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一种基于氨基酸配对距离编码的蛋白质口袋特征化方法及其应用
本发明提供了一种高效、泛化性强的基于氨基酸配对距离编码的蛋白质口袋特征化方法及其应用。该方法通过计算蛋白质口袋区域内氨基酸对之间特定位置决定原子的距离,并将这些距离映射到预定义的平方距离范围内生成位置编码;将此位置编码与配体的分子指纹结合形...
用于个体预后基因识别的信息处理方法、装置、设备及介质
本申请公开了用于个体预后基因识别的信息处理方法、装置、设备及介质,涉及人工智能与生物医学交叉领域,应用于计算机装置,包括:从当前对象的截面基因测序样本中筛选出属于共享因果基因集合内的待定基因;集合中共享因果基因为对历史对象的截面基因与生存数...
基于多版本细胞注释结果的分析方法、装置及电子设备
本申请实施例公开了一种基于多版本细胞注释结果的分析方法、装置及电子设备,属于生物信息学技术领域以及数据处理领域。其中,方法包括:获取细胞注释结果;基于各个细胞的第一版注释结果和第二版注释结果,确定至少一个目标细胞群;根据所述目标细胞群与第一...
单细胞转录组数据的处理方法、装置、参数库及电子设备
本申请实施例公开了一种单细胞转录组数据的处理方法、装置、参数库及电子设备,所述方法包括:获取共用参数,所述共用参数包括基准特征基因集,以及原始特征与提取特征的基准关联关系,基准特征基因集包含多个特征基因,所述基准关联关系用于基因表达情况的降...
单样本拟时序分析方法、装置和电子设备
本申请实施例公开了一种单样本拟时序分析方法、装置和电子设备,所述方法包括:获取参考轨迹信息;获取待测样本中目标细胞在数据降维处理后的低维空间坐标;基于所述低维空间坐标和所述参考轨迹信息,确定目标细胞在所述参考轨迹上的映射位置;基于所述映射位...
细胞功能化阶段的分类方法、确定方法、装置及电子设备
本申请实施例公开了一种细胞功能化阶段的分类方法、确定方法、装置及电子设备。其中,分类方法包括:获取目标细胞簇中细胞的拟时序值,所述拟时序值基于拟时序分析而确定,所述目标细胞簇为细胞聚类后得到的细胞簇;根据所述目标细胞簇中细胞的拟时序值确定所...
一种甲基化与突变共检数据分析方法、装置、设备及介质
本申请公开了一种甲基化与突变共检数据分析方法、装置、设备及介质,涉及生物信息分析领领域,该方法包括:获取甲基化捕获位点集、甲基化信息及突变信息;根据所述甲基化信息计算所述甲基化捕获位点集中各甲基化位点的甲基化水平β值;根据所述甲基化水平β值...
一种基于深度学习的染色体外环状DNA序列识别方法
本发明公开了一种基于深度学习的染色体外环状DNA序列识别方法,涉及基因组生物信息技术领域,包括获取已知染色体外环状DNA序列作为正样本,并从参考基因组中按照等长度分布和染色体分布原则随机选取与任何已知染色体外环状DNA区域重叠度低于20%的...
一种包含结构变异的多品种山羊高密度基因型参考面板的构建方法及应用
本发明公开了一种包含结构变异的多品种山羊高密度基因型参考面板的构建方法及应用,属于基因型插补面板构建技术领域,所述构建方法包括以下步骤:数据处理、对原始数据进行质控、变异检测、结构变异基因分型、参考面板构建。本发明构建了全球多品种山羊高密度...
一种基于单一基因组注释文件的多细胞过程模型构建方法及系统
本发明涉及生物信息学及数字细胞模拟领域,尤其涉及一种基于单一基因组注释文件的基因组规模的多细胞过程模型构建方法及系统。该方法包括获取目标细胞的GenBank文件,解析GenBank文件并得到构建多细胞过程模型的生物实体信息,根据生物实体信息...
多组学稀有细胞注释方法、系统、计算机设备及介质
本发明提供了多组学稀有细胞注释方法、系统、计算机设备及介质,属于生物信息与计算机技术领域。该方法通过整合单细胞RNA测序与ATAC测序数据,构建包含细胞、基因及染色质可及性峰值节点的异质图;采用预融合与图融合两阶段策略,对多组学特征进行深度...
适用于特定应用场景的微生物宏基因组注释数据库及其构建方法、装置、系统和应用
本申请涉及微生物学技术领域,特别涉及适用于特定应用场景的微生物宏基因组注释数据库及其构建方法、装置、系统和应用。相对于传统技术,本申请提供了构建针对特定应用场景的微生物宏基因组注释数据库的方法,采用该构建方法能提升数据库对特定应用场景的种水...
一种基于四库分离的数据结构的基因线路设计系统
本发明公开一种基于四库分离的数据结构的基因线路设计系统,包括:元件库,用于存储可复用生物元件的标准化描述信息;调控关系类型库,用于定义生物元件之间的调控关系类型;调控实例库,用于存储调控逻辑实例;线路拓扑库,用于管理基因线路及其组成元件与调...
一种计算多粒径分布纳米胶体悬浮液粘度的方法
本发明公开了一种计算多粒径分布纳米胶体悬浮液粘度的方法,包括以下步骤:确定溶剂‑溶剂、溶剂‑溶质胶体、溶质胶体‑溶质胶体颗粒间相互作用的LJ势函数参数;根据LJ势函数参数生成初始模型;初始模型弛豫;稳态剪切模拟;计算粘度。本发明采用纯排斥L...
基于量子计算的材料分子的反应活性的确定方法及设备
本发明公开了一种基于量子计算的材料分子的反应活性的确定方法及设备,涉及基于量子计算的材料性能分析技术领域,方法包括:生成目标材料的分子的二次量子化形式的哈密顿量;构造成一个非零激发算符集合;获取初始拟设;初始化一个空的对称化拟设,遍历初始拟...
基于多尺度模拟的有机太阳能电池筛选方法、系统及设备
本发明公开了基于多尺度模拟的有机太阳能电池筛选方法、系统及设备,属于太阳能电池技术领域。该方法首先解析受体材料的电子结构特征,通过分子动力学模拟获得共混体系微观形貌;随后提取界面接触分子对并进行聚类分析,结合堆积比例与电荷转移能力系数计算综...
计算表面活性剂在油水界面的最小分子占有面积的方法
本发明提供了一种计算表面活性剂在油水界面的最小分子占有面积的方法,通过全原子分子动力学(MD)模拟,构建不同吸附量的油水界面模型,提出了以油层厚度稳定点和表面活性剂分子间径向分布函数RDF峰值饱和点作为双重判据的新方法。该方法有效剔除了总界...
剂量预测模型的训练方法、装置、设备及存储介质
本申请提供了一种剂量预测模型的训练方法、装置、设备及存储介质,属于人工智能技术领域。该方法通过训练基于目标成像图像确定剂量分布的剂量预测模型,这样在确定剂量分布时,通过该剂量预测模型就能够快速确定出剂量分布,而无需进行多次迭代计算,显然缩短...
构建变压器油中电弧产生气体的计算模型的方法及装置
一种构建变压器油中电弧产生气体的计算模型的方法及装置,该方法包括:基于电弧通道在故障过程中的温度分布特征,将电弧通道划分为不同的温度区域;基于热分解反应程度,简化变压器油中电弧产生气体过程;基于不同的温度区域和简化后的变压器油中电弧产生气体...
电解系统氧中氢瞬态预测方法、系统、介质及设备
一种质子交换膜电解系统氧中氢瞬态预测方法、系统、介质及设备,方法中,基于电解槽饱和扩散、电解槽过饱和扩散和气液分离器携氢回水机制对系统氧中氢的贡献,得到质子交换膜电解系统氧中氢预测的瞬态模型:测试并记录质子交换膜电解系统在不同压力、电流工况...
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