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恭喜南京农业大学;南京星罗智能科技有限公司黄君贤获国家专利权

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龙图腾网恭喜南京农业大学;南京星罗智能科技有限公司申请的专利一种蛋白质互作预测方法、系统、计算机设备和存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119132419B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411595666.6,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种蛋白质互作预测方法、系统、计算机设备和存储介质是由黄君贤;邓文聪;李星海;许文文;陈子欣;季呈明;朱留超;徐焕良;高健峰设计研发完成,并于2024-11-11向国家知识产权局提交的专利申请。

一种蛋白质互作预测方法、系统、计算机设备和存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种蛋白质互作预测方法、系统、计算机设备和存储介质,涉及生物技术领域,包括:输入层接收蛋白质特征编码,并重塑为二维向量;隐藏层通过卷积、池化、残差块和全连接层进行特征提取,通过ReLU函数引入非线性变换;输出层通过Sigmoid函数输出互作概率,并通过二元交叉熵损失函数进行优化;通过随机梯度下降优化器训练蛋白质互作预测模型。本发明提供的蛋白质互作预测方法使用UniPPI模型与传统特征提取不同组合方式,与传统机器学习模型以及深度学习模型对比,UniPPI模型具有更高的准确率、精度为以及F1得分。

本发明授权一种蛋白质互作预测方法、系统、计算机设备和存储介质在权利要求书中公布了:1.一种蛋白质互作预测模型,其特征在于,包括:输入层接收蛋白质特征编码,并重塑为二维向量;隐藏层通过卷积、池化、残差块和全连接层进行特征提取,通过ReLU函数引入非线性变换;输出层通过Sigmoid函数输出互作概率,并通过二元交叉熵损失函数进行优化;通过随机梯度下降优化器训练蛋白质互作预测模型;所述蛋白质特征编码数据为蛋白质经过蛋白质序列特征提取Unirep编码的1900维向量,将蛋白质A和蛋白质B分别输入网络;对维度为1900的一维向量进行数据重塑,将维度为1900*1的一维向量重塑成维度为38*50的二维向量数据;对数据重塑后的二维向量数据进行卷积操作;所述进行特征提取包括重塑后的二维向量通过一维卷积操作,使用的卷积核大小为7,步长为2,通道数为64;卷积操作后的特征图通过最大池化层进行处理,池化窗口大小为2,步长为2;池化后的特征图进入残差块,所述残差块包括主干部分和跳跃连接部分;所述主干部分由三个卷积层组成,卷积核大小分别为1,3,1,通道数分别为64,64,256;所述跳跃连接部分将输入与输出相加;经过残差块处理后的特征图被展平成一维向量,输入全连接层;所述全连接层数量为四,神经元个数分别为256,128,32,8;引入Dropout层,防止模型过拟合。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人南京农业大学;南京星罗智能科技有限公司,其通讯地址为:210095 江苏省南京市玄武区卫岗1号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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