恭喜洛兮医疗科技(河北)有限公司吴柏旭获国家专利权
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龙图腾网恭喜洛兮医疗科技(河北)有限公司申请的专利一种基于宏基因组测序数据的病原微生物鉴别分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118038989B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410198841.1,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基于宏基因组测序数据的病原微生物鉴别分析方法是由吴柏旭;胡亮;谢展设计研发完成,并于2024-02-22向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于宏基因组测序数据的病原微生物鉴别分析方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于宏基因组测序数据的病原微生物鉴别分析方法,该分析方法综合考虑了多个评价因素,如:种序列数、Unique序列数占比、k‑mer占比、相对丰度、临床致病等级、阴控检出程度和同批次检出情况等,确定出治病评估指标并计算出致病得分,然后通过致病得分和致病阈值之间的大小关系,进行致病微生物数据库、背景微生物数据库以及特殊关注数据库分类筛选,最后可以输出致病菌。本发明通过综合考虑多因素的治病评估指标,能够全面、定量的评估样本中各菌种的致病风险,更准确的判断一个菌种是否具有较高的致病潜力,有助于提高病原微生物的鉴别准确性和鉴定结果的可靠性。
本发明授权一种基于宏基因组测序数据的病原微生物鉴别分析方法在权利要求书中公布了:1.一种基于宏基因组测序数据的病原微生物鉴别分析方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤S1:对样本数据进行核酸提取、建库和测序,得到原始的病原宏基因组测序数据,对所述宏基因组测序数据进行数据处理,得到微生物测序数据;步骤S2:将所述微生物测序数据拆分成k-mer序列特征,进行物种鉴定,获得种序列数、Unique序列数、k-mer占比、样本-阴控率、历史阴控检出率和同批次临床样本占比,得到样本中菌种列表;步骤S3:将物种的致病菌评估指标设置为物种测序数据、物种临床致病性、阴控检出数据和同批次检出数据;步骤S4:根据步骤S3所述物种的致病菌评估指标,设置每项指标中的具体指标,计算相应权重;步骤S41:根据物种鉴定结果获得种序列数、Unique序列数、k-mer占比和相对丰度,确定物种测序数据的评价指标,计算物种测序数据的有效权重W1;步骤S42:根据临床关注情况、病原的致病程度以及文献报道情况,构建物种致病等级数据库,将所述致病等级数据库分为:I级、II级和III级,根据物种所在致病等级数据库的等级进行判定并获取物种的致病权重W2;步骤S43:计算阴控中物种的序列数和历史阴控检出率,获取物种的阴控检出权重W3;步骤S44:计算同批次样本的检出情况,包括同批次样本中检出序列数的最大值、最小值、平均数、中位数,计算物种的同批次检出权重W4;步骤S5:根据致病菌评估指标计算相应指标权重,最终计算致病得分Score;步骤S6:根据物种致病得分Score及致病等级进行分类筛选,输出致病病原;所述步骤S41中有效权重W1计算公式如下: 其中,有效权重W1计算公式中Wreads计算公式如下: 其中,Wreads计算公式中Unique序列数占比和k-mer占比的计算公式如下: 所述步骤S42中致病权重W2的判断方法如下:a.若获取物种属于致病等级微生物中I级,则致病权重W2为0.89-0.91,若为II级则致病权重W2为0.69-0.71,若为III级则致病权重W2为0.49-0.51,b.若获取物种属于常见背景定植微生物中I级,则致病权重W2为0.49-0.51,若为II级则致病权重W2为0.29-0.31,若为III级则致病权重W2权重为0.09-0.11;所述步骤S43中阴控检出权重W3计算公式如下:W3=Wt×样本-阴控率+Ws×1-总阴控检出率其中,样本-阴控率的计算公式如下: 其中,总阴控检出率的计算公式如下: 所述步骤S5中致病得分Score计算公式如下:
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