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  • 本发明公开了一种生物活性肽基础模型预训练方法及装置,属于人工智能与生物信息学交叉技术领域。该方法构建包含分子图结构、氨基酸序列及功能注解文本的多模态数据集,分别通过路径感知动态图注意力网络和类PeptideBERT大语言模型提取结构与语义特...
  • 本发明提供包含病毒粒子的试样的评价方法、包含病毒粒子的试样的评价装置以及计算机程序产品。一种包含病毒粒子的试样的评价方法包括以下步骤:准备通过对多个具有由质量已知的蛋白质构成的衣壳的规定的病毒粒子进行分析而获取的这多个病毒粒子的该衣壳的每个...
  • 本发明公开了一种基于图神经网络挖掘与非生物胁迫响应相关的植物lncRNA的方法,包括以下步骤:获取非生物胁迫语义特征与植物的lncRNA和miRNA特征,构建对应的相似网络,生成lncRNA和miRNA的互作网络,并分别获取lncRNA、m...
  • 本发明公开了一种由拓扑数据分析引导基因网络嵌入的基因调控推断方法,结合了TDA和GNN,以增强基因调控网络推断能力,通过TDA特征捕捉基因调控网络图的拓扑结构,从而增强模型对基因表达的建模能力,通过门控融合有效整合TDA特征与GAT嵌入表示...
  • 本发明涉及微生物生态技术领域,尤其涉及一种富集系统中微生物核心物种组合识别方法,本发明通过引入环境参数的动态变化率作为目标变量,通过基于机器学习的广义集合商优化模型,能够高效、特异地捕捉微生物丰度与环境参数间负相关的关系,成功解决了在识别诸...
  • 本发明涉及医学信息处理技术领域,尤其涉及一种基于生物知识图谱的多尺度特征融合药物相互作用预测方法。该方法包括:获取待预测药物的分子结构数据、生化代谢通路数据和副作用数据;基于分子结构数据,确定第一待预测药物的第一节点特征和第二待预测药物的第...
  • 本发明公开了一种基于多组学联合的发酵微生物动态筛选与组成方法,在发酵设备上获取三个发酵阶段下的发酵样本;基于发酵样本提取微生物和代谢产物;对微生物分别进行基因组学分析、转录表达谱分析和蛋白质组学分析,同时对代谢产物进行代谢组学分析,得到关键...
  • 本发明提供了基于多模态识别与遗传特征关联分析的小麦条锈病抗性判定方法,包括:构建小麦条锈病抗性鉴定试验群体,进行发病诱导;获取小麦发病期间的多模态原始数据;对多模态原始数据进行预处理,得到标准化多模态数据;基于标准化多模态数据,提取表型特征...
  • 本发明公开了一种小分子结合蛋白设计方法,包括如下步骤S1、结构获取步骤:获取目标小分子配体与蛋白的复合物结构;S2、候选序列生成步骤:根据步骤S1的所述复合物结构,采用蛋白生成模型,并调节所述蛋白生成模型对应的参数,生成候选蛋白序列集合;S...
  • 本发明提供一种基于氨基酸代谢耦合特征预测反刍动物肌肉品质方法及系统,包括获取反刍动物的代谢过程动态变化信息和代谢产物关联流动信息,确定氨基酸代谢流特征;基于氨基酸代谢流特征进行代谢流耦合关联动态建模,生成动态耦合关联特征;将动态耦合关联特征...
  • 本发明公开了一种基于理化特征的MHC结合肽亲和力预测方法及系统,涉及生物信息学技术领域,包括:根据肽段序列、MHC伪序列中每个氨基酸的理化特征和各理化特征的预设权重构建理化感知偏置矩阵;将理化感知偏置矩阵通过前馈网络映射至预设的交叉注意力模...
  • 本发明公开了一种基于条件潜在扩散模型的抗菌肽生成筛选方法,在连续潜空间中对抗菌肽序列分布进行建模,通过条件约束实现抗菌肽序列的可控生成,并结合多级计算筛选与实验验证策略,提高抗菌肽发现过程的效率和可靠性;从而解决现有抗菌肽设计方法中由于序列...
  • 本发明提供了一种基于多智能体的核酸序列迭代优化方法,包括:获取待优化的核酸序列并设定多个目标;调用多单目标智能体对核酸序列进行多单目标评估给出单目标优化策略;调用假设生成智能体来整合多单目标优化策略形成统一优化策略,调用序列生成智能体生成多...
  • 本发明公开了一种基于TCR免疫组库的免疫状态和免疫年龄评估方法及其系统,属于免疫监测技术领域。本发明通过获取目标人员的TCR测序结果,所述TCR测序结果包括目标人员对应的第一测序数据,根据所述TCR测序结果确定多维度特征数据集,根据所述多维...
  • 本公开的实施例涉及一种用于处理探针板的方法。该方法包括基于探针板的测序结果和参考序列,确定第一比对结果,参考序列是用于合成探针板的探针的序列。该方法还包括基于对第一比对结果的筛选,确定第二比对结果。以及该方法还包括基于第一比对结果和第二比对...
  • 本发明提供了食管鳞状细胞癌前病变进展预警免疫组化标志物,基于免疫组织化学(IHC)的标志物预测食管鳞状细胞癌前病变进展。具体地,本发明证明结合了p53和γH2AX的IHC评分对食管癌前病变的进展具有稳健和持久的预测性能,解决了当前食管鳞状细...
  • 本发明提供了一种基于多组学策略的棉花籽粒大小基因鉴定的方法及装置,包括:根据棉花种质材料对应的图像数据,识别棉花种质材料对应的多项表型数据;基于多项表型数据得到用于表征棉花籽粒大小的复合表型数据,并基于复合表型数据进行全基因组关联分析,以在...
  • 本发明属于疾病预后和分子生物学技术领域,具体涉及一种原发性中枢神经系统淋巴瘤预后分析标志物、预后分析系统及其应用。具体的,本发明提供一种原发性中枢神经系统淋巴瘤预后分析标志物,所述预后分析标志物包括年龄、ECOG评分和MYC蛋白,并进一步构...
  • 本发明涉及3D基因组学分析技术领域,具体涉及一种易用且改进的跨物种Hi‑C接触图比较框架,包括:数据处理、矫正、优化、诊断、解读及全流程处理模块,通过标准化Cooler/.mcool格式输入输出,经智能预处理、多重误差矫正、动态指标优化、智...
  • 本公开提供了一种蛋白质突变预测方法和装置,属于生物学与人工智能交叉领域。本公开通过获取待预测蛋白质的氨基酸序列信息及三维结构信息;基于氨基酸序列信息和三维结构信息,构建第一多模态特征图;第一多模态特征图包含节点特征和边特征,且不包含显式的进...
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