑炎急性期严重程度及长期预后,包括:采集抗NMDA...
一种基于网络嵌套结构的药物靶标相互作用预测方法
本发明公开了一种基于网络嵌套结构的药物靶标相互作用预测方法,属于生物信息技术与机器学习技术。所述方法首先构建药物靶标二分网络,然后量化网络嵌套性;该量化过程引入概率零模型计算期望违背量以校正节点度差异,并结合节点对的局部相似度作为加权因子。...
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