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综合多组学解析免疫代谢与AD疾病相关基因的方法和装置
本申请公开了综合多组学解析免疫代谢与AD疾病相关基因的方法和装置。所述方法包括:获取AD患者的单细胞测序数据;获取AD患者免疫细胞和代谢物的GWAS数据;筛选出独立的单核苷酸多态性SNPS;通过孟德尔随机化因果推断,获得因果关联的免疫细胞特...
一种蛋白质疏水性的预测方法及系统
本发明提供一种蛋白质疏水性的预测方法及系统,涉及生物技术领域,方法包括:获取蛋白质的一级结构序列和三维结构数据;对一级结构序列进行特征提取,得到互信息特征向量和自相关特征向量;将互信息特征向量和自相关特征向量进行拼接,得到目标特征向量;将目...
一种测序数据处理方法
本公开提供了一种测序数据处理方法,其中,该方法包括:获取有关母体外周血浆无细胞的DNA测序数据;通过对DNA测序数据进行特征处理,确定具有最高随机森林分类准确度的特征数据;将特征数据输入至预先训练好的集成分类模型,确定集成分类模型输出的分类...
筛选肿瘤新抗原肽的评分模型、方法及系统
本发明涉及一种筛选肿瘤新抗原肽的评分模型、方法及系统,所述评分模型用于筛选肿瘤新抗原肽,其构建方法包括:获取多个受试者的肿瘤组织和正常组织的全外显子组测序数据、肿瘤组织的全转录组测序数据及变异多肽片段的免疫原性结果;处理所述测序数据,获得对...
一种基于2b-RAD技术的卵形鲳鲹生长性状相关QTL的定位方法及应用
本发明公开了一种基于2b‑RAD技术的卵形鲳鲹生长性状相关QTL的定位方法及应用,该方法利用2b‑RAD技术对300份卵形鲳鲹全同胞F1代及父母本个体进行测序并开发SNP标记,构建了卵形鲳鲹高密度遗传连锁图谱,结合8个生长表型数据进行连锁定...
基于双通道卷积神经网络的植物育种方法以及装置
本申请公开了基于双通道卷积神经网络的植物育种方法以及装置,包括:确定目标植物、目标植物中的多种指定化合物以及各种指定化合物中的多个SNP位点;从多个SNP位点中,筛选出用于覆盖全基因组的多个第一标签SNP位点,并将各个第一标签SNP位点确定...
一种整合基因组选择的选配方法与应用
本发明公开了一种整合基因组选择的选配方法与应用,属于地方畜禽遗传资源保护与遗传改良领域。针对现有基因组选择侧重遗传进展忽视群体多样性、基因组选配多用于杂交生产适配纯种保种不足的问题,该方法先构建模拟育种群体及以宁乡猪为代表的2000头左右参...
一种整合遗传优势与缺陷的肉牛基因组选配方法及应用
本发明涉及动物育种技术领域,具体公开了一种整合遗传优势与缺陷的肉牛基因组选配方法及应用,包括以下步骤:S1、从待配的种公牛和待配母牛中分别提取肉牛个体DNA样本进行基因分型,获取个体的SNP基因型数据;S2、根据VanRaden算法计算加性...
基于全基因组SNP的花生品质性状选择育种方法及应用
本发明公开了基于全基因组SNP的花生品质性状选择育种方法及应用,涉及农作物育种技术领域,该方法的具体步骤为:数据获取、SNP优化与标记筛选、模型构建和新品系培育;本发明通过整合全基因组重测序、SNP优化标记筛选与混合深度学习模型构建,实现了...
一种BRCA1/2基因意义未明变异的功能验证方法
本发明公开了一种BRCA1/2基因意义未明变异的功能验证方法。通过在每次实验中仅引入一个目标变异,并结合优化的gRNA和模板设计,我们的方法确保了目标变异在编辑后细胞群体中具有较高的初始丰度,从而显著降低了二代测序检测和表型分析的背景噪音,...
一种针对人源细胞产品的整合型STRaM特征基因标记谱评估系统
本发明公开了一种针对人源细胞产品的整合型STRaM特征基因标记谱评估系统,涉及细胞生物学和基因组学领域,包括第一评估组件、第二评估组件和第三评估组件,所述第一评估组件为原创的样品纯度算法,用于构建样品纯度测试方法;所述第二评估组件用于进行多...
一种基因组层级式特征筛选方法、装置及电子设备
本发明提供了一种基因组层级式特征筛选方法、装置及电子设备,属于计算机、医学和育种技术领域,其方法包括:将每个SNP位点上的基因型信息进行染色体分组,对分组后的各染色体均进行缺失基因型填充,并将填充后的所有染色体进行染色体合并,得到一级特征基...
一种冠状病毒样本的检测方法
本发明涉及病毒溯源技术领域,具体公开了一种冠状病毒样本的检测方法,包括如下步骤:S1、获取目标样本的高通量原始测序数据;S2、将原始测序数据输入动态学习型识别模型,输出各病毒谱系及每个谱系的可信度;S3、对原始测序数据进行噪声感知变异检测;...
一种筛选饮食-帕金森病(PD)关联性基因的方法及系统
本发明提供一种筛选饮食‑帕金森病(PD)关联性基因的方法及系统。本发明首先对转录组数据集GSE8397和GSE20295进行差异分析;通过WGCNA构建基因模块;整合8类饮食表型靶标基因集(高胆固醇/高糖/高脂肪/高碳水化合物饮食及鸡蛋/全...
一种用于NGAL检测的适配体生物传感器及其筛选方法
本发明公开了一种用于NGAL检测的适配体生物传感器及其筛选方法,包括:1)原始适配体的筛选;2)理性截短探索最小活性结构;3)计算机虚拟筛选;4)分子对接验证优化适配体。基于筛选的高亲和力适配体278A,构建的电化学传感器,包含聚亚甲基蓝修...
一种有性生殖动物种系突变率的测量方法及应用
本发明提供了一种测量有性生殖动物全基因组水平核苷酸种系突变率的方法。所述方法包括以下步骤:(1)对待测物种进行基因组测序,得到待测物种的所有编码蛋白的序列;(2)构建待测物种的系统发育树;(3)获取待测物种与近缘种之间的分歧时间Tdiver...
一种植物单细胞基因表达预测方法、系统、设备及介质
本发明涉及生物信息学、人工智能与植物基因组学交叉技术领域,公开一种植物单细胞基因表达预测方法、系统、设备及介质,植物单细胞基因表达预测模型通过门控交叉注意力机制实现DNA序列与染色质可及性信号的动态特征融合,有效解决传统单模态模型无法建模调...
癌细胞线粒体生物标志物及基于机器算法筛选的方法
癌细胞线粒体生物标志物及基于机器算法筛选的方法,当所述癌细胞为结直肠癌时,其线粒体生物标志物包括:OXCT1、CLPB、SLC25A12、MRPL51、SFXN1、GATM和TRMT10C基因。所述筛选的方法为:(1)将待筛选癌细胞的表达数...
动态权重与跨物种数据的时序建模、评分方法及基因组合
本发明提供一种动态权重与跨物种数据的时序建模、评分方法及基因组合,属于生物信息处理与数据建模技术领域。本申请的技术方案基于多源组数据,通过因果网络构建、时间序列插值和多阶段模型训练,筛选出与卒中过程密切相关的特征基因,构建动态权重函数,形成...
基于机器学习模型的判断荧光定量PCR信号Ct值与样本阴阳性的方法和系统
本发明属于基因检测技术领域,具体为基于机器学习模型的判断荧光定量PCR信号Ct值与样本阴阳性的方法:对原始荧光PCR信号进行预处理,矫正跳变、拱形、低模板量及两段式异常信号;采用多参数Sigmoid函数对矫正后信号进行非线性拟合,得到光滑的...
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