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  • 本发明公开一种沙门氏菌低水活度耐受性预测方法和装置、系统、存储介质,包括:收集公开数据库内的沙门氏菌基因组数据,并记录来源的水活度信息;对基因组数据进行处理,形成数据矩阵;将数据矩阵进行去冗余操作;将数据矩阵进行划分;使用数据矩阵通过三种机...
  • 本发明提供一种工程藻株染色体多拷贝整合的筛选方法,属于生物信息学和合成生物学技术领域,本发明提出的工程藻株染色体多拷贝整合筛选方法首先通过显微图像分析获取形态特征,测定生长参数构建生长特征数据,分析光合作用特性构建光合数据,采用荧光原位杂交...
  • 本发明公开了一种生物逆合成途径的预测方法、预测装置和电子设备,涉及合成途径预测技术领域。本发明突破了传统方法中规则及模板的局限性,本发明采用无模板方法,以SMILES字符串为输入和输出,采用分子Transformer网络直接预测前体分子,可...
  • 本发明属于水生态安全技术领域,具体涉及一种评估水体中不动杆菌属健康风险的多维方法及其应用。该方法以不动杆菌属细菌作为风险评估对象,基于不动杆菌属宏基因组组装基因组草图,创新性整合病原风险、抗性组‑移动组‑毒力组信息及丰度数据,通过定性与定量...
  • 一种基于动态图集成学习的TCR‑表位结合预测方法,涉及TCR‑表位预测领域。本发明是为了解决现有TCR‑表位结合预测方法存在预测准确率低的问题。本发明包括:利用TCR β链CDR3序列、表位序列和标签组成数据集,将数据集划分为训练集和测试集...
  • 本发明提供了基于Transformer的物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法,属于生物信息学与人工智能交叉领域,方法包括:将预处理后的蛋白质序列输入预先训练的PTM预测模型,对预处理后的蛋白质序列进行嵌入处理,得到嵌入向量,对嵌入向量进行...
  • 本申请涉及生物领域,提供一种表型分析方法、电子设备及存储介质,所述方法包括:获取第一信息和多个第二信息;根据预设知识图谱获取第一信息的第一向量;根据预设知识图谱获取多个第二信息的第二向量;基于训练好的图神经网络,根据第一信息的第一向量和多个...
  • 一种寻找核酸检测设计区域的系统,包含一计算机处理器及一内存。计算机处理器实施包括以下步骤:输入两群基因体序列;利用机器学习算法训练分类器模型,配置以区别两群基因体序列,以获得多个特征序列片段;通过这些特征序列片段具有重叠的特性来延长成为多个...
  • 本申请提供了一种堆积发酵微生物的互作网络构建方法、装置、设备及介质,其中,堆积发酵微生物的互作网络构建方法包括:构建拟动态微分方程并解耦为多个独立的回归方程,其中,拟动态微分方程包括微生物的自然增长曲线和其他微生物对其影响的依赖增长曲线;使...
  • 本申请公开了全外显子组测序中位点检测局限性预测方法、装置、设备及介质,涉及生物学与精准医学高通量测序与变异检测技术领域,包括:基于目标变异位点的坐标信息从参考基因组中提取目标序列、原始序列,获取目标序列的多维度序列特征;确定各目标变异位点与...
  • 一种基于深度学习的T细胞受体序列生成方法及系统,它属于人工智能技术领域。本发明解决了现有技术缺乏针对特定抗原特异性的CDR3序列生成方法的问题。本发明通过带有深度自注意力网络的抗原特异性T细胞受体序列生成算法,实现对靶向结合特异性抗原的T细...
  • 本发明公开一种基于空间转录组的数据比对方法、设备及程序产品,所述方法包括 : 获取参考位置条码;获取空间转录测序数据,其中所述空间转录测序数据包括测序位置条码;基于各个所述参考位置条码及各个所述测序位置条码,将所述空间转录测序数据分成多组测...
  • 本发明公开了一种细胞miRNA调控网络的识别方法,涉及生物信息学技术领域,包括,基于多组学矩阵,通过扩散方程获取初始互作概率矩阵,采用图神经网络训练邻接矩阵,输出空间坐标的miRNA‑mRNA互作概率矩阵,并识别空间热点区域,生成热点坐标;...
  • 本发明提供一种基于CNN模型与可解释性学习的碱基对荧光强度分析方法,涉及生物信息学与计算生物学技术领域,该方法包括预处理数据:标准化碱基序列与荧光强度,断言统一序列长度;构建CNN模型:含双Conv1D层、MaxPooling1D及全连接层...
  • 本发明属于基因检测技术领域,具体为基于机器学习模型的判断荧光定量PCR信号Ct值与样本阴阳性的方法:对原始荧光PCR信号进行预处理,矫正跳变、拱形、低模板量及两段式异常信号;采用多参数Sigmoid函数对矫正后信号进行非线性拟合,得到光滑的...
  • 本发明提供一种动态权重与跨物种数据的时序建模、评分方法及基因组合,属于生物信息处理与数据建模技术领域。本申请的技术方案基于多源组数据,通过因果网络构建、时间序列插值和多阶段模型训练,筛选出与卒中过程密切相关的特征基因,构建动态权重函数,形成...
  • 癌细胞线粒体生物标志物及基于机器算法筛选的方法,当所述癌细胞为结直肠癌时,其线粒体生物标志物包括:OXCT1、CLPB、SLC25A12、MRPL51、SFXN1、GATM和TRMT10C基因。所述筛选的方法为:(1)将待筛选癌细胞的表达数...
  • 本发明涉及生物信息学、人工智能与植物基因组学交叉技术领域,公开一种植物单细胞基因表达预测方法、系统、设备及介质,植物单细胞基因表达预测模型通过门控交叉注意力机制实现DNA序列与染色质可及性信号的动态特征融合,有效解决传统单模态模型无法建模调...
  • 本发明提供了一种测量有性生殖动物全基因组水平核苷酸种系突变率的方法。所述方法包括以下步骤:(1)对待测物种进行基因组测序,得到待测物种的所有编码蛋白的序列;(2)构建待测物种的系统发育树;(3)获取待测物种与近缘种之间的分歧时间Tdiver...
  • 本发明公开了一种用于NGAL检测的适配体生物传感器及其筛选方法,包括:1)原始适配体的筛选;2)理性截短探索最小活性结构;3)计算机虚拟筛选;4)分子对接验证优化适配体。基于筛选的高亲和力适配体278A,构建的电化学传感器,包含聚亚甲基蓝修...
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