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  • 本发明公开了基于固定长度聚合物计数法确定真菌细胞核数量的方法,涉及生物技术领域,通过对目标真菌生物进行高通量测序、固定长度聚合物计数统计、绘制序列覆盖度‑GC富集度的热密度图,分析目标真菌生物是否为双核。本方法可以在基因组结构研究阶段,通过...
  • 本发明提供了一种基因序列匹配方法、系统、计算机设备及存储介质,属于计算机领域,包括:获取待处理的DNA序列;定义主串S和子串T,确定主串S和子串T存储下标从1开始进行匹配,得到基因序列匹配结果;其中,主串S为完整的DNA序列,子串T为特定的...
  • 本发明涉及生物信息学技术领域,本发明涉及一种病原体宏基因组测序数据的分析方法,通过双阶段宿主过滤(尤其是ML精过滤)极大降低宿主背景,结合低丰度增强模块(UMI/去噪),使低丰度病原体的检出能力大幅提高,降低假阴性率;动态数据库整合确保覆盖...
  • 本申请提供一种卵母细胞表达数据的抽取方法及电子设备。该方法包括:基于卵巢样本切片的表达矩阵文件生成标准格式文件,其中包括每个测序位点的每个基因的表达量及测序位置;解卷积标准格式文件,得到每个测序位点的主导细胞类型,其中包括卵母细胞类;统计主...
  • 本发明公开了一种甲型流感病毒基因序列分支的划分方法、系统与设备,涉及生物信息学技术领域,包括步骤:读取用户输入的进化树结构文件和Fasta文件;根据设定的第一自定义参数和各子叶节点的基因序列数据,将进化树划分多个分支;根据设定的第二自定义参...
  • 本发明公开了一种ASO药物的筛选方法及装置,包括:获取靶点基因,确定靶点基因的pre‑mRNA序列;基于pre‑mRNA序列,通过逐碱基位移生成靶向序列库;基于靶向序列库,通过反向互补原则生成覆盖所有ASO序列设计空间的ASO序列库;基于确...
  • 本申请提供一种基于酶活性检测的单宁酶催化效率评估方法,包括:根据构象匹配度参数, 分析侧链长度分布对氢键形成数量和氢键断裂频率的影响, 提取构象能量差和动态自由能变, 确定氢键动态特征参数;若氢键动态特征参数中氢键断裂频率超过预设的阈值, ...
  • 本发明公开了一种尿液外泌体AD标志物的AI筛选方法及装置,该方法包括:获取尿液外泌体并提取蛋白质组、miRNA组及代谢物组数据,及获取检测目标历史采样的时序数据并提取AD标志物的动态变化特征;对蛋白质组、miRNA组及代谢物组数据进行处理,...
  • 本发明涉及植物育种的技术领域,提供了一种玉米分子标记辅助回交育种电子模拟方法及系统,其方法包括:针对携带已知目标基因的第一组单株,采集表现出新生性状的全基因组分子标记数据;采集已知目标基因的供体亲本的全基因组分子标记数据;采集已知目标基因的...
  • 本申请适用于DNA位点识别技术领域,尤其涉及基于多模型动态集成的DNA位点识别方法及装置。方法包括:获取DNA序列;以所述DNA序列为输入,运行第一基模型,得到类概率向量Pj;所述第一基模型是基于深度森林算法的机器学习模型,j为所述第一基模...
  • 本发明实施例涉及一种基于自由能变进行突变位点筛选的处理方法和装置,所述方法包括:构建码本检索模型、预训练框架、第一预测模型、第二预测模型;准备第一、第二数据集;基于预训练框架根据第一数据集训练码本检索模型;训练结束后,先基于码本检索模型的模...
  • 基于基因相对表达顺序的BRAF突变型结直肠癌分类系统,本发明涉及BRAF突变型结直肠癌分类系统。本发明的目的是为了解决现有BRAF突变型结直肠癌分类准确率低的问题。本发明利用BRAF分型的差异基因,通过分析其基因对的相对表达顺序,能够精准识...
  • 本发明属于分子生物学及药物筛选技术领域,提供了一种基于SOCS5‑CP关键结合氨基酸位点筛选硫酸苯乙肼的方法及应用,包括以下步骤:通过丙氨酸虚拟点突变筛选出SOCS5‑CP结合的关键氨基酸位点,确定结合口袋;通过配体分子,将结合口袋作为对接...
  • 本发明公开了一种耐药预测模型及预测方法,属于生物信息学技术领域。该耐药预测模型通过动态地根据每个需要预测的样品能覆盖到的特征去训练专属于该样品的模型,然后进行该样品的耐药预测,克服了传统机器学习单一模型需要统一的特征检出的局限性;其在增加了...
  • 本发明属于分子遗传学与生物信息学领域,尤其涉及一种超高密度遗传图谱的构建方法及相关应用。本发明提供一种高效、准确、适用于杂合F1群体的超高密度遗传图谱构建方法,以提升图谱精度和基因组覆盖率,并可用于后续的QTL分析与辅助育种。
  • 本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统。本发明根据蛋白质的序列和结构,提取蛋白质残基特征;利用蛋白质结构构建邻接矩阵,通过集成拉普拉斯特征向量和随机游走,充分表征残基图结构;将残基特征与残基图结构特征拼接作...
  • 本发明提供了一种基于二代测序数据检测嵌合率的方法和系统,属于嵌合体检测技术领域,该方法包括以下:基于嵌合态样本的测序数据获得所有marker的候选基因型和对应的读段计数,对于每个marker逐步进行分析以得到该marker下所有可能的嵌合率...
  • 本发明提供一种基于药物基因组检测的个体化用药全方位评估系统,涉及医疗技术领域。该基于药物基因组检测的个体化用药全方位评估系统中,本发明在个体化建模上,能根据患者基因型动态校准药物代谢参数,还可动态覆盖未知基因变异,构建真实代谢通路数学映射,...
  • 本申请涉及一种蛋白质补全方法、装置、计算机设备以及存储介质。该方法包括:获取训练蛋白质集;训练蛋白质集包括多个训练蛋白质数据;每个训练蛋白质数据包括:缺失功能域的蛋白质结构、完整蛋白质结构、缺失功能域的蛋白质序列以及完整蛋白质序列;基于预设...
  • 本发明提供一种基于优化随机森林模型的基因组育种值预测方法,涉及生物遗传学技术领域,该方法为对采集的基因组数据进行贡献度计算,得到加权特征矩阵;利用适应度评估方法,对加权特征矩阵的特征子集进行迭代更新,得到优化特征子集;利用优化特征子集,对随...
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