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一种基于机器学习和血清miRNA构建早期HCC预测模型的方法
本发明属于医学诊断的技术领域, 具体涉及一种基于机器学习和血清miRNA构建早期HCC预测模型的方法。利用大规模血清miRNA芯片数据集和机器学习驱动的分析流程, 该流程结合了特征选择和堆叠集成建模, 利用公共血清miRNA芯片数据集识别早...
一种基于粒球计算的单细胞转录组数据聚类方法及系统
本申请属于生物信息学与数据挖掘技术领域, 公开了一种基于粒球计算的单细胞转录组测序数据聚类方法及系统, 该方法包括:对单细胞转录组测序数据进行预处理, 预处理包括数据降维;基于降维后的数据构造稳定的粒球空间, 粒球空间由覆盖单细胞样本的多个...
一种基于星比对结果的核酸多序列重比对方法
本发明属于生物信息领域, 提供一种基于星比对结果的核酸多序列重比对方法, 用以提升星比对工具在不同数据类型上的适应性和比对灵敏度。本发明首先采用滑动窗口对初始核酸多序列比对矩阵中所有序列进行相似度计算, 识别得到低相似度序列, 并对所有低相...
大数据结合人工智能筛选植物互作蛋白及利用酵母双杂交验证蛋白互作的方法
本发明属于生物技术领域, 公开了大数据结合人工智能筛选植物互作蛋白及利用酵母双杂交验证蛋白互作的方法。本发明使用了AI结合大数据的方式, 首先通过大数据筛选分析到家族蛋白的共表达蛋白。对这些蛋白进行AI互作预测与分子对接, 进一步分析提取其...
一种生物大分子序列结构预测方法
本申请公开了一种生物大分子序列结构预测方法, 涉及计算机技术领域, 本申请通过在扩散过程中引入几何位置编码门控机制, 利用多尺度注意力广播机制对所处理的目标信息的不同注意力类型相对应的注意力权重采取不同的广播范围方式广播, 广播范围内不同时...
一种基于纳米孔测序的病原体基因序列检测分析方法
本发明公开了一种基于纳米孔测序的病原体基因序列检测分析方法, 涉及海关检疫领域, 该方法包括:对采集样本进行纳米孔测序, 获取原始测序数据, 并进行质量筛选, 得到高质量序列。完成物种分类和突变识别, 提取病原体类型与突变特征。基于分类信息...
高通量测序结果变异信息的自动识别与可视化方法及装置
本申请公开了一种高通量测序结果变异信息的自动识别与可视化方法及装置, 方法包括:计算机设备获取高通量测序结果;计算机设备对高通量测序结果进行解析, 根据各个测序样本对应的变异类型, 提取各个测序样本对应的至少一个目标变异信息字段的字段值;计...
基于转录组分析筛选大豆拟茎点种腐病响应基因的方法
本发明提供了一种基于转录组分析筛选大豆拟茎点种腐病响应基因的方法, 通过选取田间种植的大豆感染拟茎点种腐病植株和健康植株的豆荚, 进行转录组测序, 筛选大豆中响应拟茎点种腐病菌的差异表达基因, 分析差异表达基因参与拟茎点种腐病感病过程中的生...
基于单细胞表达谱数据的RNA结合蛋白富集分析方法
本发明公开了基于单细胞表达谱数据的RNA结合蛋白富集分析方法, 使用Shiny编写为交互式的在线Web应用程序, 搭载数据可视化工具, 数据库使用RBP‑基因数据库;专为单细胞数据设计, 可以整合不同单细胞数据进行富集分析, 有效捕捉和分析...
一种非小细胞肺癌EGFR突变状态预测方法
本发明属于智能医疗领域, 提供了一种非小细胞肺癌EGFR突变状态预测方法, 包括:患者信息采集、3D深度学习模型预测、多实例学习模型预测以及联合模型预测;本发明通过3D深度学习模型, 捕捉了放射学特征, 保留了肺部病灶的空间位置和提取信息的...
靶向SOCS5-RBMX蛋白互作的辣椒素筛选方法及其应用
本发明属于分子生物学及药物筛选技术领域, 提供了靶向SOCS5‑RBMX蛋白互作的辣椒素筛选方法及其应用, 对SOCS5‑RBMX蛋白复合体结构进行分析, 确定SOCS5‑RBMX结合的结构域以及SOCS5‑RBMX结合的关键位点;通过对关...
一种水稻千粒重预测模型、与水稻千粒重有关的SNP分子标记及其构建方法和应用
本发明提供了一种水稻千粒重预测模型、与水稻千粒重有关的SNP分子标记及其构建方法和应用。水稻千粒重预测模型的构建方法:S1.获取杂交水稻样本数据, 根据水稻的千粒重信息和SNP分子标记构建数据集;S2.基于训练集数据, 使用Spearman...
一种胃癌生物标志物组合物及其筛选方法和应用
本发明公开了一种胃癌生物标志物组合物及其筛选方法和应用, 属于生物信息学技术领域;胃癌生物标志物组合物的筛选方法包括, 先收集胃癌患者和健康对照者血液标本, 进行高通量血浆蛋白质组学检测, 筛选出差异表达蛋白;利用英国生物样本库中的前瞻性队...
基于大型语言模型的多组学数据整合植物基因功能推断系统及方法
本发明公开了一种基于大型语言模型的多组学数据整合植物基因功能推断系统及方法, 该系统包括:数据获取与处理模块, 用于采集多组学数据, 将数据转换为统一的数据存储格式;存储检索模块, 基于增强检索生成框架构建, 用于通过统一索引对数据进行组织...
抗原抗体对接信心预测方法、系统、电子设备及存储介质
本发明公开了一种抗原抗体对接信心预测方法, 其包括以下步骤:(1)对于待对接的抗原和抗体, 将抗原所有亚基的序列和抗体轻链、抗体重链序列进行复合体蛋白质结构预测, 并对根据预测结果评价其抗原氨基酸残基i和抗体氨基酸残基j的Cα原子坐标误差e...
一种针对乳腺癌治疗的抗癌活性成分优化方法
本申请提供一种针对乳腺癌治疗的抗癌活性成分优化方法, 包括:根据初步的结构功能映射关系, 采用计算化学模拟方法, 分析抗癌活性成分对免疫系统细胞活性的潜在干扰路径, 确定免疫系统削弱的具体分子机制范围;根据协同作用评估结果, 通过分子对接算...
纳米材料和蛋白质互作预测方法、重要性度量方法、装置及介质
本发明涉及一种纳米材料和蛋白质互作预测方法、重要性度量方法、装置及介质, 其中, 预测方法包括:根据纳米材料理化属性、蛋白质来源参数、互作环境参数、复合体分离参数及蛋白质组学分析参数中至少一种或多种信息构建得到表格特征;获取蛋白质对应的氨基...
AI辅助的微生物基因编辑靶点预测方法及系统
本发明公开了AI辅助的微生物基因编辑靶点预测方法及系统, 包括以下具体步骤:第一步, 通过交叉注意力机制融合基因序列、蛋白质结构、代谢通量数据, 结合生成对抗网络优化预测精度;第二步, 通过按照拉曼光谱在线监测、CRISPR‑Cas9基因编...
基于Graph Transformer的多模态数据融合药物-靶点亲和力预测系统
本发明公开了一种基于Graph Transformer的多模态数据融合药物‑靶点亲和力预测系统, 包括数据预处理模块、图表征模块、文本表征模块、亲和力预测模块;数据预处理模块负责对化合物SMILES字符串及蛋白质ID进行解析处理, 提取化合...
筛选普通肝素治疗SIC的靶向人群的方法、装置及预测模型的建立方法
本公开提供一种筛选普通肝素治疗SIC的靶向人群的方法、装置及预测模型的建立方法。其中的筛选方法包括获取目标对象的第一指标集数据或第二指标集数据;将第一指标集数据或第二指标集数据输入预测模型;获取预测模型输出的预测数据, 预测数据包括目标对象...
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