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基于低成本DNA提取的豹纹鳃棘鲈泛基因组分型方法
本发明涉及基因分型领域,公开了基于低成本DNA提取的豹纹鳃棘鲈泛基因组分型方法,包括以下步骤:对豹纹鳃棘鲈进行DNA采样提取,用于构建重测序文库,重测序文库使用Shapet软件对所有高深度组的DNA数据进行处理,构建单倍型数据库,并对低深度...
用于处理或分析多物种核酸样品的组合物、方法和系统
本申请涉及用于处理或分析多物种核酸样品的组合物、方法和系统。本文提供用于样品处理和/或数据分析的组合物、方法和系统。样品处理可包括核酸样品处理和后续的测序。本公开内容的方法和系统可用于例如分析来自人类、非人类及其组合的核酸样品。
一种高效提取蛇尾纲基因组DNA的方法
本发明公开了一种高效提取蛇尾纲基因组DNA的方法。其包括如下步骤:将样品与裂解液、金属球混合后于‑20~‑10℃中40‑60Hz破碎250‑350s,破碎后的样品置于‑20~4℃中;将样品于50~60℃裂解4‑6min;2~4℃离心取上清,...
一种基于单囊泡膜蛋白组学注释囊泡细胞亚群的方法
本发明公开了一种基于单囊泡膜蛋白组学注释囊泡细胞亚群的方法,属于囊泡细胞注释技术领域。该方法包括以下步骤:步骤一:对血浆样本进行外泌体收集,得到样本;步骤二:对抗体探针进行编码标记,向抗体探针加入蛋白标签和标记DNA序列,得到标记抗体探针;...
一种构建地中海贫血结构变异长片段DNA模板的方法
本发明涉及一种构建长片段的地中海贫血结构变异DNA模板的方法,针对地中海贫血相关基因大片段缺失位置上下游分别设计特异性引物,并加上经尿嘧啶修饰且互补配对的连接引物,扩增完成后用UDG酶切割形成粘性单链末端后连接,进一步通过巢式PCR去除背景...
基于纳米磁珠的游离胎儿DNA富集及定量分析方法
本发明涉及基于纳米磁珠的游离胎儿DNA富集及定量分析方法,制备表面修饰有聚乙二醇(PEG)链刷的纳米磁珠,调控PEG链的密度与空间排列,在磁珠表面形成适配长度为140–160bp游离DNA的结构筛选层,捕获短片段DNA完成选择性富集;将功能...
一种高通量单细胞ATAC-seq测序文库的构建方法
本发明公开了一种高通量单细胞ATAC‑seq测序文库的构建方法,属于单细胞染色质可及性测序技术领域。所述方法包括:采用带有尿嘧啶脱氧核糖核苷酸的单一核酸特异序列与Tn5转座酶组装成Tn5转座酶复合体,该转座复合体可以随机结合靶DNA序列,进...
一种研究核酸-蛋白互作的方法
本发明提供了一种研究核酸‑蛋白互作的方法,属于生物技术领域。具体地,本发明通过反应体系配方改进,采用提升细胞膜或核膜的通透性,降低核酸片段释放温度的方案,提高了实验数据结果的信噪比、灵敏度、分辨率,提高了蛋白‑核酸互作研究的检测效果。
一种级联放大CRISPR-Cas核酸检测系统及其应用
本发明涉及生物检测技术领域,尤其涉及一种级联放大CRISPR‑Cas核酸检测系统及其应用。本发明基于化学修饰的封闭链实现了级联放大数字CRISPR‑Cas检测系统,能够达到结合聚合酶扩增的CRISPR‑Cas检测系统的灵敏度,又同时避免了扩...
一种基于CRISPR纳米传感器超灵敏检测β-葡萄糖基转移酶活性的方法
本发明属于生物纳米传感器领域,具体公开了一种基于CRISPR纳米传感器超灵敏检测β‑葡萄糖基转移酶(β‑GT)活性的方法。本发明设计了一种整合靶标识别、回文等温扩增和酶切位点多种功能的5‑hmC修饰哑铃探针,以及基于CRISPR纳米传感器,...
一种高通量筛选正确DNA分子的方法及其应用
本发明属于高通量基因筛选技术领域,具体涉及一种高通量筛选正确DNA分子的方法及其应用。该方法包括以下步骤:S1、将各目标基因的待筛选合成产物混合,得到各目标基因对应的DNA分子数量浓度相等的DNA pool;S2、DNA pool进行稀释;...
肺炎支原体/衣原体等温扩增技术联合胶体金检测方法
本发明提供一种肺炎支原体/衣原体联合检测方法,通过RPA预扩增(37℃±1℃, 5分钟)与LAMP靶向扩增(40℃±2℃, 15分钟)的级联反应高效富集靶基因。采用dUTP/UDG防污染系统及闭管操作流程,扩增产物直接与双标记胶体金探针混合...
基于微滴式数字PCR的反应体系及其应用
本申请提出了一种基于微滴式数字PCR的反应体系及其应用,涉及微流控技术领域。其中,基于微滴式数字PCR的反应体系及其应用包括:油相,所述油相包括基础油和硅表面活性剂;水相,所述水相包括PCR反应试剂和非离子表面活性剂。该反应体系适用于95℃...
一种基于高通量快速鉴定奶牛A1、A2基因型β-酪蛋白的方法
本发明公开了一种基于高通量快速鉴定奶牛A1、A2基因型β‑酪蛋白的方法,涉及分子标记领域的KASP技术,从而快速鉴定奶牛β‑酪蛋白的基因型。该方法的步骤:S1:根据β‑酪蛋白CSN2基因第67位核苷酸的突变位点(A→C),设计PCR引物;S...
无创外泌体mRNA BRAF V600E突变Tag-PCR检测方法、引物、探针及试剂盒
本发明公开一种无创外泌体mRNA BRAF V600E突变Tag‑PCR检测方法,包括:分离外泌体样本,外泌体样本来自体液;以mRNA为模板,加入外源性内参基因以及检测外源性内参基因的引物对,同时使用特异性富集外泌体mRNA BRAF基因V...
用于进行快速聚合酶链式反应的组合物、试剂盒和方法
公开了用于进行快速聚合酶链式反应(PCR)以扩增生物样品中的靶核酸的组合物、试剂盒和方法。该方法包括使用至少一种杂交稳定剂和/或在扩增过程的起始和增殖阶段之间调整热循环概况。还公开了在其扩增后检测靶核酸的方法,以及可用于所述方法中的反应混合...
基于DNA条形码技术的蜂蜜中植物源成分非靶向鉴别分析方法
本发明提供了一种基于DNA条形码技术的蜂蜜中植物源成分非靶向鉴别分析方法,通过DNA条形码技术对蜂蜜样品进行鉴定。建立蜂蜜样品高质量DNA的提取和评价方法,并筛选出最优DNA条形码,建立蜂蜜样品植物源性成分高通量非靶向筛查方法,该研究对保障...
一种基于CRISPR和脱氧核酶的镉离子及铅离子检测系统及检测方法
本发明公开了一种基于CRISPR和脱氧核酶的镉离子及铅离子检测系统及检测方法,包括,利用靶标离子与识别探针形成活性脱氧核酶,切割底物探针中的冗余序列,释放半激活子,并与体系中的另一半激活子协同激活CRISPR‑Cas12a活性。该系统利用半...
一种羊膜上皮细胞中非目标细胞的检测方法
本发明公开了一种羊膜上皮细胞中非目标细胞的检测方法,包括检测以下基因标志物中一种或多种的试剂:FCGBP、RNASE6、DAB2、STAB1、RAB3IL1、CSF1R、CD68、CD209、EGFL7、LGALS2、LILRB4、HLA‑...
一种miR-223-3p表达检测的引物及其制备方法和应用
本发明涉及一种miR‑223‑3p表达检测的引物及其制备方法和应用,所述miR‑223‑3p表达检测的引物包括miR‑223‑3p的正向引物、miR‑223‑3p的反向引物,所述miR‑223‑3p的正向引物的碱基序列如SEQ ID NO ...
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